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中國科學(xué)家PNAS發(fā)布辣椒全基因組測序
閱讀:351 發(fā)布時間:2014-3-7辣椒(Capsicum annuum)是一種重要的經(jīng)濟作物,它在滿足人們口腹之欲的同時,還是世界上廣為使用的藥物。辣椒富含維生素和營養(yǎng),可以用來生產(chǎn)許多藥物、天然染色劑和化妝品。
為了更好的理解辣椒屬的進(jìn)化、馴化和特化,四川農(nóng)業(yè)大學(xué)玉米研究所、遵義農(nóng)科院辣椒研究所、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院、華大基因等機構(gòu)的研究人員對栽培辣椒及其野生祖先進(jìn)行了基因組測序。文章于三月三日發(fā)表在美國國家科學(xué)院院刊PNAS雜志上。
研究人員獲得了3.48Gb的基因組草圖,并對其中79%的基因進(jìn)行了染色體定位,獲得了高密度的遺傳圖譜。研究顯示,反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座元件的快速擴增,使辣椒基因組與其它茄科植物的基因組相比發(fā)生了擴張。在辣椒基因組中,約81%都是重復(fù)性序列。
研究人員比較了栽培辣椒Zunla-1 (C. annuum L.)及其野生祖先 Chiltepin (C. annuum var. glabriusculum)的基因組,發(fā)現(xiàn)了人工選擇的分子足跡,找到了一系列候選馴化基因。研究指出,串聯(lián)重復(fù)基因的劑量補償效應(yīng)可能為辣椒賦予了辣味上的多樣性。
這項研究不僅為辣椒基因組和茄科基因組的進(jìn)化研究提供了關(guān)鍵信息,還有助于人們開展更有效的辣椒育種項目。(此前,另一個研究團隊也發(fā)布了辣椒的基因組測序成果,詳見:Science新聞,辣椒基因組測序完成)