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        1. 翌圣生物科技(上海)股份有限公司

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          12199ES24全能型DNA建庫試劑盒
          參考價(jià): 面議
          具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
          • 12199ES24 產(chǎn)品型號
          • Yeasen/翌圣生物 品牌
          • 生產(chǎn)商 廠商性質(zhì)
          • 上海市 所在地

          訪問次數(shù):1004更新時(shí)間:2022-01-07 18:10:49

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          上海市浦東新區(qū)天雄路166弄1號3樓
          網(wǎng)址:
          www.yeasen.com

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          產(chǎn)品簡介
          供貨周期 現(xiàn)貨 規(guī)格 8 T
          貨號 12199ES08 應(yīng)用領(lǐng)域 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè)
          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®是針對Illumina®高通量測序平臺定向優(yōu)化而成的新一代建庫試劑盒。作為全新的升級版本,本產(chǎn)品采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,簡化的操作流程,可顯著提高低質(zhì)量樣本文庫轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率,具有廣泛的樣本適應(yīng)性,同時(shí)兼容FFPE、cfDNA、ChIP DNA等樣本,助力獲得優(yōu)異的測序數(shù)據(jù)。
          產(chǎn)品介紹

          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®

          全能型DNA建庫試劑盒

          產(chǎn)品信息

          產(chǎn)品名稱

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          價(jià)格(元)

          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®

          全能型DNA建庫試劑盒

          12199ES08

          8 T

          2553.00

          12199ES24

          24 T

          6783.00

          12199ES96

          96 T

          25563.00

          產(chǎn)品描述

          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®是針對Illumina®高通量測序平臺定向優(yōu)化而成的新一代建庫試劑盒。作為全新的升級版本,本產(chǎn)品采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,簡化的操作流程,可顯著提高低質(zhì)量樣本文庫轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率,具有廣泛的樣本適應(yīng)性,同時(shí)兼容FFPE、cfDNA、ChIP DNA等樣本,助力獲得優(yōu)異的測序數(shù)據(jù)。

          適用500 pg-1 μg DNA樣本

          兼容cfDNA、FFPE等低質(zhì)量樣本

          高效的文庫轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率

          多樣本驗(yàn)證可獲得優(yōu)異的文庫與測序數(shù)據(jù)

          嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控

          產(chǎn)品組分


          運(yùn)輸與保存方法


          冰袋運(yùn)輸。

          所有組分-20°C保存,有效期1年。

          注意事項(xiàng)


          一、關(guān)于操作

          1. 為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。

          2. 請于使用前將試劑盒各組分置于室溫解凍。解凍后上下顛倒數(shù)次充分混勻,短暫離心后置于冰上待用。

          3. 配制各步驟反應(yīng)液時(shí)推薦使用移液器吹打混勻或輕輕振蕩,劇烈振蕩可能會造成文庫產(chǎn)出下降。

          4. 為避免樣品交叉污染,推薦使用帶濾芯的槍頭,吸取不同樣品時(shí)請更換槍頭。

          5. 推薦在帶熱蓋的PCR儀中進(jìn)行各步驟反應(yīng),使用前應(yīng)預(yù)熱PCR儀至反應(yīng)溫度附近。

          6. PCR產(chǎn)物因操作不當(dāng)極容易產(chǎn)生氣溶膠污染,進(jìn)而影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性。推薦將PCR反應(yīng)體系配制區(qū)和PCR產(chǎn)物純化檢測區(qū)進(jìn)行強(qiáng)制性的物理隔離;使用的移液器等設(shè)備;并定時(shí)對各實(shí)驗(yàn)區(qū)域進(jìn)行清潔(使用0.5%次氯酸鈉或10%漂白劑進(jìn)行擦拭清理),以保證實(shí)驗(yàn)環(huán)境的潔凈度。

          二、關(guān)于DNA pian段化

          1. 本試劑盒中兼容機(jī)械法及酶切法片段化的DNA。

          2. 本試劑盒兼容范圍為500 pg – 1 μg Input DNA。應(yīng)盡可能使用A260/A280 = 1.8-2.0的高質(zhì)量Input DNA。表1中列舉了將本試劑盒應(yīng)用于常見應(yīng)用中推薦的Input DNA量。

