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          Octet垂釣技術(shù):中藥活性分子篩選新典范(文末福利)

          閱讀:280      發(fā)布時(shí)間:2024-6-20
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          中醫(yī)藥的作用機(jī)制是多層面且復(fù)雜的,涉及多種因素和機(jī)制。當(dāng)前研究面臨的一大挑戰(zhàn)就是發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)中醫(yī)藥在體內(nèi)作用靶點(diǎn)以及對(duì)應(yīng)的活性組分,從而闡釋其藥效作用的分子機(jī)制,為中醫(yī)藥作用機(jī)理提供了現(xiàn)代科學(xué)的闡釋。鑒定小分子藥物作用的靶蛋白對(duì)于理解小分子藥物的作用機(jī)制和應(yīng)用有著至關(guān)重要的作用,這不僅有助于進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)小分子藥物的脫靶靶標(biāo)、副作用,還能深入探究靶蛋白參與的生物學(xué)功能。

          長(zhǎng)期以來(lái),由于中藥成分的復(fù)雜性和微量化,對(duì)其靶點(diǎn)和分子機(jī)制的研究一直沒(méi)有取得重大進(jìn)展,對(duì)檢測(cè)和分析方法的靈敏度、粗樣品和有機(jī)溶劑的耐受度要求非常高。為突破這一研究瓶頸,北京大學(xué)的屠鵬飛課題組聯(lián)合浙江工業(yè)大學(xué)顏繼忠課題組發(fā)表最新的文章[1]參芪降糖顆粒(SJG)為例提出了一種結(jié)合傳統(tǒng)中藥微球和生物層干涉測(cè)量(BLI)技術(shù)的新方法,用于發(fā)現(xiàn)復(fù)雜基質(zhì)中的關(guān)鍵藥物靶點(diǎn)。

           

          參芪降糖顆粒(SJG) 是臨床上常用的治療2型糖尿病及其并發(fā)癥,如糖尿病腎病(DN)的中藥制劑。由人參、黃芪、地黃等11種草藥組成,但其干預(yù)DN的生物學(xué)靶點(diǎn)和機(jī)理仍不清楚。

           

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          圖1. 基于傳統(tǒng)中藥微球(TCM-MPs)的靶點(diǎn)捕釣策略:

          ①TCM-MPs的構(gòu)建

          ②TCM-MPs富集特異靶點(diǎn)

          ③用Octet® 進(jìn)一步垂釣相關(guān)化合物,并進(jìn)行驗(yàn)證

           

           

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          構(gòu)建TCM-MPs和靶蛋白富集

          ——以“粗”釣“粗”

           

          這些微球由四層結(jié)構(gòu)組成:Fe3O4磁性納米層、油酸修飾層、光親和基團(tuán)(TAD)層和活性小分子層。TAD在紫外光下產(chǎn)生高活性的卡賓,可以非特異的固化藥物分子。研究人員構(gòu)建了基于SJG的TCM-MPs被用于捕釣人腎小球系膜細(xì)胞(HMCs)裂解物中相關(guān)蛋白,利用TCM-MPs與細(xì)胞裂解液共孵育,通過(guò)UHPLC-Q/TOF-MS/MS分析篩選目標(biāo)蛋白,篩選出了28個(gè)差異蛋白?;谏镄畔W(xué)分析,研究人員選擇了GNAS作為關(guān)鍵靶點(diǎn)(圖2),該蛋白參與胰島素分泌和cAMP信號(hào)通路。

           

           

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          圖2. 活性成分靶蛋白鑒定

           

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          基于Octet® 非標(biāo)記分子互作分析系統(tǒng)垂釣GNAS相互作用的活性小分子

          ——以“單”釣“粗”

          研究者建立了一種基于Octet® 的垂釣技術(shù),其無(wú)流路設(shè)計(jì)允許多次垂釣,以富集低豐度且結(jié)合能力較弱的小分子,從而提升垂釣的成功率。研究人員將GNAS蛋白固化至Octet®  SA傳感器表面,再與中藥提取物結(jié)合,雖然中藥提取物是粗樣品成分復(fù)雜,且含有高濃度的DMSO,但是BLI技術(shù)對(duì)溶劑不敏感從而避免了傳統(tǒng)流路方法導(dǎo)致的系統(tǒng)堵塞和有機(jī)溶劑高折光率導(dǎo)致的假陽(yáng)性問(wèn)題,確保獲得高靈敏度且準(zhǔn)確的結(jié)果。隨后提取物被解離至緩沖液中,將解離液使用UHPLC-Q/TOF-MS/MS分析GNAS垂釣出的小分子。通過(guò)垂釣組與對(duì)照組的相對(duì)含量變化篩選26個(gè)小分子可能與GNAS有相互作用。

           

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          圖3. Octet® 垂釣結(jié)果:GNAS結(jié)合較強(qiáng)的化合物以及相對(duì)含量比值

           

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          活性小分子的驗(yàn)證

          Octet® 驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)其中7個(gè)化合物顯示出強(qiáng)結(jié)合活性,均是是SJG的主要成分。其中,黃芪中的Formononetin、高麗參的三七皂苷Ft1和人參皂苷中的甲素人參F2為“君”、地黃中的Catapol為“臣”,五味子中的五味子素A和茜草中的沒(méi)食子酸為“佐使”,符合中醫(yī)配伍“君臣佐使”原則。

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          圖4. Octet® 驗(yàn)證小分子和GNAS的結(jié)合

          參芪降糖顆粒(SJG)用于糖尿病腎病的治療,因此人腎小球系膜細(xì)胞(HMCs)是理想的細(xì)胞模型用于進(jìn)一步驗(yàn)證上述的小分子藥物活性,通過(guò)HMCs驗(yàn)證了垂釣出的活性成分對(duì)cAMP通路的影響,SJG及7種有效成分對(duì)高糖誘導(dǎo)的HMCs有保護(hù)作用。

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          圖5. 基于cAMP途徑驗(yàn)證活性化合物對(duì)GNAS下游通路的影響

          綜上所述,通過(guò)結(jié)合TCM-MPs富集策略和Octet® 垂釣技術(shù),研究者能夠有效地篩選出與GNAS直接相互作用的活性化合物,并驗(yàn)證了這些化合物通過(guò)激活cAMP通路的潛在藥理作用。該垂釣策略有望應(yīng)用于篩選與各種復(fù)雜系統(tǒng)作用相關(guān)的靶蛋白和關(guān)鍵靶蛋白中的生物活性成分,為基于靶標(biāo)的藥物發(fā)現(xiàn)提供有效的信息,對(duì)于中藥復(fù)雜體系的藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)具有重要意義。

           

          與傳統(tǒng)方法相比,使用Octet® 進(jìn)行垂釣的優(yōu)勢(shì)在于:

          • 提供多種傳感器固化已知分子,并且盡可能減少非特異性吸附

          • 通過(guò)垂釣的BLI信號(hào),可以判斷是否有物質(zhì)釣出

          • 可以自動(dòng)化多次循環(huán),在同一個(gè)孔里富集洗脫樣品

          • 由于Octet®采用非標(biāo)記實(shí)時(shí)技術(shù),可以對(duì)純化后的活性分子結(jié)合能力進(jìn)行更可準(zhǔn)確的驗(yàn)證

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          -參考文獻(xiàn)-

          [1] Zhang H, et al. Discovery of drug targets based on traditional Chinese medicine microspheres (TCM-MPs) fishing strategy combined with bio-layer interferometry (BLI) technology. Anal Chim Acta. 2024 May 29;1305:342542.

           

           

           

           

           

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