簡(jiǎn)介

廣譜微生物及耐藥分析系統(tǒng)，是由杭州柏熠科技有限公司開(kāi)發(fā)的一款面向于微生物病原檢測(cè)一線工作人員的一鍵式易操作圖形界面分析系統(tǒng)。本分析系統(tǒng)同時(shí)支持Nanopore、Illumina、MGI、Ion torrent以及Pacbio等主流三代、二代高通量測(cè)序數(shù)據(jù)輸入，可實(shí)現(xiàn)快速簡(jiǎn)單分析，系統(tǒng)提供微生物物種組成及豐度信息鑒定、病原知識(shí)庫(kù)信息注釋及中文說(shuō)明、目標(biāo)物種測(cè)序數(shù)據(jù)提取、組裝與溯源、耐藥與毒力等分析功能，同時(shí)內(nèi)置超過(guò)40000種基因組數(shù)據(jù)及對(duì)應(yīng)病原注釋信息，幫助用戶進(jìn)行本地化病原微生物分析。

功能介紹

廣譜微生物及耐藥分析系統(tǒng)同時(shí)支持Nanopore、Pacbio等三代測(cè)序數(shù)據(jù)和Illumina、MGI、Ion torrent等二代測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析，具體功能如下：
1.支持用戶樣本臨床信息批量上傳和管理。
2.支持 fast5、fastq 、Pod5及fastq.gz等多種格式的測(cè)序數(shù)據(jù)。
3.支持混樣Nanopore測(cè)序數(shù)據(jù)拆分分析。
4.支持同一任務(wù)多個(gè)樣本同時(shí)分析。
5.支持從下機(jī)數(shù)據(jù)上傳到輸出結(jié)果報(bào)告一鍵式操作。
6.支持一鍵式生成 PDF 格式分析報(bào)告。
7.分析系統(tǒng)分析結(jié)果包含：物種分類、序列數(shù)統(tǒng)計(jì)、病原微生物注釋、目標(biāo)物種測(cè)序數(shù)據(jù)提取、耐藥元件分析（新建任務(wù)時(shí)可選，包含基因組覆蓋度、支持序列數(shù)、序列一致性、耐藥機(jī)理、對(duì)應(yīng)藥物、物種信息等）、毒力因子分析（新建任務(wù)時(shí)可選，包含基因組覆蓋度、支持序列數(shù)、序列一致性、毒力元件分析、致病機(jī)理、對(duì)應(yīng)物種信息等）。
8.支持分析數(shù)據(jù)及結(jié)果下載、圖表輸出、病例信息關(guān)聯(lián)等。
9.系統(tǒng)內(nèi)置微生物數(shù)據(jù)庫(kù)支持超過(guò) 40000 條物種信息條目。
10.分析系統(tǒng)能夠提供國(guó)家認(rèn)可的計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)登記證書或其他知識(shí)產(chǎn)權(quán)證明。