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當(dāng)前位置:天津譜祥偉業(yè)科技有限公司>>技術(shù)文章>>色譜手動積分門道多,不懂可不行...
說到色譜,積分可是大事,今天我們就講講積分的故事…
在我們要對色譜峰進行積分計算之前,得先了解幾個概念:
定義
1、積分
指在信號中確定峰并計算其大小,積分包括以下操作及步驟:識別、校正、定量。
2、積分事件的參數(shù)控制
對于某個信號進行積分時,軟件將識別每個峰的開始和結(jié)束時間,并用豎線標記這些點,尋找每個峰的峰頂點,確定保留時間/遷移時間,建立基線,以及計算每個峰的峰面積、峰高和峰寬。這些過程積分事件的參數(shù)控制。
3、自動積分
自動積分功能為設(shè)置初始事件提供開始點。自動積分功能設(shè)置以下參數(shù):初始斜率靈敏度(閾值)、初始峰高、初始峰寬、初始小峰面積。
4、手動積分
此類型的積分允許對選定的峰或峰組進行積分,在的手動積分范圍內(nèi),將忽略此軟件的事件積分(初始小峰面積除外)。如果手動積分出來的一個或多個峰低于小峰面積閾值,則此積分將被廢棄。手動積分時間使用時間值。它們不會為信號漂移作調(diào)整。
在報告中,手動積分提供以下功能:
§ 劃基線:為一個峰或一組峰劃基線的位置;
§ 負峰:何時將基線以下的面積當(dāng)作負峰處理;
§ 切線撇去:計算從主峰切線撇去的峰面積;
§ 分裂峰:用垂線分裂峰的點;
§刪除峰:從積分結(jié)果中刪除一個或多個峰。
積分參數(shù)
自動積分主要是修改以下4個積分參數(shù)實現(xiàn)的,具體如下:
1、斜率靈敏度(Slope Sensitivity)
也稱閾值,指設(shè)置信號斜率的值,該斜率用于識別積分過程中峰的起點和終點。如何信號斜率大于“斜率靈敏度”值,將建立峰起點,如果信號斜率降到“斜率靈敏度”以下,將建立峰止點。
設(shè)置值越低,峰響應(yīng)越靈敏,當(dāng)然,不同品牌的儀器對設(shè)置值的響應(yīng)程度會有所區(qū)別。
2、峰寬值(Peak Width)
用于控制積分器的選擇性以區(qū)分峰與基線噪音。如果設(shè)置的初始峰寬太小,則可能將噪音當(dāng)作峰。如果寬峰與窄峰混在一起,可以選用運行時間編程事件設(shè)定特定的峰寬。
3、小峰面積值(Area Reject)
根據(jù)峰面積來設(shè)置小于目標峰面積的峰將不被積分也不會報告;
4、小峰高(Height Reject)
小目標峰的高度,任何小于小峰高的峰將不被積分及報告。
了解完概念,咱們說說如何進行積分計算?首先看一張圖:我在峰底下畫根線,這個線就是告訴軟件那個部分需要計入峰面積的計算。
我們說過,美圖軟件簡單好用容易上手,所以,大部分時候,我們的美圖軟件能自動幫我們畫線。
這就是說,我們的軟件能夠比較準確的指認出色譜峰,但是有些時候,軟件會犯傻,出現(xiàn)一些神作…
各位可能不知道,去韓國整容,大夫是要要先打草稿的,這一條條的線,就是草稿,草稿打的好,以后效果才好,所以,別小看這一堆線,這是成功的關(guān)鍵。
計算的效果如何,就全看這根線畫得準不準了,那么,這個線到底該怎么畫…
積分計算
首先,我們得知道到底怎么把一個“峰”認為是一個峰:
其實軟件看判斷峰是不是峰是有“套路”的,有一些指標的。靠一些數(shù)字閾值來確認的。各家軟件里一定都有,而且對各個參數(shù)的指認也有不同的算法和單位,都說出來太亂,而且估計大家也懶的看,總結(jié)了一下,軟件看峰的標準就是:
太陡了不積,太緩了也不積
太小了不積,太大了也不積
太矮了不積,太高了也不積
太胖了不積,太瘦了也不積
不讓積的時候,堅決不積
知道了這些套路,還怕啥子積分,當(dāng)然,這還有什么其他用呢?
如果峰長得太丑,會不會給積分呢?當(dāng)然不會,軟件不認啊,當(dāng)然也不給積分了。
那如果,長得特別丑的峰被積分了,怎么辦?嘿嘿,你懂的,暗箱操作,改規(guī)矩唄...
