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        1. 翌圣生物科技(上海)股份有限公司

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          翌圣OnePot 酶切法建庫試劑盒亮相科研期刊

          2021-12-13  閱讀(969)

          分享:
          榮登Nature Methods | 翌圣OnePot 酶切法建庫試劑盒亮相科研期刊

           

           

          GUIDE

           導  讀


          生物個體所有細胞的親緣關系可以用細胞譜系樹來描述。細胞譜系對于理解多細胞生物的胚胎發(fā)育、細胞分化、器官的維持與衰老等生理病理過程具有重要意義,目前主要通過DNA條形碼(barcode)技術記錄細胞分裂過程產(chǎn)生的突變來還原細胞譜系。然而,目前DNA條形碼技術的精確度為平均每個條形碼只攜帶3-5個突變,限制了科學家對復雜多細胞生物胚胎發(fā)育的全貌的研究。

           

          研 究 內(nèi) 容


          中山大學賀雄雷團隊長期致力于DNA條形碼技術優(yōu)化和創(chuàng)新。2021年12月2日,賀教授團隊在Nature 子刊Nature Methods(IF=28)發(fā)文“Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development”,介紹一種基于單堿基突變的細胞譜系追蹤系統(tǒng)SMALT(substitution mutation aided lineage tracing system),通過SMALT系統(tǒng)構建轉基因果蠅品系,實現(xiàn)在單細胞水平上對復雜多細胞生物的胚胎發(fā)育過程中細胞譜系關系進行可靠描述。


          ▲ 圖源論文,點擊可查看原文


          此外,研究人員開發(fā)了利用細胞譜系樹還原具有分裂活性的祖先細胞群體數(shù)量的分析方法-ICPD,從細胞譜系樹推斷各器官發(fā)育過程的群體歷史特征,結果顯示,不同器官具有*的群體歷史特征,并且該特征在不同個體具有高度一致性。此外,ICPD進一步發(fā)現(xiàn),各器官中分裂產(chǎn)生的細胞總數(shù)與器官的真實細胞數(shù)量顯著相關,對其方差解釋度達到74.5%,這表明細胞群體的分裂活性對器官大小的穩(wěn)定性具有重要作用。

          圖1、果蠅幼蟲各器官的分歧時間.jpg
          圖2、分裂細胞數(shù)與真實器官細胞數(shù)一致性.jpg

           

          翌圣提供NGS建庫完整解決方案


          值得一提的是,這篇高水平文章采用翌圣Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® “一步法”DNA建庫試劑盒對果蠅DNA進行建庫。該試劑盒采用高質量的片段化酶,將片段化模塊與末端修復模塊合二為一,降低了建庫的時間和成本,可用于500 pg-1 μg動植物基因組、微生物基因組等樣本,同時能兼容FFPE DNA樣本的建庫。經(jīng)測序驗證,不同GC含量的樣本,均可獲得優(yōu)異的測序結果,使建庫變得更加簡單高效。

           

          圖3、賀教授團隊建庫使用翌圣建庫試劑盒.jpg圖3.賀教授團隊建庫使用翌圣建庫試劑盒


          目前翌圣生物針對MGI以及Illumina測序平臺均提供完善的核酸提取以及文庫制備方案,相關產(chǎn)品經(jīng)過嚴格的批次性能與穩(wěn)定性質控,確保產(chǎn)品的優(yōu)異性能,為研究者進行高質量的科學研究提供有力的保障。

           

          適用平臺

          產(chǎn)品名稱

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          Illumina機械法建庫

          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina® 機械法DNA建庫試劑盒

          12199ES08/12199ES24/12199ES96

          8T/24T/96T

          Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® 機械法DNA建庫試劑盒

          12201ES08/12201ES24/12201ES96

          8T/24T/96T

          Illumina酶切法建庫

          Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® 酶切法DNA建庫試劑盒

          12204ES08/12204ES24/12204ES96

          8T/24T/96T

          Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® DNA 酶切法建庫試劑盒

          12205ES08/12205ES24/12205ES96

          8T/24T/96T

          Illumina轉座酶法建庫

          Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng)  轉座酶法建庫試劑盒(1ng

          12206ES08/12206ES24/12206ES96

          8T/24T/96T

          Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 50 ng)  轉座酶法建庫試劑盒(50 ng

          12207ES08/12207ES24/12207ES96

          8T/24T/96T

          MGI機械法建庫

          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI® 機械法建庫試劑盒

          13310ES16/13310ES96/13310ES98

          16 T/96 T/192 T

          MGI酶切法建庫

          Hieff  NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI® 酶切法建庫試劑盒

          13321ES16/13321ES96

          16T/96T

          Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for MGI® DNA 酶切法建庫試劑盒

          13322ES16/13322ES96

          16T/96T

          文庫分選/純化磁珠

          Hieff NGS® DNA Selection Beads 分選磁珠

          12601ES08/12601ES56/12601ES75

          5mL/60mL/450mL

          Qubit文庫定量

          dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit試劑

          12640ES60/12640ES76

          100T/500T

          1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit預混液

          12642ES60/12642ES76

          100T/500T

           

           

           

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