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          分子互作研習(xí)社|如何消除實(shí)驗(yàn)中的非特異性結(jié)合?

          閱讀:338      發(fā)布時(shí)間:2024-9-12
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          陳老師,空的傳感器怎么和分析物有非特異性吸附了?

          有多少信號(hào)呢?

          和有固化物的信號(hào)差不多呢


          很多科研人員在分子互作實(shí)驗(yàn)中,常常會(huì)遇到非特異性結(jié)合的問(wèn)題,今天陳老師就跟大家聊一聊固液反應(yīng)中普遍存在的非特異性結(jié)合?;诠桃悍磻?yīng)的檢測(cè)方法有很多:如親和層析、免疫標(biāo)記技術(shù)(ELISA)、微陣列芯片技術(shù)、SPR、BLI等。本文所使用的數(shù)據(jù)均來(lái)自基于Octet®非標(biāo)記分子互作分析系統(tǒng)的生物層干涉技術(shù)(BLI)固液反應(yīng)技術(shù)。

           

          Q1

          什么是非特異性結(jié)合?

          提到非特異性結(jié)合,有兩個(gè)含義:一是固化物與分析物之間的結(jié)合,但是這種結(jié)合并不是我們期望的。另外一個(gè)是指不發(fā)生在分析物與固化物質(zhì)之間的反應(yīng)。今天我們討論的是如何消除后者意義上的非特異性結(jié)合。而這種非特異性其中又包含了兩層意思:

           

          • 分析物直接與去除固化物的固相介質(zhì)結(jié)合

          • 分析物緩沖液中其他物質(zhì)(雜質(zhì))與有固化物的固相結(jié)合

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          圖1. a)分析物結(jié)合到空白傳感器;b)分析物緩沖液的組分結(jié)合固化物

          Q2

          非特異性作用使如何產(chǎn)生的?

           

          1 分析物與介質(zhì)之間的靜電作用:常用的介質(zhì)(如海藻酸和葡聚糖)在特定的pH下會(huì)帶有大量電荷。如果分析物帶有相反電荷,就容易形成基于庫(kù)侖力的靜電作用。

          2 分析物與介質(zhì)之間的疏水作用:如果雜質(zhì)或分析物是蛋白質(zhì)或帶有疏水基團(tuán)的化合物,而基質(zhì)也是蛋白質(zhì)(比如鏈霉親和素傳感器),就可能形成基于疏水作用的非特異性吸附。

          3 分析物與固化物之間的生物相似性:在基于捕獲的固化反應(yīng)中,分析物帶有與固化蛋白相同的標(biāo)簽。比如,用帶有His抗體的基質(zhì)固化His標(biāo)簽的蛋白,但如果分析物中有相同的標(biāo)簽,就很難避免His標(biāo)簽的分析物直接與固相反應(yīng)。

          4 雜質(zhì)的作用:在諸如血液、細(xì)胞裂解液等粗樣品中,雜質(zhì)產(chǎn)生的非特異性作用很普遍。一個(gè)典型的案例就是牛血清白蛋白(BSA)。作為一種常用的封閉試劑,由于來(lái)源和純化工藝的不同,一些廠商提供的BSA可能會(huì)帶有一定量的牛免疫球蛋白。

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          圖2. 用proA傳感器檢測(cè)IgG,因?yàn)榫彌_液中的BSA中含有牛免疫球蛋白,從而造成了很高的背景

          Q3

          如何減輕或者消除非特異性吸附?

          solution 1

          降低分析物濃度

          這種情況適合于有固化ligand的傳感器與分析物信號(hào)大大高于無(wú)ligand傳感器,但是非特異性信號(hào)依舊明顯。比如,1000nM和500nM的分析物濃度下有非特異性信號(hào),而250nM沒(méi)有,則把最高濃度改成250nM即可。

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          圖3. 左圖為高濃度結(jié)合曲線,右圖為降低濃度后結(jié)合曲線。綠色為有固化傳感器與分析物,黑色為同樣分析物濃度下非特異性信號(hào)。

