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1.目的
學(xué)會用酶切法或PCR法篩選重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化成功的克隆菌。
2.原理
利用轉(zhuǎn)化后宿主菌所獲得的抗菌素抗性性狀篩選出獲得質(zhì)粒的菌落克隆。再從這些菌落中鑒定出質(zhì)粒上帶有外源基因插入片斷的克隆菌落。
3.器材
旋渦混合器,小鑷子,微量移液取樣器,移液器吸頭,1.5ml 微量離心管,雙面微量離心管架,干式恒溫氣浴(或恒溫水浴鍋),制冰機(jī),恒溫?fù)u床,超凈工作臺,酒精燈,無菌牙簽,搖菌管。
4.試劑
LB培養(yǎng)基(加抗菌素),PCR用試劑,引物,質(zhì)粒提取用試劑,酶切需要的限制性內(nèi)且酶及其緩沖液,65%甘油(65%甘油,0.1mol/L MgSO4,0.025mol/L Tris-Cl pH8.0)。
5.實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備
無菌dd water,1.5ml離心管裝入鋁制飯盒(滅菌)、移液器吸頭裝入相應(yīng)的吸頭盒(滅菌);牙簽(滅菌),搖菌管(滅菌),100mg/mL氨芐青霉素。
6.操作步驟
方法一:酶切鑒定
(1)在超凈工作臺中取3支無菌搖菌管,各加入3mL LB(含50mg/mL氨芐青霉素),用記號筆寫好編號。
(2)在超凈工作臺中將70%乙醇浸泡的小鑷子頭用酒精燈烤過,鑷取一支無菌牙簽。用牙簽的尖部接觸轉(zhuǎn)化的平板培養(yǎng)基上的一個白色菌落,然后將牙簽放入盛有3mL LB(含50mg/mL氨芐青霉素)的搖菌管中。用此法隨機(jī)取3個白色菌落,分別裝入3個搖菌管中。
(3)37℃搖菌過后,用堿裂解法分別提取質(zhì)粒。搖菌管中的剩余菌液保留在4℃冰箱中。
(4)將提取到的3管質(zhì)粒樣品與空質(zhì)粒同時電泳,根據(jù)分子量判斷和選區(qū)有插入片段的質(zhì)粒,然后可用酶切、與目的片段一同電泳來鑒定其上的外源插入片斷大小是否與預(yù)期相符。
(5)將經(jīng)過鑒定判斷為正確的質(zhì)粒保存。按照編號找到冰箱中原菌液。根據(jù)需要進(jìn)行放大培養(yǎng)提取其質(zhì)?;蜻M(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),或取500mL菌液與500mL 65%甘油混合后-80℃保存。
(6)在被細(xì)菌污染的桌面上噴灑70%乙醇,擦干桌面,寫實(shí)驗(yàn)報(bào)告。
方法二:快速PCR篩選法
(1)在轉(zhuǎn)化的平板培養(yǎng)基上隨機(jī)選取3個邊緣清晰的白色菌落,并用記號筆在其所在的培養(yǎng)皿底部玻璃背面畫圈做標(biāo)記編號。
(2)在0.2ml PCR 微量離心管中配制25μl反應(yīng)體系。
dd water 16μl
10×PCR buffer(不含MgCl2) 2.5μl
25mM MgCl2 1.5μl
2.5mmol/L dNTP 2μl(每種dNTP終濃度0.2mM)
10μmol/L Primer1 1μl(12.5-25pmoles)
10μmol/L primer2 1μl(12.5-25pmoles)
Taq酶 0.5μl(1.5u)
總體積 25μl
模板質(zhì)粒: 用小tip頭輕輕粘一下選中的白色菌落,伸入PCR混合液中洗一洗
(2)根據(jù)廠商的操作手冊設(shè)置PCR儀的循環(huán)程序(本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)設(shè)置為WZ):
① 94℃ 5min
② 94℃ 1min
③ 60℃ 1min
④ 72℃ 1min50s
⑤ goto② 29 times
⑥ 72℃ 10min
(2)PCR結(jié)束后,取10μl產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳(與原始插入片斷同時比對)。觀察膠上是否有預(yù)計(jì)的主要產(chǎn)物帶。
(3)按照編號找到培養(yǎng)皿中的原菌斑。根據(jù)需要進(jìn)行放大培養(yǎng)提取其質(zhì)粒
(4)提取到的質(zhì)粒與原先的空載體(或已知分子量的質(zhì)粒)再對比電泳,用酶切以進(jìn)一步確認(rèn)。