費氏弧菌發(fā)光桿菌作為自然界第二大類生物，是天然藥物創(chuàng)制的重要來源。然而，大量真菌基因組測序表明，真菌中超過 90% 的次級代謝產(chǎn)物合成基因簇處于沉默狀態(tài)，極大地限制了新代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)及其合成機制研究。中國科學院微生物研究所真菌學國家重點實驗室研究員尹文兵課題組針對真菌中大量“隱秘”基因簇的問題，長期從事從基因到次級代謝產(chǎn)物的研究，主要方向包括真菌次級代謝產(chǎn)物激活、生物合成及其調(diào)控機制研究，近一年來取得了三個具有系統(tǒng)性和原創(chuàng)性的成果。
“這三個成果是天然產(chǎn)物發(fā)現(xiàn)及后續(xù)改造利用的上游和下游的關(guān)系。”尹文兵解釋。
*個成果是使用表觀遺傳策略挖掘真菌天然產(chǎn)物多樣性。他們通過對植物內(nèi)生真菌無花果擬盤多毛孢中的表觀遺傳調(diào)控因子進行定向遺傳敲除，發(fā)現(xiàn)該菌的次級代謝產(chǎn)物指紋圖譜發(fā)生了巨大變化，從中分離鑒定得到了 15 個新的聚酮類天然產(chǎn)物，并通過同位素示蹤法闡釋了產(chǎn)物 Ficiolide A 的合成途徑。
“我們通過對遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)進行改良，大大縮短了真菌轉(zhuǎn)化的周期，該研究為新天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)提供了的方法。”
在此基礎(chǔ)上，科學家們開展了生物合成機制研究，闡明重要生防菌淡紫擬青霉中脂肽類抗生素 leucinostatins 的生物合成途徑。
在與中國農(nóng)業(yè)科學研究院蔬菜花卉研究所研究員謝丙炎課題組的合作下，科學家們通過對淡紫擬青霉進行基因組測序并結(jié)合比較基因組學分析，預(yù)測了脂肽類抗生素 leucinostatins 的合成基因簇。再通過對候選基因的遺傳敲除，鑒定了 leucinostatins 的合成基因簇，并且解析了其合成途徑。這一工作對防治植物線蟲等多種病蟲害藥物的開發(fā)奠定了理論基礎(chǔ)。
此后，尹文兵又和北京大學藥學院葉敏團隊合作，費氏弧菌發(fā)光桿菌將真菌糖基轉(zhuǎn)移酶應(yīng)用于天然產(chǎn)物成藥性改善。
T細胞調(diào)控相關(guān)蛋白抗體 英文縮寫： CRTAM
突觸后蛋白CRIPT抗體 英文縮寫： CRIPT
鈣粘附蛋白8抗體 英文縮寫： Cadherin 8
6號染色體開放閱讀框174抗體 英文縮寫： C6orf174
6號染色體開放閱讀框150抗體 英文縮寫： C6orf150
X染色體開放閱讀框56抗體 英文縮寫： CXorf56
9號染色體開放閱讀框152抗體 英文縮寫： C9orf152
6號染色體開放閱讀框58抗體 英文縮寫： C6orf58
接觸蛋白相關(guān)蛋白4抗體 英文縮寫： CNTNAP4
CD24抗體 英文縮寫： CD24
接觸蛋白相關(guān)蛋白3抗體 英文縮寫： CNTNAP3
CD24抗體 英文縮寫： CD24
限局性核因子3抗體 英文縮寫： NLF3
胰羧肽酶A6抗體 英文縮寫： CPA6
費氏弧菌發(fā)光桿菌
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