          • 優(yōu)點(diǎn):不需要太多優(yōu)化實(shí)驗(yàn),操作簡(jiǎn)單。

          • 缺點(diǎn):使用條件有限。而且分析物濃度降低后,可能導(dǎo)致結(jié)合信號(hào)降低,可能需要延長(zhǎng)結(jié)合時(shí)間或者提高固化ligand的信號(hào)。

          solution 2

          增加封閉步驟或優(yōu)化分析緩沖液

          這是去除非特異的主要方法。為什么將看似兩種方法放在一起呢?因?yàn)橥ǔT诖_認(rèn)了最佳封閉試劑后,會(huì)將其添加到分析緩沖液中。例如,如果1%的酪蛋白封閉效果最好,一般分析緩沖液中也會(huì)含有1%的酪蛋白。

          然而,優(yōu)化緩沖液還包括增加鹽離子濃度、加入去污劑、調(diào)節(jié)pH等,具體見下表。

          image.png

          分析物緩沖液中一般加入tween20,濃度在0.02%—0.05%。

          • 優(yōu)點(diǎn):成本低,可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)一次性完成優(yōu)化。

          • 缺點(diǎn):可能會(huì)影響特異性結(jié)合,比如特異性結(jié)合主要依賴靜電作用,而非特異性也是靜電作用。如果提高鹽濃度,在降低非特異性的同時(shí),特異性信號(hào)也降低了。因此,必須要用特異性信號(hào)與非特異性信號(hào)的比值來(lái)判斷優(yōu)化的效果。

          下表顯示了在不同封閉緩沖液中,特異性信號(hào)(有固化物傳感器)與非特異性信號(hào)(無(wú)固化物傳感器)比值。使用Ni-NTA固相,可以看到在非特異性低的情況下,0.2%酪蛋白的封閉效果最好。

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          圖4展示了使用高濃度的鹽離子去除非特異性吸附。作者檢測(cè)CHO表達(dá)上清(粗樣品)中的EPO,發(fā)現(xiàn)固相與空載表達(dá)上清有很強(qiáng)的非特異性。然而,加入500mM的NaCl后,非特異性顯著降低。

          圖片

          圖4. 數(shù)據(jù)來(lái)自于Development of a VHH-Based Erythropoietin Quantification Assay.Mol Biotechnol,DOI 10.1007/s12033-015-9860-7

          solution 3

          更換固相的基質(zhì)或材料

          首先需要明確在檢測(cè)步驟前固相上的基質(zhì)有幾層。例如,在雙抗夾心ELISA中,涉及到96孔板的材質(zhì)和第一個(gè)抗體等膜層。如果第二個(gè)抗體如果直接和這些膜層結(jié)合,就會(huì)發(fā)生非特異性吸附。此時(shí),可以更換第一個(gè)抗體或者第二個(gè)抗體,甚至更換96孔板的材質(zhì),以減輕非特異性吸附。

          一些固相材料也可能由多層基質(zhì)組成,例如某些固相基質(zhì)主要是玻璃和氨基硅烷構(gòu)成,這些材質(zhì)上又鍍有鏈霉親和素或者海藻酸。如果與玻璃或者氨基硅烷有非特異性吸附,那么就只能用方法1、3、4去除非特異性吸附。如果與鏈霉親和素結(jié)合,可以更換基于海藻酸基質(zhì)的氨基偶聯(lián)的芯片。

          • 優(yōu)點(diǎn):可能從根本上去除非特異性吸附,并且保證特異性結(jié)合不受影響。

          • 缺點(diǎn):成本較大(比如SPR技術(shù)的金膜芯片),需要重新研發(fā)新介質(zhì)或者購(gòu)買新傳感器,并且很多傳感器介質(zhì)是個(gè)固定的,很難改變。

          solution 4

          固化物和分析物對(duì)換
          (如果固化物非特異性吸附)

