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關(guān)鍵詞:細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)
簡(jiǎn)介:世界*品牌細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)原裝,質(zhì)量保證,*。
細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達(dá)體系。
我們具備豐富的蛋白表達(dá)設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)及實(shí)驗(yàn)操作技巧,承諾客戶不成功不收費(fèi)。我們所有的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)真實(shí)可信,我們提供原始的表達(dá)菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實(shí)驗(yàn)報(bào)告重復(fù)我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
產(chǎn)品品牌: http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程:
細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定
16S rDAN是編碼原核生物核糖體小亞基rRNA(16S rRNA)的基因。 長度約為1500pb,是細(xì)菌分類學(xué)研究中zui常用、zui有用的"分子鐘16S rRNA其大小在1,500 bp左右,所代表的信息量適中,因此是進(jìn)行分類研究的理想材料。利用16S rDNA兩端的引物PCR擴(kuò)增未知菌株的16S rRNA基因,并進(jìn)行DNA測(cè)序,與GenBank中的已知序列進(jìn)行同源性比較后,判定細(xì)菌種類,將細(xì)菌劃分到屬或種。
提供擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA的全長序列,約1,500 bp,進(jìn)行進(jìn)行全序列測(cè)序,BLAST,以得到較為全面的種屬特異性信息,確定樣品的種類。
服務(wù)要求
1. 請(qǐng)?zhí)峁┗蚪MDNA、經(jīng)菌種分離后帶有單菌落的新鮮平板或斜面。
2. 基因組DNA的濃度≥10 ng/μl,總體積≥20 μl,且無明顯降解;平板或斜面應(yīng)長有分離的單菌落。
3. 由于革蘭氏陽性細(xì)菌或厭氧菌、放線菌等特殊菌株,請(qǐng)?jiān)诜?wù)委托書中加以說明。
4. 如果測(cè)序結(jié)果出現(xiàn)如下套峰,視為樣品不純,本公司將收取全額實(shí)驗(yàn)費(fèi)用。并建議克隆多個(gè)測(cè)序鑒定。
服務(wù)基本流程
1. 信諾金達(dá)進(jìn)行引物設(shè)計(jì)合成;
2. PCR擴(kuò)增16S rDNA;
3. PCR產(chǎn)物純化;
4. 測(cè)序,序列比對(duì)分析。
服務(wù)報(bào)告內(nèi)容
實(shí)驗(yàn)報(bào)告包括PCR產(chǎn)物照片、NCBI序列比對(duì)鑒定結(jié)果、測(cè)序報(bào)告、序列堿基圖、以及剩余模板;
服務(wù)編號(hào) 服務(wù)項(xiàng)目 內(nèi)容說明 價(jià)格 周期
SGSBD01 細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定 16S rDNA全序列比對(duì)分析 ¥400/樣品 1-2周*
SGSBD02 細(xì)菌16S rDNA菌種鑒定 16S rDNA全序列擴(kuò)增,克隆測(cè)序,比對(duì)分析 ¥1000/樣品 2周
*價(jià)格不含DNA提取費(fèi)用,如果樣品多或者特殊,時(shí)間協(xié)商。
技術(shù)特點(diǎn)
高通量:一次測(cè)序得到別以上條數(shù)的序列信息
高準(zhǔn)確性:從幾個(gè)到幾十萬個(gè)拷貝的計(jì)數(shù)
高分辨率:可以檢測(cè)至單堿基差異
重復(fù)性好:深度測(cè)序保證了檢測(cè)的隨機(jī)性,可不需技術(shù)重復(fù)
成本低耗時(shí)短:相比于Sanger測(cè)序,價(jià)格及成本要低很多
生物信息學(xué)分析內(nèi)容
標(biāo)準(zhǔn)信息分析
1. Reads拼接,獲取Unique tags
2. OTU生成及統(tǒng)計(jì)分析
3. 物種注釋及豐度統(tǒng)計(jì)
4. 樣品OTU及物種豐度Heatmap圖
5. Alpha多樣性分析
6. Beta多樣性分析
定制化信息分析
1. 樣品差異主要因子分析
2. 樣品間主坐標(biāo)分析(PCoA)
3. 樣品非加權(quán)配對(duì)平均法聚類分析(UPGMA)
4. 組間顯著性差異分析
5. 系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
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