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DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):脈沖場凝膠電泳實(shí)驗(yàn)
標(biāo)簽:脈沖場凝膠脈沖場凝膠電泳是在兩個(gè)不同方向的電場周期性交替進(jìn)行的,可分離長至5Mb的DNA分子,其工作原理是DNA分子在交替變換方向的電場中作出反應(yīng)所需的時(shí)間取決于它的大小。較小的分子重新定向較快,因而在凝膠中移動(dòng)也較快,于是不同大小的分子被成功分離。實(shí)驗(yàn)方法倒轉(zhuǎn)電場實(shí)驗(yàn)材料DNA試劑、試劑盒GTBETBE瓊脂糖儀器、耗材電泳儀實(shí)驗(yàn)步驟1.制備用于水平電泳的1%瓊脂糖凝膠,放入電泳裝置,其上覆蓋以2~3mm的GTBE或TBE緩沖液。2.加入液體樣品。裝好蠕動(dòng)泵用于電泳緩沖液循環(huán)。3.對(duì)于微型 -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):細(xì)菌中制備基因組DNA實(shí)驗(yàn)
標(biāo)簽:細(xì)菌基因DNA真核生物的一切有核細(xì)胞(包括培養(yǎng)細(xì)胞)都能用來制備基因組DNA。真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細(xì)胞核內(nèi),因此,制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質(zhì)、脂類和糖類等分離,又要保持DNA分子的完整。實(shí)驗(yàn)方法小量制備氯化銫法實(shí)驗(yàn)方法原理提取DNA的一般過程是將分散好的組織細(xì)胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質(zhì),再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質(zhì),得到的DNA溶液經(jīng)乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。實(shí)驗(yàn)材料細(xì)菌試劑、試劑盒TE氯化銫溴化乙錠NaCl乙醇C -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):植物組織制備基因組DNA實(shí)驗(yàn)
標(biāo)簽:植物組織基因DNA利用基因組DNA較長的特性,可以將其與細(xì)胞器或質(zhì)粒等小分子DNA分離。在提取過程中,染色體會(huì)發(fā)生機(jī)械斷裂,產(chǎn)生大小不同的片段,因此分離基因組DNA時(shí)應(yīng)盡量在溫和的條件下操作,如盡量減少酚/氯仿抽提、混勻過程要輕緩,以保證得到較長的DNA。實(shí)驗(yàn)方法氯化銫法CTAB法實(shí)驗(yàn)方法原理加入一定量的異丙醇或乙醇,基因組的大分子DNA即沉淀形成纖維狀絮團(tuán)飄浮其中,可用玻棒將其取出,而小分子DNA則只形成顆粒狀沉淀附于壁上及底部,從而達(dá)到提取的目的。實(shí)驗(yàn)材料植物組織試劑、試劑盒抽提緩沖液 -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):哺乳動(dòng)物中制備基因組DNA實(shí)驗(yàn)
標(biāo)簽:哺乳動(dòng)物基因DNA在DNA提取過程中應(yīng)盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素,以保證DNA的完整性,為后續(xù)的實(shí)驗(yàn)打下基礎(chǔ)。一般真核細(xì)胞基因組DNA有107-9bp,可以從新鮮組織、培養(yǎng)細(xì)胞或低溫保存的組織細(xì)胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等試劑存在下用蛋白酶K消化細(xì)胞,隨后用酚抽提而實(shí)現(xiàn)的。實(shí)驗(yàn)方法制備DNA實(shí)驗(yàn)材料動(dòng)物組織試劑、試劑盒PBS乙酸銨乙醇酚氯仿異戊醇TE儀器、耗材離心機(jī)搖床研缽實(shí)驗(yàn)步驟1.切下組織并立即剪成小塊,置于液氮中凍結(jié)。2.將200mg~1g的組織用預(yù)冷的研缽和研 -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):大腸桿菌質(zhì)粒DNA 的提?。▔A裂解法)
此方法適用于小量質(zhì)粒DNA的提取提取的質(zhì)粒DNA可直接用于酶切PCR擴(kuò)增。1.取1.5ml細(xì)菌培養(yǎng)物于EP管中,4000rpm離心1分鐘,棄上清液,使細(xì)菌沉淀盡量干燥;2.將細(xì)菌沉淀重懸于用冰預(yù)冷的100μl溶液I(50mmol/L葡萄糖,10mmol/LEDTApH8.0,25mmol/LTris-HClpH8.0)中,劇烈振蕩;3.加入200μl新配制的溶液II(0.2mol/LNaOH,1%SDS(m/v)),蓋緊EP管口,快速顛倒離心管5次,以混合混合物,確保離心管的整個(gè)內(nèi)表面與溶液II -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):SSR標(biāo)記實(shí)驗(yàn)步驟
一、簡介:SSR簡單序列重復(fù)標(biāo)記(Simplesequencerepeat,簡稱SSR標(biāo)記),也叫微衛(wèi)星序列重復(fù),是由一類由幾個(gè)核苷酸(1-5個(gè))為重復(fù)單位組成的長達(dá)幾十個(gè)核苷酸的重復(fù)序列,長度較短,廣泛分布在染色體上。由于重復(fù)單位的次數(shù)的不同或重復(fù)程度的不*相同,造成了SSR長度的高度變異性,由此而產(chǎn)生SSR標(biāo)記或SSLP標(biāo)記。雖然SSR在基因組上的位置不盡相同,但是其兩端序列多是保守的單拷貝序列,因此可以用微衛(wèi)星區(qū)域特定順序設(shè)計(jì)成對(duì)引物,通過PCR技術(shù),經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳,即可顯示SSR位 -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù):凍融法回收DNA片段操作步驟
1.紫外燈下仔細(xì)切下含待回收DNA的膠條,將切下的膠條(小于0.6g)搗碎,置于1.5ml離心管中;2.加入等體積的Tris-HCl飽和酚(pH7.6),振蕩混勻;3.-20℃放置5-10min;4.4℃離心10000g×5min,上層液轉(zhuǎn)移置另一離心管中;5.加入1/4體積H2O于含膠的離心管中,振蕩混勻;6.-20℃,放置5-10min;7.4℃離心10000g×5min,合并上清液;8.用等體積酚/氯仿、氯仿分別抽提一次,取上清;9.加入1/10體積3MNaAc(pH5.2)、2.5倍體積 -
DNA實(shí)驗(yàn)技術(shù),DNA 序列分析技術(shù)
物種的遺傳多樣性在本質(zhì)上是DNA一級(jí)序列的多樣性。近年來,隨著DNA測序技術(shù)的迅速發(fā)展和日益普及,DNA測序在遺傳多樣性的研究中正在起著越來越大的作用。本章將介紹目前在遺傳多樣性研究中常用的一種手動(dòng)和一種全自動(dòng)雙鏈DNA測序方法。1DNA模板的制備在遺傳多樣性的研究中,由于樣本量一般都較龐大,因而DNA測序的速度就成了很關(guān)鍵的因素。因此,這類研究中常常直接測定純化的PCR雙鏈產(chǎn)物而不大采用克隆技術(shù)。本節(jié)介紹本實(shí)驗(yàn)室常用的從PCR產(chǎn)物制備測序模板的方法,即低熔點(diǎn)膠回收法。(1)制備1.5%~2.0