          表1  常見應(yīng)用中推薦Input DNA量

          應(yīng)用

          樣本類型

          推薦Input DNA量

          全基因組測序

          復(fù)雜基因組

          50 ng-1 μg

          靶向捕獲測序

          復(fù)雜基因組

          10 ng-1 μg

          全基因組測序,靶向捕獲測序

          FFPE DNA

          ≥50 ng

          全基因組測序,靶向捕獲測序

          cfDNA/ctDNA

          ≥500 pg

          全基因組測序

          微生物基因組

          ≥1 ng

          全基因組測序PCR-free測序

          高質(zhì)量DNA

          ≥100 ng

          免疫共沉淀測序

          ChIP-DNA

          ≥500 pg

          靶向測序

          擴(kuò)增子

          ≥500 pg

          【注】:上表為使用高質(zhì)量DNA時(shí)推薦的Input DNA量,當(dāng)Input DNA質(zhì)量較差或需要進(jìn)行片段分選時(shí),應(yīng)適當(dāng)上調(diào)使用量。

          3. Input DNA特指投入末端修復(fù)/dA尾添加步驟中的DNA。

          4. Input DNA制備過程中帶入的高濃度金屬離子螯合劑或其他鹽,可能會影響末端修復(fù)/dA尾添加步驟反應(yīng)效率,建議DNA pian段化后進(jìn)行磁珠純化或分選。當(dāng)使用機(jī)械法進(jìn)行DNA pian段化且產(chǎn)物不進(jìn)行純化或長度分選而直接建庫時(shí),請將DNA稀釋在TE Buffer中進(jìn)行片段化,請勿在滅菌超純水中進(jìn)行。當(dāng)使用酶切法進(jìn)行片段化且產(chǎn)物不進(jìn)行純化或長度分選而直接建庫時(shí),請確認(rèn)Stop Buffer中不包含過量的金屬離子螯合劑。如條件不滿足,可先將片段化產(chǎn)物純化或長度分選后溶于TE buffer或滅菌超純水中(≤50 μL),再進(jìn)行文庫構(gòu)建。

          三、關(guān)于接頭連接(Adapter Ligation)

          1.本公司可提供長接頭(Indexed Adapter)試劑盒和短接頭(也稱為小Y接頭、不完整接頭)試劑盒,客戶可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行選擇。

          目前有48種Complete Adapters: Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1~Set 4 (Cat#12615~Cat#12618);

          單端 96種 Index Primers: Hieff NGS® 96 Single Index Primers Kit for Illumina® , Set 1~Set 2 (Cat#12611~Cat#12612);

          雙端 384 種 Index Primers: Hieff NGS® 384 Dual Index Primers Kit for Illumina® , Set 1~Set 2 (Cat#12613~Cat#12614)。

          2. Adapter的質(zhì)量和使用濃度直接影響連接效率及文庫產(chǎn)量。Adapter用量過高可能會產(chǎn)生較多Adapter Dimer;用量較低可能會影響連接效率及文庫產(chǎn)量。表2列舉了使用本試劑盒,不同Input DNA量推薦的Adapter使用量。

          表2  500 pg-1 μg Input DNA推薦的Adapter使用濃度

          Input DNA

          Adapter : Input DNA摩爾比

          Input DNA

          Adapter : Input DNA摩爾比

          1 μg

          10:1

          50 ng

          100:1

          500 ng

          20:1

          25 ng

          200:1

          250 ng

          40:1

          1 ng

          200:1

          100 ng

          100:1

          500 pg

          400:1

          【注】:Input DNA摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均長度(bp)]。

          四、關(guān)于磁珠純化與分選(Bead-based Clean Up and Size Selection)

          1. DNA pian段長度分選步驟可選擇在末端修復(fù)/dA尾添加之前,或接頭連接后,或文庫擴(kuò)增后進(jìn)行。

          2. 當(dāng)Input DNA質(zhì)量≥50 ng,您可選擇在接頭連接后分選;如Input DNA質(zhì)量<50 ng,建議您在文庫擴(kuò)增后進(jìn)行分選。

          3. Ligation Enhancer中包含高濃度的PEG,會對雙輪磁珠分選產(chǎn)生顯著影響。因此,如在接頭連接后進(jìn)行長度分選,必須先進(jìn)行純化步驟,再進(jìn)行雙輪分選步驟;如在末端修復(fù)/dA尾添加之前或文庫擴(kuò)增后進(jìn)行長度分選,可直接進(jìn)行雙輪磁珠分選步驟。

