細(xì)胞系鑒定即通過STR(短串聯(lián)重復(fù))圖譜所建立細(xì)胞系的遺傳特征。一株細(xì)胞系的遺傳特征確立后,細(xì)胞系可以通過定期的檢測,以防止出現(xiàn)細(xì)胞系被誤認(rèn)或交叉污染的情況。
什么時候需細(xì)胞系鑒定?
當(dāng)建立或獲得一個新的細(xì)胞系時;
一個涉及到細(xì)胞試驗項目開始/結(jié)束時
在細(xì)胞凍存之前,或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2~3個月時
發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費(fèi)前
細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時
當(dāng)實驗室使用超過一種細(xì)胞系時,所有細(xì)胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能
如何進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?
細(xì)胞系鑒定目前主要依據(jù)國際身份認(rèn)證委員會的標(biāo)準(zhǔn)。依據(jù)該標(biāo)準(zhǔn),可以通過多重?zé)晒釶CR技術(shù),對人源8個STR位點(diǎn)以及1個性別決定位點(diǎn)進(jìn)行檢測。下表為這些位點(diǎn)的遺傳信息。
STR 基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。然后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。
采用DSMZ tools進(jìn)行細(xì)胞系比對,其中包含來自于ATCC, DSMZ, JCRB 和 RIKEN數(shù)據(jù)庫的2455個細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)。如果待檢測細(xì)胞未收錄于以上細(xì)胞庫或這是自行建立的新細(xì)胞系將無法進(jìn)行比對,用戶需根據(jù)細(xì)胞分型結(jié)果自行與其他數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。