          即固化之前的分析物,檢測(cè)固化物。

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          • 優(yōu)點(diǎn):不需要準(zhǔn)備新的試劑或者耗材。

          • 缺點(diǎn):有些技術(shù)實(shí)現(xiàn)起來(lái)非常困難,比如基于微陣列的方法以及基于雙抗夾心的方法。

          solution 5

          盡可能去除分析物中的雜質(zhì)

          比如,提高分析物的純度、提高緩沖試劑的質(zhì)量,或?qū)Υ謽悠愤M(jìn)行離心等簡(jiǎn)單處理。

          • 優(yōu)點(diǎn):可以順便提高純化和提取工藝。

          • 缺點(diǎn):耗時(shí)長(zhǎng)、成本高,并且某些檢測(cè)的初衷就是檢測(cè)粗樣品。

          solution 6

          計(jì)算扣除法

          即設(shè)置非特異性對(duì)照,并從所有數(shù)據(jù)均扣減非特異性信號(hào)。雖然這種方法有點(diǎn)“取巧”,但以下三種情況下可以使用計(jì)算扣除法:

          A

          在特異性信號(hào)遠(yuǎn)大于非特異性信號(hào)的時(shí),可以采用這個(gè)方法。

          B

          分析物濃度很高(比如μM蛋白濃度以上),且難以通過(guò)優(yōu)化緩沖液和封閉方法去除非特異性信號(hào)的時(shí)候,可以嘗試使用計(jì)算扣除法。

          C

          在實(shí)時(shí)檢測(cè)反應(yīng)中(比如SPR、BLI技術(shù)),如果特異性反應(yīng)的結(jié)合解離特點(diǎn)與非特異性反應(yīng)完全不一樣的時(shí)候可以計(jì)算扣除,比如前者是快解離快結(jié)合,后者是慢結(jié)合慢解離的時(shí)候。

          • 優(yōu)點(diǎn):不需進(jìn)行實(shí)驗(yàn)優(yōu)化。

          • 缺點(diǎn):比較主觀,一般來(lái)說(shuō)非特異性信號(hào)會(huì)影響特異性信號(hào)。因?yàn)樯飿悠返亩鄻有?,非特異性是不可避免的。然而,只要按照上面的方法,先弄清非特異性的種類,再進(jìn)行針對(duì)性的合理優(yōu)化,還是可以有效地消除非特異性結(jié)合。

           


          Octet®非標(biāo)記分子互作分析系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)

           

          非標(biāo)記Direct Binding是趨勢(shì),結(jié)果更準(zhǔn)確

          快速測(cè)定親和力,更加定量化地表征分子互作

          無(wú)洗滌步驟,可測(cè)弱親和力(解離快)

          寫入了美國(guó)藥典,文章多,認(rèn)可度廣

          萬(wàn)金油技術(shù),可以用與檢測(cè)DNA,小分子,蛋白質(zhì)等各種生物分子

          多種實(shí)驗(yàn)方案,除了直接測(cè)試,還有競(jìng)爭(zhēng)法,垂釣等

          操作簡(jiǎn)便,耗材及維護(hù)成本低

           

           

           

          圖片圖片

           

          《生物層干涉技術(shù)小分子應(yīng)用文集》

           

           

           

          下載文檔

           

           

          《生物層干涉技術(shù)小分子應(yīng)用文集》詳細(xì)介紹了生物層干涉(BLI)技術(shù)的原理,及其在小分子領(lǐng)域的多個(gè)應(yīng)用場(chǎng)景,并對(duì)BLI技術(shù)應(yīng)用于小分子研究的20余篇代表性文獻(xiàn)進(jìn)行了整理匯總:內(nèi)容涵蓋從防御機(jī)制到垂釣驗(yàn)證,再到小分子篩選、表征、優(yōu)化等多個(gè)方面,全展示了BLI技術(shù)在小分子研究中的強(qiáng)大潛力和實(shí)踐成果。

           


           

           

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