          4. 磁珠使用前應(yīng)先平衡至室溫,否則會導(dǎo)致得率下降、分選效果不佳。

          5. 磁珠每次使用前都應(yīng)充分振蕩混勻或使用移液器上下吹打充分混勻。

          6. 轉(zhuǎn)移上清時(shí),請勿吸取磁珠,即使微量殘留都將影響后續(xù)文庫質(zhì)量。

          7. 磁珠漂洗使用的80%乙醇應(yīng)現(xiàn)用現(xiàn)配,否則將影響回收效率。

          8. 進(jìn)行長度分選時(shí),初始樣品體積應(yīng)盡量≥100 μL,不足時(shí)請用超純水補(bǔ)齊。以防因樣品體積太小導(dǎo)致移液誤差增大。

          9. 產(chǎn)物洗脫前應(yīng)將磁珠置于室溫干燥。干燥不充分容易造成無水乙醇?xì)埩粲绊懞罄m(xù)反應(yīng);過分干燥又會導(dǎo)致磁珠開裂進(jìn)而降低純化得率。通常情況下,室溫干燥3-5 min足以讓磁珠充分干燥。

          10. DNA純化或長度分選產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫,產(chǎn)物可于4°C可保存1-2周,-20°C可保存1個(gè)月。

          五、關(guān)于文庫擴(kuò)增(Library Amplification)

          1. 是否需要進(jìn)行文庫擴(kuò)增取決于Input DNA量、Adapter是否為完整長度、應(yīng)用需要等因素。如使用非完整長度Adapter,必須進(jìn)行這一步驟。如使用完整長度Adapter,當(dāng)Input DNA<200 ng時(shí),推薦進(jìn)行文庫擴(kuò)增;當(dāng)Input DNA≥200 ng或者不需要進(jìn)行文庫擴(kuò)增時(shí),可不進(jìn)行文庫擴(kuò)增。

          2. 文庫擴(kuò)增步驟需要嚴(yán)格控制擴(kuò)增循環(huán)數(shù)。循環(huán)數(shù)不足,將導(dǎo)致文庫產(chǎn)量低;循環(huán)數(shù)過多,又將導(dǎo)致文庫偏好性增加、重復(fù)度增加、嵌合產(chǎn)物增加、擴(kuò)增突變積累等多種不良后果。表3列舉了本試劑盒,獲得100 ng或1000 ng文庫的所需循環(huán)數(shù)。

          表3 500 pg-1 μg Input DNA獲得100 ng或1000 ng產(chǎn)物擴(kuò)增循環(huán)數(shù)推薦表

          Input DNA ( Into End Preparation )

          Number of cycles required to generate

          100 ng

          1000 ng

          1 μg

          0*

          2 - 4*

          500 ng

          0*

          3 - 5

          250 ng

          1 - 3*

          4 - 7

          100 ng

          2 - 4**

          5 - 8

          50 ng

          4 - 6

          7 - 10

          10 ng

          6 - 8

          8 - 12

          5 ng

          7 - 9

          10 - 14

          1 ng

          9 - 11

          12 - 15

          500 pg

          11 - 13

          13 - 16

          【注】:**如果使用了不完整的接頭,需要擴(kuò)增1-3個(gè)循環(huán),形成完整的接頭。建庫過程中進(jìn)行過長度分選時(shí)參照較高循環(huán)數(shù)擴(kuò)增。

          六、關(guān)于文庫質(zhì)檢(Library Quality Analysis)

          1. 通常情況下,構(gòu)建好的文庫可通過長度分布檢測和濃度檢測來進(jìn)行質(zhì)量評價(jià)。

          2. 文庫濃度檢測可使用:基于雙鏈DNA熒光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等;基于qPCR定量的方法。

          3. 文庫濃度檢測不可使用:基于光譜檢測的方法,如NanoDrop®等。

          4. 推薦使用qPCR方法進(jìn)行文庫濃度檢測:Qubit®、PicoGreen®等基于雙鏈DNA熒光染料的濃度測定方法時(shí),無法有效區(qū)分單端連接Adapter的產(chǎn)物、兩端均未連接Adapter的產(chǎn)物以及其他不完整雙鏈結(jié)構(gòu)產(chǎn)物;qPCR定量基于PCR擴(kuò)增原理,僅定量樣品中兩端Adapter完整的文庫(即可測序的文庫),可排除單端或雙端都不連接Adapter的不可測序文庫的干擾。

