空間生物學(xué)（Spatial Biology）是一門涉及生物組織內(nèi)細(xì)胞和結(jié)構(gòu)的空間排布以及它們在三維空間中相互關(guān)系和相互作用的學(xué)科。這種研究方法探索了細(xì)胞和組織在空間中的布局、分布和相互聯(lián)系，以揭示生物體內(nèi)的復(fù)雜生物過程和功能。
空間生物學(xué)研究的重要工具包括多色成像技術(shù)、高分辨率顯微成像技術(shù)、3D圖像重建和分析軟件等。通過這些技術(shù)，研究者可以同時(shí)可視化和分析多種生物標(biāo)志物或分子在組織中的空間分布，進(jìn)而了解細(xì)胞類型的分布、細(xì)胞內(nèi)信號傳遞的網(wǎng)絡(luò)、細(xì)胞遷移和組織重塑等重要過程。
總而言之，空間生物學(xué)為我們提供了在細(xì)胞和組織層面深入研究生物系統(tǒng)的能力。通過空間分析和定量測量，我們能夠更好地理解生物體內(nèi)的結(jié)構(gòu)和功能，促進(jìn)疾病診斷和治療的進(jìn)步，并為藥物開發(fā)和治療策略的優(yōu)化提供新的見解。通過空間生物學(xué)的研究，我們可以揭示生物體內(nèi)的奧秘，并為解決重大生物醫(yī)學(xué)問題做出貢獻(xiàn)。
DMi8倒置熒光顯微鏡
DMi8倒置熒光顯微鏡是徠卡光學(xué)集大成者，擁有開放式的設(shè)計(jì)理念，光學(xué)擴(kuò)展模塊含有兩個新型無限遠(yuǎn)接口，三個相機(jī)接口以及激光防護(hù)工具，可以進(jìn)行各類型的熒光成像實(shí)驗(yàn)甚至是gaoduan的TIRF實(shí)驗(yàn)。
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方案特點(diǎn)
適配各類型的熒光實(shí)驗(yàn)。
提供其他空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程中的HE明場成像或免疫熒光成像，用來選擇感興趣的區(qū)域。
搭載Synapse 高級同步快速板消除了系統(tǒng)組件間的瓶頸，通過集成的實(shí)時(shí)控制器，直接與所有硬件組件、相機(jī)和外圍設(shè)備關(guān)聯(lián)從而大大加快了成像速度。
可以升級或集成第三方的組件，滿足各類型實(shí)驗(yàn)的需求，如TIRF。
通過DMi8獲取的各類腫瘤組織切片熒光成像
THUNDER高分辨率組織成像系統(tǒng)
THUNDER高分辨率組織成像技術(shù)是一種用于記錄高分辨率、多色、全景、三維成像的技術(shù)。通過THUNDER技術(shù)有效地消除厚組織切片的離焦信號，獲取高分辨率和深度成像的數(shù)據(jù)。高精度的電動對焦驅(qū)動，幫助實(shí)現(xiàn)精確的全景組織區(qū)域成像。搭配不同的熒光染色方法，可以實(shí)現(xiàn)10色以內(nèi)的熒光成像。
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THUNDER技術(shù)原理
THUNDER技術(shù)采用硬件加軟件的整體解決方案，在寬場成像原理下，通過計(jì)算清除（Computational Clearing）和自適應(yīng)反卷積（Adaptive Deconvolution）的方法，有效的減少離焦信號的干擾，保留焦平面的信號，從而提高對比度，改善圖像質(zhì)量并提供更多細(xì)節(jié)信息供進(jìn)一步分析。XY軸分辨率能達(dá)到136nm，Z軸分辨率能達(dá)到264nm，是一種廣泛受到學(xué)術(shù)界認(rèn)可的寬場高分辨率成像技術(shù)。
新一代Live THUNDER，通過實(shí)時(shí)THUNDER技術(shù)，在預(yù)覽的模式下，實(shí)現(xiàn)高分辨率條件下的視野尋找，提高實(shí)驗(yàn)工作效率。
成年雄性大鼠大腦切片，70μm；
綠色：NeuN神經(jīng)元，紅色：星形膠質(zhì)細(xì)胞，藍(lán)色：細(xì)胞核；
數(shù)據(jù)來自廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院
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方案特點(diǎn)
更高的分辨率，THUNDER技術(shù)實(shí)現(xiàn)XY 136nm，Z 264nm，更細(xì)節(jié)的細(xì)胞生物學(xué)信息。
更深的成像深度，成像深度可達(dá)150μm，更加適配厚樣本成像，如腦組織、類器官等。
更多的顏色（生物標(biāo)記物），可以實(shí)現(xiàn)10色以內(nèi)的熒光成像，獲得更豐富的空間信息。
更清晰的成像模式，全景組織成像時(shí)，可以在每個視野實(shí)時(shí)聚焦，確保每個區(qū)域成像的清晰度。
可升級THUNDER-LMD（激光顯微切割）一體機(jī)，從高分辨率成像，到高精確切割，提取純凈、單一的細(xì)胞/組織。
神經(jīng)元深度成像
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應(yīng)用案例
腫瘤免疫微環(huán)境（TIME）在濾泡性淋巴瘤的發(fā)生發(fā)展過程中起著至關(guān)重要的作用。
人淋巴瘤樣本。panel中所包含指標(biāo)為Ki67（增殖）、CD3（免疫細(xì)胞）、CD4（輔助T細(xì)胞）、CD8（殺傷性T細(xì)胞）、FOXP3（調(diào)節(jié)T細(xì)胞）、CD163（M2巨噬細(xì)胞）。
TSA試劑盒來自覽微生物科技（上海）有限公司
深度探究微環(huán)境內(nèi)細(xì)胞分布與空間關(guān)系，通過Aivia分析軟件，將淋巴瘤組織進(jìn)行細(xì)胞自動識別與分類分析（不同的顏色代表不同的細(xì)胞類型）。
常規(guī)寬場成像（左）、THUNDER高分辨率寬場成像（中）、Aivia細(xì)胞分割與圈選（右）THUNDER高分辨率帶來高精確度的細(xì)胞識別與分析。
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科研成果發(fā)表（部分）
1.Serpine1 mRNA confers mesenchymal characteristics to the cell and promotes CD8+ T cells exclusion from colon adenocarcinomas. Polo-Generelo, S., Rodríguez-Mateo, C., Torres, B. et al. Cell Death Discov. (2024).
2.Protein tyrosine phosphatase PTPRO represses lung adenocarcinoma progression by inducing mitochondria-dependent apoptosis and restraining tumor metastasis. Dai, Y., Shi, S., Liu, H. et al. Cell Death Dis (2024).
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