據(jù)研究只有10%不到的人真正會(huì)用超濾管?
回收效率低下,目標(biāo)蛋白滲漏...
有的時(shí)候真懷疑自己可能用了一個(gè)假超濾管。
今天賽多利斯的“膜”法學(xué)院就來把超濾管使用過程中的干貨仔細(xì)篩一篩,助實(shí)驗(yàn)室大神一臂之力!
關(guān)于“膜” 法學(xué)院之基礎(chǔ)篇——來自于“爺爺奶奶” 輩的超濾產(chǎn)品
作為世界上個(gè)商業(yè)化生產(chǎn)膜產(chǎn)品的企業(yè),賽多利斯的膜可是有91年的歷史了。賽多利斯的膜源于曾經(jīng)在賽多利斯公司附近的哥廷根大學(xué)任職的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)得主Richard Adolf Zsigmondy的發(fā)明,和大多數(shù)歷史悠久的德國產(chǎn)品一樣,工藝和質(zhì)量嚴(yán)謹(jǐn)是賽多利斯秉承多年的家風(fēng)。那么,關(guān)于“膜”,有哪些基本知識(shí)是經(jīng)常被大家忽略的呢?
選對(duì)截留分子量,事半功倍
你是否抱怨過超濾管流速慢呢?很有可能是截留分子量選小啦!
超濾膜并非均一孔徑的膜,因此超濾膜截留分子量MWCO是標(biāo)稱值,例如對(duì)分子量100kD左右的球蛋白截留>90%的膜而被標(biāo)稱為100kD。所以,如果用標(biāo)稱為100kD的膜去截留我們自己100kD的樣品很有可能無法達(dá)到較高的截留效果。所以建議大家選擇的超濾膜MWCO是需要截留的目標(biāo)分子量的1/6-1/2。如果首先考慮流速的因素,則選擇需要截留的目標(biāo)分子量的1/2作為膜的截留分子量;如果截留效果作為主要考慮,則選擇需要截留的目標(biāo)分子量的1/5或1/6作為膜的截留分子量。另外,由于膜的特性不一樣,更換品牌或是同品牌不同產(chǎn)品系列時(shí),適合的截留分子量偶爾是會(huì)變化的!這點(diǎn)一定要多加注意呀!另外,即使是相同的截留分子量,不同的膜的流速是不一樣的,所以,選擇較高流速的膜,例如PES膜,可以讓實(shí)驗(yàn)更加輕松。
另外,有小伙伴是做核酸和病毒的,如果想用超濾的方法來濃縮怎么操作呢?這個(gè)大可以放心!可以參考下表來進(jìn)行選擇和試驗(yàn):
Membrane | MWCO | Double-Stranded Nucleotide Cutoff (bp) |
Hydrosart® | 2 kDa | > 10 |
Hydrosart® | 10 kDa | > 30 |
Hydrosart® | 30 kDa | > 50 |
Hydrosart® | 50 kDa | > 300 |
Hydrosart® | 100 kDa | > 600 |
Cellulose Acetate | 125 kDa | > 650 |
值得一提的是:由于PCR技術(shù)的發(fā)展,即便痕量DNA污染都會(huì)導(dǎo)致假陽性的結(jié)果,因此在進(jìn)行核酸操作時(shí)推薦大家使用PCR-grade級(jí)別的超濾管。
如果需要濃縮病毒,可以參考下表選擇超濾產(chǎn)品:
Target Protein MW | Target Biomolecule Size | Recommended membrane MWCO | Estimated membrane pore size |
900-1,800kD | 90-200nm | 300kD | 30nm |
300-900kD | 30-90nm | 100kD | 10nm |
150-300kD | 15-30nm | 50kD | 7nm |
90-180kD |
| 30kD | 4nm |
30-90kD |
| 10kD | 2.5nm |
15-30kD |
| 5kD | 1.5nm |
10-20kD |
| 3kD | 1.2nm |
3-10kD |
| 2kD | 1nm |
100K、300K的Vivaspin/Vivaflow超濾產(chǎn)品在CAR-T和進(jìn)行病毒包裝的客戶中有大量應(yīng)用呢!
漏蛋白?可能你的樣品選錯(cuò)了膜材質(zhì)
每種膜都有化學(xué)兼容性,在使用之前要確認(rèn)樣品成分尤其是樣品中的去垢劑是否和膜材質(zhì)兼容,這樣才不會(huì)造成樣品的泄漏和污染。再比如有的客戶樣品中含有咪唑,含量為200mM,如果他使用Vivaspin或Vivaspin Turbo可以直接使用,因?yàn)閂ivaspin或Vivaspin Turbo可以耐受500mM,而他如果選擇某些只耐受100mM的超濾管就必須進(jìn)行稀釋,否則就有可能發(fā)生泄漏。因此,使用前仔細(xì)察看超濾產(chǎn)品的化學(xué)兼容性非常重要。
還有就是:
請(qǐng)養(yǎng)成一個(gè)好習(xí)慣: 超濾結(jié)束,等待終的實(shí)驗(yàn)結(jié)果出來之后再棄去濾出液!
因?yàn)槿绻l(fā)生問題,可以對(duì)我們可能出現(xiàn)的問題進(jìn)行分析。
巧用預(yù)處理,達(dá)到低濃度樣品的大回收
如果樣品濃度很低,無法做后續(xù)分析,這樣就需要通過超濾來濃縮樣品。Vivaspin采用超低吸附的PES材質(zhì)濾膜,蛋白回收率高達(dá)95%,另外我們還有吸附極低的Hydrosart膜可以選擇。對(duì)于有些樣品含量非常少的情況,除了選擇我們吸附量很低的膜,我們還有如下法寶推薦!
a.盡量選擇較小的截留分子量的膜
b.選擇帶有尖角收集器的膜,以便大限度回收樣品
c.使用水平轉(zhuǎn)子優(yōu)于角轉(zhuǎn)子
d.濃縮完用緩沖液清洗多次回收, 注意移液器的槍頭不要碰到膜,以免膜破裂。
e.使用前可以先對(duì)膜進(jìn)行“封閉鈍化”。
鈍化步驟:先用Arium水清洗,用移液器去除殘留水分。選擇下面推薦的一種鈍化液室溫至少2小時(shí)或過夜浸泡(除了Triton X-100不推薦過夜),去除鈍化液,用Arium水沖洗3-4遍。直接使用或4度Arium水保存。
Type Concentration
Powdered milk 1% in Arium water
BSA 1% in PBS
Tween 20 5% in Arium water
SDS 5% in Arium water
Triton X-100 5% in Arium water
PEG 3000 5% in Arium water
Table 1: 封閉液
Vivaspin超濾管系列具有的尖角死體積樣品安全保護(hù)技術(shù),防意外甩干,給珍貴的樣品更多一道保障!另外,根據(jù)蛋白的分子量和體積的不同,Vivaspin系列有多達(dá)24種不同選擇。樣品處理體積包括從100μl到20ml,截留分子量也涵蓋了2KDa到0.2um。
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