          5. 文庫長度分布檢測,可通過Agilent Bioanalyzer 2100等基于毛細(xì)管電泳或微控流原理的設(shè)備進(jìn)行檢測。

          使用方法


          一、自備材料

          1. 純化磁珠:Cat#12601,Hieff NGS® DNA Selection Beads或Cat#A63880,AMPure XP Beads或其他等效產(chǎn)品。

          2. DNA質(zhì)控:Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer或其他等效產(chǎn)品。

          3. DNA Adapter:可選Yeasen Complete Adapter: Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1-4(Cat#12615-12618);

          單端 96種 Index Primers: Hieff NGS® 96 Single Index Primers Kit for Illumina® , Set 1-2 (Cat#12611~Cat#12612);

          雙端 384 種 Index Primers: Hieff NGS® 384 Dual Index Primers Kit for Illumina® , Set 1-2 (Cat#12613~Cat#12614)。

          或其他等效產(chǎn)品。

          4. 其他材料:無水乙醇、滅菌超純水、TE Buffer(10 mM Tris-HCl,pH 8.0-8.5+0.1 mM EDTA)、低吸附EP管、PCR管、磁力架、PCR儀等。

          二、操作流程

          圖1  UltimaTM DNA建庫試劑盒操作流程

          三、操作步驟

          3.1 末端修復(fù)/dA尾添加(End Preparation/dA-Taling)

          該步驟將Input DNA末端補(bǔ)平,并進(jìn)行5’端磷酸化和3’端加dA尾。

          1. 將表4中各試劑解凍后,顛倒混勻,置于冰上備用。

          2. 于無菌PCR管中配制表4所示反應(yīng)體系。

          表4  末端修復(fù)/dA尾添加PCR反應(yīng)體系

          名稱

          體積(μL)

          Fragmented DNA

          x

          Endprep Mix

          10

          ddH2O

          Up to 60 μL

          3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液離心至管底。

          4. 將上述PCR管置于PCR儀,設(shè)置表5所示反應(yīng)程序,進(jìn)行末端修復(fù)/dA尾添加反應(yīng)。

          表5  末端修復(fù)/dA尾添加PCR反應(yīng)程序

          溫度

          時(shí)間

          熱蓋105°C

          On

          30°C

          20 min

          72°C

          20 min

          4°C

          Hold

          3.2 接頭連接(Adapter Ligation)

          該步驟將3.1步驟的產(chǎn)物末端,連接特定的Illumina®接頭。

          1. 根據(jù)Input DNA量按表2稀釋Adapter至合適濃度。

          2. 將表6中各試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。

          3. 于3.1步驟PCR管中配制表6所示反應(yīng)體系。

          表6  Adapter Ligation PCR體系

          名稱

          體積(μL)

          dA-tailed DNA(3.1步驟產(chǎn)物)

          60

          Ligation Enhancer

          30*

          Fast T4 DNA Ligase

          5

          DNA Adapter

          5**

          【注】:*Ligation Enhancer比較粘稠,請上下顛倒、振蕩,充分混勻并瞬時(shí)后離心使用。

          **本公司接頭濃度與常規(guī)商業(yè)化試劑盒*,皆為15 μM。

          【接頭添加計(jì)算舉例當(dāng)Input DNA100 ng,Input DNA長度為300 bp時(shí),接頭應(yīng)該添加多少?

          *步,計(jì)算Input DNA摩爾數(shù)公式Input DNA摩爾數(shù)(pmol)≈ Input DNA質(zhì)量(ng)/ [0.66 × Input DNA平均長度(bp)];

          Input DNA 摩爾數(shù)(pmol)=100÷(0.66×300)=0.5 pmol;

          第二步,計(jì)算接頭添加摩爾數(shù)。根據(jù)注意事項(xiàng)三表2查詢接頭添加比例;

          根據(jù)表2,查得Input DNA 100ng時(shí)接頭添加比例100:1,接頭添加摩爾數(shù)=100×0.5 pmol=50 pmol;

          第三步,計(jì)算接頭添加體積。接頭濃度=15 μmol/L(如使用其他接頭,濃度需要依據(jù)其他接頭濃度參數(shù));

