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Trizol疑難解答
閱讀:5027 發(fā)布時(shí)間:2010-12-9般注意事項(xiàng):
- Trizol試劑含有苯酚,具有毒性和刺激性,注意操作。如皮膚接觸Trizol,請(qǐng)立即用大量去垢劑和水沖洗,如仍有不適,請(qǐng)聽取醫(yī)生意見。
- RNase污染的主要來源是操作過程中手和空氣中的浮沉,注意隨時(shí)勤換手套,樣品盡可能蓋嚴(yán);盡量不要對(duì)著RNA樣品呼氣或說話。用0.01%的DEPC水浸泡過夜,然后滅菌,烘干。溶液需用DEPC水配制。加0.01%(體積比) diethyl- pyrocarbonate(DEPC)至重或MiliQ級(jí)水中,處理過夜,滅菌即成DEPC水。
- 細(xì)胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不*會(huì)降低zui后得率,因?yàn)橐徊糠諶NA會(huì)殘留在未裂解的細(xì)胞中。細(xì)胞裂解之后要看不見顆粒狀物質(zhì)(結(jié)締組織和骨除外)。在清洗和裂解細(xì)胞時(shí)在低溫下操作,防止在操作過程中釋放的內(nèi)源RNase降解了RNA。
- 酵母和一些細(xì)菌由于細(xì)胞壁的特殊結(jié)構(gòu),可以加入TRNzol試劑同時(shí)加入無RNase的玻璃珠并劇烈振蕩,使細(xì)胞裂解充分。
- TRNzol試劑也適合于樣品和組織裂解液的貯存,這尤其適合于同時(shí)處理樣品較多或操作較為費(fèi)時(shí)時(shí)。
一:低得率
A:樣品裂解或勻漿處理不*;勻漿不*時(shí),基因組DNA分子仍然很大,溶液粘稠。變性的蛋白質(zhì)和基因組DNA一起形成絮狀凝集物容易包裹RNA,使之不能有效地釋放到溶液中。
B:沉淀不*:從小于≤2×105動(dòng)物細(xì)胞、≤2 mg動(dòng)物組織或RNA含量低的樣品中提取RNA時(shí),勻漿體積太大,將造成RNA過分稀釋而不能有效地沉淀下來。當(dāng)從這樣的樣品中提取RNA時(shí),應(yīng)按比例減少抽提溶液,異丙醇沉淀后延長冰浴和離心時(shí)間,具體實(shí)驗(yàn)參數(shù)見相應(yīng)操作步驟。加入少量糖原可提高RNA產(chǎn)量又不影響RT-PCR。
C:zui后得到的RNA沉淀未*溶解
二:A260/A280<1.65
A.檢測吸光度時(shí),RNA樣品不是溶于TE,而是溶于水。低離子濃度和低pH條件下,A280值會(huì)較高。
B.樣品勻漿時(shí)加的試劑量太少。
C.勻漿后樣品未在室溫放置5分鐘。
D.水相中混有有機(jī)相。
E.zui后得到的RNA沉淀未*溶解。
三:RNA降解
A.組織取出后沒有馬上處理或冷凍;細(xì)胞生長過度
B.樣品或提取的RNA沉淀保存于-5--20℃,未在-60--70℃保存。
C.細(xì)胞在胰酶處理時(shí)被破壞或勻漿中組織或細(xì)胞成分未*分散,樣品中RNA酶未*滅活。。
D.溶液或離心管未經(jīng)RNase去除處理。Tip頭、離心管、貯存管受RNA酶污染。
E.電泳時(shí)使用的甲酰氨pH低于3.5
F.樣品存放時(shí)間太長,裂解液中b-ME不足;
四:DNA污染
A:操作不規(guī)范
B.樣品中含有組織溶劑(如乙醇,DMSO等),強(qiáng)緩沖液或堿性
溶液。
C.樣品勻漿時(shí)加的試劑體積太少或樣品量太多,污染有機(jī)物和中
間相。
D:在轉(zhuǎn)錄特別活躍的細(xì)胞破碎過程中,由于某種原因一部分mRNA與DNA、蛋白質(zhì)形成了聚合體的形式.Trizol不能分離這種聚合體,從而造成了在所提取的RNA中有少量基因組DNA的污染.在這種情況下可以用無RNAse的DNAse處理,Trizol再次抽提或蛋白酶K消化后再用酸性苯酚抽提。
五:蛋白和多糖污染
離心去上清后得到的RNA沉淀經(jīng)以下操作應(yīng)可去除這些污染:在上一步中,每使用1ml Trizol,在水相中加0.25ml異丙醇和0.25ml高鹽溶液(0.8M檸檬酸鈉和1.2 NaCl)?;旌希x心,然后按照操作進(jìn)行。這種方法可使蛋白多糖和多糖留在溶液中,而沉淀出純RNA。從植物中提取RNA時(shí),應(yīng)在勻漿后離心,并加上以上操作步驟。