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關(guān)鍵詞:半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)
簡(jiǎn)介:世界*品牌半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)原裝,質(zhì)量保證,*。
半定量RT-PCR技術(shù)服務(wù)|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達(dá)體系。
我們具備豐富的蛋白表達(dá)設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)及實(shí)驗(yàn)操作技巧,承諾客戶不成功不收費(fèi)。在獲得重組蛋白產(chǎn)品的同時(shí),我們也會(huì)提供相應(yīng)的原始數(shù)據(jù)和原始圖片,不需要再額外花費(fèi)精力重復(fù)實(shí)驗(yàn)。另一方面,我們所有的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)真實(shí)可信,我們提供原始的表達(dá)菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實(shí)驗(yàn)報(bào)告重復(fù)我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
產(chǎn)品品牌: http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程:
半定量RT-PCR參照的做法一般有兩種:
1) 將要比較的兩個(gè)樣品的BETA-ACTIN 調(diào)成一樣的亮度,然后就可以直接比較目的基因的亮度了。方法的結(jié)果比較直觀,但較費(fèi)事。
2) 不進(jìn)行調(diào)平,一個(gè)樣品里將目的基因和BETA-ACTIN直接比較,用軟件就可以做到,然后將不同樣品的這個(gè)比值進(jìn)行比較就可以了。方法比較簡(jiǎn)單,但結(jié)果不夠直觀。
1.每個(gè)標(biāo)本都要做自己的內(nèi)參,不能用同一個(gè)內(nèi)參!
2.每個(gè)標(biāo)本在實(shí)際做前都要摸*循環(huán)數(shù),包括內(nèi)參,但內(nèi)參的循環(huán)數(shù)不一定要和目的基因一樣,都要選擇上升期的中間數(shù)作為*循環(huán)數(shù),否則進(jìn)入平臺(tái)期就沒有可比性了!所以內(nèi)參要有它自己的*循環(huán)數(shù)!
3.電泳掃描后,計(jì)算灰度值,先用同一標(biāo)本的內(nèi)參和目的進(jìn)行比較,然后用這個(gè)相對(duì)值再去和其他你所要比較的平行組進(jìn)行比較,一般每組4個(gè)樣本以上。
1 樣品RNA的抽提
①取凍存已裂解的細(xì)胞,室溫放置5分鐘使其*溶解。
②兩相分離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的氯仿,蓋緊管蓋。手動(dòng)劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的紅色酚氯仿相,中間層以及無(wú)色水相上層。RNA全部被分配于水相中。水相上層的體積大約是勻漿時(shí)加入的TRIZOL試劑的60%。
③RNA沉淀 將水相上層轉(zhuǎn)移到一干凈無(wú)RNA酶的離心管中。加等體積異丙醇混合以沉淀其中的RNA,混勻后15到30℃孵育10分鐘后,于4℃下12000rpm 離心10分鐘。此時(shí)離心前不可見的RNA沉淀將在管底部和側(cè)壁上形成膠狀沉淀塊。
④RNA清洗 移去上清液,每1mlTRIZOL試劑裂解的樣品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀?;靹蚝螅?℃下7000rpm離心5分鐘。
⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室溫空氣中干燥5-10分鐘。
⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA時(shí),先加入無(wú)RNA酶的水40μl用槍反復(fù)吹打幾次,使其*溶解,獲得的RNA溶液保存于-80℃待用。
2 RNA質(zhì)量檢測(cè)
1)紫外吸收法測(cè)定
先用稀釋用的TE溶液將分光光度計(jì)調(diào)零。然后取少量RNA溶液用TE稀釋(1:100)后,讀取其在分光光度計(jì)260nm和280nm處的吸收值,測(cè)定RNA溶液 濃度和純度。
① 濃度測(cè)定
A260下讀值為1表示40 μg RNA/ml。樣品RNA濃度(μg/ml)計(jì)算公式為:A260 ×稀釋倍數(shù)× 40 μg/ml。具體計(jì)算如下:
RNA溶于40 μl DEPC水中,取5ul,1:100稀釋至495μl的TE中,測(cè)得A260 = 0.21
RNA 濃度= 0.21 ×100 ×40 μg/ml = 840 μg/ml 或 0.84 μg/μl
取5ul用來(lái)測(cè)量以后,剩余樣品RNA為35 μl,剩余RNA總量為:
35 μl × 0.84 μg/μl = 29.4 μg
②純度檢測(cè)
RNA溶液的A260/A280的比值即為RNA純度,比值范圍1.8到2.1。
2)變性瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定
①制膠
1g瓊脂糖溶于72ml水中,冷卻至60℃,10 ml的10× MOPS電泳緩沖液和18 ml的37% 甲醛溶液(12.3 M)。
10×MOPS電泳緩沖液
濃度 成分
0.4M MOPS,pH 7.0
0.1M 乙酸鈉
0.01M EDTA
灌制凝膠板,預(yù)留加樣孔至少可以加入25 μl溶液。膠凝后取下梳子,將凝膠板放入電泳槽內(nèi),加足量的1×MOPS電泳緩沖液至覆蓋膠面幾個(gè)毫米。
②準(zhǔn)備RNA樣品
取3μgRNA,加3倍體積的甲醛上樣染液,加EB于甲醛上樣染液中至終濃度為10μg/ml。加熱至70℃孵育15分鐘使樣品變性。
③電泳
上樣前凝膠須預(yù)電泳5min,隨后將樣品加入上樣孔。5–6V/cm電壓下2h,電泳至溴酚蘭指示劑進(jìn)膠至少2–3cm。
3,待測(cè)樣品的待測(cè)基因?qū)崟r(shí)定量PCR
①所有cDNA樣品分別配置實(shí)時(shí)定量 PCR反應(yīng)體系。
體系配置如下:
序號(hào) 反應(yīng)物 劑量
1 SYBR Green 1 染料 10 ul
2 上游引物 1ul
3 下游引物 1ul
4 dNTP 1ul
5 Taq聚合酶 2ul
6 待測(cè)樣品cDNA 5ul
7 ddH2O 30ul
8 總體積 50 ul
輕彈管底將溶液混合,6000rpm短暫離心。
②將配制好的PCR反應(yīng)溶液置于Realtime PCR儀上進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。反應(yīng)條件為:93℃2分鐘預(yù)變性,然后按93℃ 1分鐘,55℃1分鐘,72℃1分鐘,共40做個(gè)循環(huán),zui后72℃7分鐘延伸。
4, 實(shí)時(shí)定量PCR使用引物列表
引物設(shè)計(jì)軟件:Primer Premier 5.0,并遵循以下原則:引物與模板的序列緊密互補(bǔ);引物與引物之間避免形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結(jié)構(gòu);引物不在模板的非目的位點(diǎn)引發(fā)DNA 聚合反應(yīng)(即錯(cuò)配)。
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