修改規(guī)則這個事兒,在咱們的軟件里,叫做調(diào)整積分參數(shù),目的就是讓咱們把那根線劃得剛剛好,讓想積分的峰積分上,這是一個很有技巧的事情,尤其是對于一些長相奇葩的峰,這條線怎么劃,就更是有學(xué)問了。對于這樣不太合格的峰,如果我們能調(diào)節(jié)參數(shù)讓積分線盡量能吧這些峰畫出來,那也就能勉強擠入選擇范圍了,這種修改積分規(guī)格的情況叫做,手動干預(yù),當(dāng)然,軟件越,劃線的手法也越厲害,比如上面的圖和下面的圖其實都是同一種情況,但是軟件如果厲害點,就會把直的積分線掰彎,讓面積計算更準點。
但可是,很多時候,我們不管怎么調(diào),都找不出一個合適的組合將特別丑的峰積分,這個時候,該怎么辦?這個時候,我們就該用更深的套路了,那個特別丑的峰必須積分…強行在那個特別丑的峰上劃條線…這個行為,叫做“手動積分”,這是積分界的大殺器,它說積誰就積誰,就是這么霸氣。
雖然霸氣,但是麻煩也很多…尤其在法規(guī)實驗室這種監(jiān)管森嚴的地界,一旦出現(xiàn)修改規(guī)則的事兒,要是沒有能讓人信服的理由,那事情可就鬧大了。
而管這個事的就是大名鼎鼎的FDA。
積分步驟
在軟件自動積分完成以后,如果根據(jù)我們數(shù)據(jù)處理方法中預(yù)設(shè)的積分參數(shù)得到的計算機過一切正常的話,皆大歡喜,分析完成出報告
如果,你發(fā)現(xiàn)了一點小問題,比如有些峰沒有被正確的積分出來,這個時候,我們就要走到第二個十字路口了,這些峰,到底是積還是不積…
到底該走哪邊,主要還是看峰沒有被正確積分的原因,
由于分離度或靈敏度低導(dǎo)致的峰沒有正確指認,
基線漂移導(dǎo)致的誤判,
保留時間微小變化導(dǎo)致的誤判,
峰型變化比如拖尾導(dǎo)致的誤判等。。。
當(dāng)然,這些都是可能原因之一,具體什么原因,這需要各位根據(jù)自己實驗室的要求和方法的具體情況具體判斷,但是,有些情況是禁止的:
那就是好好的一個峰,但是非要亂劃線以使它能夠滿足系統(tǒng)適應(yīng)性或者測試結(jié)果標準要求的情況。基本我們的數(shù)據(jù)的命運就決定了,被淘汰的,就要啟動實驗室調(diào)查了,而有些峰,還有一次機會被重新審查,進入手動積分階段,不過,到底是小改干預(yù)一下,還是要玩大的顛覆規(guī)則,那就要看峰自己的造化了
如果峰的毛病不大,只是暫時發(fā)揮失常,我們只要稍微調(diào)整下積分參數(shù)的設(shè)置就可以讓他們重回正常的積分狀態(tài),那我們只需進行手動干預(yù)就可以
比如由于保留保留時間微小漂移的峰,我們可以適當(dāng)調(diào)整時間窗口,或者是由于靈敏度問題的峰,我們可以適當(dāng)調(diào)整峰高接受的閾值,他們就可以被正確積分。
但是有些峰,走型比較嚴重,比如比較嚴重的拖尾或者基線漂移,實在是超出了軟件自己解決問題的能力,那這個時候,我們只能親自操刀來劃那條線了,這個事情很重要,必須要親歷親為,小心謹慎。
這遍套路,聽著講下來,好像挺流暢,不過,好腦子不如爛筆頭,在實驗室里,一定要把套路記錄下來,形成自己門派的獨門秘籍,這個獨門秘籍,就是SOP,關(guān)于手動積分,如何判斷,如何使用,自己的實驗室里一定要結(jié)合自己的標準和情況制定一個SOP,這個SOP里一定要說明:
重新積分的原因,這是針對個十字路口的
允許重新積分的情況,這是針對第二個十字路口的,任何不滿足的這些情況的數(shù)據(jù),不應(yīng)該重新積分,而應(yīng)該啟動實驗室調(diào)查。
重新積分使用的原理和方法
SOP猶如武功秘籍,不過接下來,要想練功,使用這個SOP,還得遵守一些江湖規(guī)矩:
重新積分的操作要經(jīng)過相關(guān)權(quán)限人員管理者授權(quán)后才能進行,并且需要具有相應(yīng)權(quán)限的人員進行操作,所以,進行手動積分操刀的,一定得是行家。
所有偏離SOP的偏差都應(yīng)該在分析報告中討論,這叫亡羊補牢,避免下次走上同一條不歸路。
色譜積分參數(shù)和重新積分的情況,初始和終積分數(shù)據(jù)都應(yīng)該在實驗室進行記錄并且經(jīng)過復(fù)核,歸檔保存,這是為了留下證據(jù),防止以后死無對證。
這么一看,要想搞定手動積分,還真是要花上不少心思,所以,建議就是:
與其潛心鉆研怎么搞好手動積分,寫好SOP,遵守規(guī)章制度,不如當(dāng)初把方法做好一點,把可能分不好的峰都分開,峰型不好的給調(diào)好,選好合適的梯度和檢測波長減小基線漂移等等,這樣可以達到一勞永逸的效果。
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