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CellASIC® ONIX微流控芯片,讓細(xì)菌“無處可逃”
本文在研究中采用了CellASIC® ONIX系列微流控芯片系統(tǒng)。
細(xì)菌耐藥性是什么?
細(xì)菌耐藥性在全球范圍內(nèi)的傳播是公共衛(wèi)生領(lǐng)域最為關(guān)注的問題之一,也是微生物學(xué)研究的重點(diǎn)。細(xì)菌耐藥性(Resistance to Drug )又稱抗藥性,指細(xì)菌對于抗菌藥物作用的耐受性,耐藥性一旦產(chǎn)生,抗生素的作用就明顯下降。
對耐藥共生菌、環(huán)境菌和致病菌的分析顯示,對目前臨床治療中使用的大多數(shù)抗生素都有耐藥性細(xì)菌。
耐藥性是如何獲得的?
耐藥性根據(jù)其發(fā)生原因可分為獲得耐藥性和天然耐藥性。自然界中的病原體,如細(xì)菌的某一株可存在天然耐藥質(zhì)粒。當(dāng)長期應(yīng)用抗生素時(shí),占多數(shù)的敏感菌株不斷被殺滅,耐藥菌株就大量繁殖,代替敏感菌株,而使細(xì)菌對該種藥物的耐藥率不斷升高。
除此之外,耐藥性還可以在細(xì)菌之間傳遞,這種是獲得耐藥性。Tatum和Lederberg發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌間遺傳物質(zhì)交流的現(xiàn)象,耐藥性的傳播主要是通過水平轉(zhuǎn)移具有耐藥性的質(zhì)粒獲得。質(zhì)粒是一類存在于細(xì)菌的遺傳物質(zhì)DNA之外,能自主復(fù)制的環(huán)狀DNA分子。質(zhì)粒的傳遞可以借助熒光成像的方法來進(jìn)行觀察。
利用熒光成像觀察細(xì)菌間質(zhì)粒傳遞
2019年法國里昂大學(xué)分子微生物學(xué)與結(jié)構(gòu)生物化學(xué)中心發(fā)表Science文章,Role of AcrAB-TolC multidrug efflux pump in drug-resistance acquisition by plasmid transfer,構(gòu)建了細(xì)菌之間抗藥質(zhì)粒傳遞的模型,進(jìn)行了相關(guān)研究。
為了更清楚的觀察到細(xì)菌間耐藥質(zhì)粒的傳遞,該文章構(gòu)建了細(xì)菌間AcrAB-TolC抗四環(huán)素質(zhì)粒傳遞的熒光模型:模型采用E.coli.細(xì)菌。
分別是表達(dá)紅色熒光質(zhì)粒的供體細(xì)菌和表達(dá)綠色熒光質(zhì)粒的受體細(xì)菌。當(dāng)發(fā)生耐藥質(zhì)粒轉(zhuǎn)移時(shí),在受體細(xì)菌中會(huì)產(chǎn)生紅色和綠色熒光的puncta。通過計(jì)數(shù)puncta的數(shù)量就可以對耐藥轉(zhuǎn)移能力的大小進(jìn)行量化。
熒光細(xì)菌構(gòu)建完畢后就可以上到顯微鏡上進(jìn)行觀察,細(xì)菌的觀察和常規(guī)的貼壁細(xì)胞的觀察有著很大的不同,細(xì)菌本身比細(xì)胞的體積小很多,必須上到高倍物鏡,從而對觀察板的介質(zhì)的光透過率和平整度有很高的要求。此外,細(xì)菌本身在培養(yǎng)液中是懸浮生長,和懸浮細(xì)胞類似,會(huì)飄來飄去,想要固定觀察某一個(gè)細(xì)菌是很困難的。
因此,研究者需要一套特制的觀察系統(tǒng)。
本文在研究中采用了CellASIC® ONIX系列微流控芯片系統(tǒng)。這套系統(tǒng)的溫度、氣體控制幫助細(xì)菌的觀察維持在37 °C ,持續(xù)4-6h;同時(shí)借助其梯度高度的微孔板,保證了細(xì)菌不會(huì)上下左右的飄動(dòng),使得追蹤特定細(xì)菌的連續(xù)變化成為可能。
170um的高透底面也可以支持高倍物鏡的放大,puncta清晰可見,經(jīng)過分析后可以輕松獲得基于時(shí)間軸的耐藥性變化趨勢:
CellASIC® ONIX系列整套系統(tǒng)如下:
CAX2-S0000
CellASIC ONIX2 Microfluidic System