          接頭添加體積=接頭添加摩爾數(shù)(50 pmol)÷接頭濃度(15 μmol/L)=3.34 μL(注:15 μmol/L=15 pmol/μL

          綜上,接頭可添加3.4 μL,加1.6 μL水補(bǔ)齊至5 μL。(注:接頭大加入體積不超過5 μL)。

          4. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。

          5. 將PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表7所示反應(yīng)程序,進(jìn)行接頭連接反應(yīng):

          表7  Adapter Ligation PCR反應(yīng)程序

          溫度

          時(shí)間

          熱蓋105°C

          Off

          20°C

          15 min

          4°C

          Hold

          【注】:當(dāng)Input DNA量較低,實(shí)驗(yàn)效果不理想時(shí),可嘗試將連接時(shí)間延長一倍。

          3.3 連接產(chǎn)物磁珠純化(Post Ligation Clean Up)

          該步驟使用磁珠對3.2步驟的產(chǎn)物進(jìn)行純化或分選。純化可除去未連接的Adapter或Adapter Dimer等無效產(chǎn)物。

          3.3.1 純化操作步驟:

          1. 準(zhǔn)備工作:將Hieff NGS® DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡至少30 min。配制80%乙醇。

          2. 渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證充分混勻。

          3. 吸取60 μL Hieff NGS® DNA Selection Beads(0.6×,Beads:DNA=0.6:1)至Adapter Ligation產(chǎn)物中,室溫孵育5 min。

          4. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。

          5. 保持PCR管始終置于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec后,小心移除上清。

          6. 重復(fù)步驟5,總計(jì)漂洗兩次。

          7. 保持PCR管始終置于磁力架中,開蓋空氣干燥磁珠至剛剛出現(xiàn)龜裂(不超過5 min)。

          8. 將PCR管從磁力架中取出,進(jìn)行洗脫:

          1)如產(chǎn)物無需進(jìn)行片段分選,直接加入21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置5 min?!咀ⅲ喝缂兓a(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫】。將PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約5 min),小心移取20 μL上清至新PCR管中,切勿觸碰磁珠。

          2)如產(chǎn)物需進(jìn)行雙輪分選,加入102 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置5 min?!咀ⅲ喝缂兓a(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫】。將PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約5 min),小心移取100 μL上清至新PCR管中,切勿觸碰磁珠。

          3.3.2 雙輪分選操作步驟:

          1. 準(zhǔn)備工作:將Hieff NGS® DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡30 min。配制80%乙醇。

          2. 請渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證混勻。

          3. 根據(jù)DNA pian段長度要求,參考表8向上述100 μL DNA上清中加入*輪分選磁珠,渦旋混勻或移液器吹打10次混勻。表8  磁珠文庫分選推薦比例

          DNA文庫插入片段大小

          150 - 250 bp

          200-300 bp

          300-400 bp

          400-500 bp

          500-600 bp

          DNA文庫大小

          250 - 350 bp

          350-450 bp

          450-550 bp

          550-650 bp

          650-750 bp

          *輪體積比(Beads:DNA)

          0.80×

          0.70×

          0.60×

          0.55×

          0.50×

          第二輪體積比(Beads:DNA)

          0.20×

          0.20×

          0.20×

          0.15×

          0.15×

          【注】:表中“×"表示樣品DNA體積。如文庫插入片段長度為250 bp,樣品DNA體積為100 μL,則*輪分選磁珠使用體積為0.70×100 μL=70 μL;第二輪分選磁珠使用體積為0.20×100 μL=20 μL;表中所推薦比例是針對于Adapter Ligated Insert DNA(Post Ligation),如果用戶在接頭連接前進(jìn)行分選,請采用Hieff NGS® DNA Selection Beads(Cat#12601)說明書中推薦的比例。

          4. 室溫孵育5 min。

          5. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心轉(zhuǎn)移上清到干凈的離心管中。

          6. 參考表8向上清中加入第二輪分選磁珠。

          7. 渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫靜置5 min。

          8. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。

          9. 保持PCR管始終處于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec,小心移除上清。

          10. 重復(fù)步驟9。

          11. 保持PCR管始終處于磁力架中,開蓋干燥磁珠至剛剛出現(xiàn)龜裂(約5 min)。

          12. 將PCR管從磁力架中取出,加入適量21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打充分混勻,室溫靜置5 min。

          13. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體。待溶液澄清后(約5 min),小心轉(zhuǎn)移20 μL上清至干凈的管中。

          3.4 文庫擴(kuò)增(Library Amplification)

