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研 究 內(nèi) 容
中山大學賀雄雷團隊長期致力于DNA條形碼技術優(yōu)化和創(chuàng)新。2021年12月2日,賀教授團隊在Nature 子刊Nature Methods(IF=28)發(fā)文“Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development”,介紹一種基于單堿基突變的細胞譜系追蹤系統(tǒng)SMALT(substitution mutation aided lineage tracing system),通過SMALT系統(tǒng)構建轉基因果蠅品系,實現(xiàn)在單細胞水平上對復雜多細胞生物的胚胎發(fā)育過程中細胞譜系關系進行可靠描述。
▲ 圖源論文,點擊可查看原文
此外,研究人員開發(fā)了利用細胞譜系樹還原具有分裂活性的祖先細胞群體數(shù)量的分析方法-ICPD,從細胞譜系樹推斷各器官發(fā)育過程的群體歷史特征,結果顯示,不同器官具有*的群體歷史特征,并且該特征在不同個體具有高度一致性。此外,ICPD進一步發(fā)現(xiàn),各器官中分裂產(chǎn)生的細胞總數(shù)與器官的真實細胞數(shù)量顯著相關,對其方差解釋度達到74.5%,這表明細胞群體的分裂活性對器官大小的穩(wěn)定性具有重要作用。
翌圣提供NGS建庫完整解決方案
值得一提的是,這篇高水平文章采用翌圣Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® “一步法”DNA建庫試劑盒對果蠅DNA進行建庫。該試劑盒采用高質量的片段化酶,將片段化模塊與末端修復模塊合二為一,降低了建庫的時間和成本,可用于500 pg-1 μg動植物基因組、微生物基因組等樣本,同時能兼容FFPE DNA樣本的建庫。經(jīng)測序驗證,不同GC含量的樣本,均可獲得優(yōu)異的測序結果,使建庫變得更加簡單高效。
圖3.賀教授團隊建庫使用翌圣建庫試劑盒
目前翌圣生物針對MGI以及Illumina測序平臺均提供完善的核酸提取以及文庫制備方案,相關產(chǎn)品經(jīng)過嚴格的批次性能與穩(wěn)定性質控,確保產(chǎn)品的優(yōu)異性能,為研究者進行高質量的科學研究提供有力的保障。
適用平臺 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 |
Illumina機械法建庫 | Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina® 機械法DNA建庫試劑盒 | 12199ES08/12199ES24/12199ES96 | 8T/24T/96T |
Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® 機械法DNA建庫試劑盒 | 12201ES08/12201ES24/12201ES96 | 8T/24T/96T | |
Illumina酶切法建庫 | Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® 酶切法DNA建庫試劑盒 | 12204ES08/12204ES24/12204ES96 | 8T/24T/96T |
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® DNA 酶切法建庫試劑盒 | 12205ES08/12205ES24/12205ES96 | 8T/24T/96T | |
Illumina轉座酶法建庫 | Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng) 轉座酶法建庫試劑盒(1ng) | 12206ES08/12206ES24/12206ES96 | 8T/24T/96T |
Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 50 ng) 轉座酶法建庫試劑盒(50 ng) | 12207ES08/12207ES24/12207ES96 | 8T/24T/96T | |
MGI機械法建庫 | Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI® 機械法建庫試劑盒 | 13310ES16/13310ES96/13310ES98 | 16 T/96 T/192 T |
MGI酶切法建庫 | Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI® 酶切法建庫試劑盒 | 13321ES16/13321ES96 | 16T/96T |
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for MGI® DNA 酶切法建庫試劑盒 | 13322ES16/13322ES96 | 16T/96T | |
文庫分選/純化磁珠 | Hieff NGS® DNA Selection Beads 分選磁珠 | 12601ES08/12601ES56/12601ES75 | 5mL/60mL/450mL |
Qubit文庫定量 | dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit試劑 | 12640ES60/12640ES76 | 100T/500T |
1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit預混液 | 12642ES60/12642ES76 | 100T/500T |