          該步驟將對純化或長度分選后的接頭連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增富集。

          1. 將表9中試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用

          2. 于無菌PCR管中配制表9所示反應(yīng)體系。

          表9  PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系

          名稱

          體積(μL)

          2×Ultima Amplification Mix

          25

          Primer Mix

          5

          Adapter Ligated DNA(3.3步驟產(chǎn)物)

          20

          3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。

          4. 將PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表10所示反應(yīng)程序,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

          表10  PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序

          溫度

          時(shí)間

          循環(huán)數(shù)

          98°C

          1 min

          1

          98°C

          10 sec

          參照注意事項(xiàng)中表3

          60°C

          30 sec

          72°C

          30 sec

          72°C

          5 min

          1

          4°C

          Hold

          -

          3.5 擴(kuò)增產(chǎn)物磁珠純化或分選(Post Amplification Clean Up/Size Selection)

          同3.3.1步驟中純化操作步驟。使用Hieff NGS® DNA Selection Beads(0.9×,Beads:DNA=0.9:1)純化文庫擴(kuò)增產(chǎn)物。

          如需分選,操作方法同3.3.2雙輪分選步驟(純化步驟可省略)。

          3.6 文庫質(zhì)量控制

          通常情況下,構(gòu)建好的文庫可通過濃度檢測和長度分布檢測來進(jìn)行質(zhì)量評價(jià),具體請參見注意事項(xiàng)六。

          3.7 參考實(shí)例

          使用Hieff NGS® UltimaTM DNA Library Prep Kit for Illumina®100 ng FFPE樣本建庫(未分選),結(jié)果使用Agilent 2100 DNA 1000 Chip進(jìn)行檢測。

          圖2  UltimaTM DNA建庫試劑盒用于FFPE樣本建庫(未分選)

          相關(guān)產(chǎn)品


          建庫試劑盒

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina®

          12300ES24/96

          24/96 T

          Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina®

          12199ES24/96

          24/96 T

          Hieff NGS® MaxUpⅡ DNA Library Prep Kit for Illumina®

          12200ES24/96

          24/96 T

          Hieff NGS® OnePot DNA Library Prep Kit for Illumina®

          12203ES24/96

          24/96 T

          Hieff NGS® OnePotⅡ DNA Library Prep Kit for Illumina®

          12204ES24/96

          24/96 T

          Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina®

          12206ES24/96

          24/96 T

          文庫構(gòu)建磁珠

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          Hieff NGS® cfDNA Clean Beads(100~200 bp)

          12599ES08/56

          5/60 mL

          Hieff NGS® Smarter DNA Clean beads (50 bp以上)

          12600ES08/56

          5/60 mL

          Hieff NGS® DNA Selection Beads(Superior AMPure XP alternative)

          12601ES08/56

          5/60 mL

          Hieff NGS® RNA Cleaner

          12602ES08/56

          5/60 mL

          Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit

          12603ES24/96

          24/96 T

          建庫接頭

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          Hieff NGS® 96 Single Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2

          12611/12612ES02

          48×2 T

          Hieff NGS® 384 Dual Index Primer Kit for Illumina®, Set 1/2

          12613/12614ES02

          96×2 T

          Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1/2

          12615/12616ES04/16

          12×4/12×16 T

          Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 3/4

          12617/12618ES04/16

          12×4/12×16 T

          Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina®,(96 Index)

          12610ES96

          96 T

          建庫模塊

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          Hieff NGS® Fast-Pace DNA Fragmentation Reagent

          12609ES24/96

          24/96 T

          Hieff NGS® Fast-Pace End Repair/dA-Tailing Module

          12608ES24/96

          24/96 T

          2×Ultima Amplification Mix

          12620ES24/96

          24/96 T

          2×Super Canace® High-Fidelity Mix

          12621ES03/08

          24/96 T

          Hieff NGS® Dual-Mode cDNA Synthesis Kit

          12250ES24/96

          24/96 T

          文庫定量

          產(chǎn)品編號

          規(guī)格

          Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, qPCR Master Mix

          12302ES05

          500 T

          Hieff NGS® Library Quantification Kit for Illumina®, DNA Standard (1-6)

          12307ES09

          6×96 μL

          dsDNA HS Assay Kit for Qubit®

          12640ES60/76

          100/500 T

          多重PCR定制咨詢

          NGS建庫原料酶咨詢

          HB190830




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