Rubicon RB4406/R400406 ThruPLEX DNA-seq 48D Kit DNA測(cè)序試劑盒紅榮微再授權(quán)代理基因測(cè)序試劑盒

美國(guó)Rubicon Genomics---單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建的

Rubicon 6DNA測(cè)序試劑盒紅榮微再授權(quán)代理

1. 二代測(cè)序建庫(kù)試劑（微量起始樣品 50pg - 50ng）

2. 單細(xì)胞擴(kuò)增和單細(xì)胞測(cè)序建庫(kù)試劑（廣泛應(yīng)用于生殖領(lǐng)域，是該領(lǐng)域的金標(biāo)準(zhǔn)。）

3. 全RNA擴(kuò)增試劑 （微量起始樣品，可以低至10個(gè)細(xì)胞的總RNA）

Rubicon Genomics成立于2000年，總部位于美國(guó)密歇根州。該公司的核心競(jìng)爭(zhēng)力產(chǎn)品包括酶學(xué)、核酸化學(xué)、樣品的加工生產(chǎn)，該公司致力于創(chuàng)新、知識(shí)產(chǎn)權(quán)的發(fā)展和持續(xù)的產(chǎn)品開(kāi)發(fā)。

Rubicon Genomics開(kāi)發(fā)創(chuàng)新、高品質(zhì)的、核酸文庫(kù)的制備及配套產(chǎn)品，RB4406/R400406，能夠?qū)εR床樣本進(jìn)行簡(jiǎn)單、快速可靠和高靈敏度的分析。

Rubicon Genomics，總部位于美國(guó)密歇根州，產(chǎn)品主要包括以下幾類(lèi)：

【主要產(chǎn)品】

1. ThruPLEX® Plasma-seq Kit

2. ThruPLEX® DNA-seq Kit

3. PicoPLEX® DNA-seq Kit

4. PicoPLEX® WGA Kit

5. TransPLEX® C-WTA Kit

【Rubicon RB4523/R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit DNA測(cè)序試劑盒產(chǎn)品應(yīng)用】

1. 外顯子組富集

2. SureSelect® 富集

3. SeqCap® EZ 富集

4. 福爾馬林固定石蠟包埋DNA測(cè)序

5. 胚胎植入前遺傳學(xué)篩查(PGS）/種植前遺傳學(xué)診斷（PGD）

6. DNA測(cè)序

7. RNA測(cè)序

8. 染色體免疫共沉淀測(cè)序

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提供產(chǎn)品：華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司-紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司為中國(guó)再生醫(yī)學(xué)和生物工程技術(shù)領(lǐng)域的組織器官再生研究、組織器官功能重建研究、干細(xì)胞技術(shù)研究、組織工程生物支架材料研究、醫(yī)療器械產(chǎn)品等再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)業(yè)鏈的相關(guān)客戶(hù)提供：iPS/ES胚胎干細(xì)胞的種子細(xì)胞、心肌細(xì)胞、人源肝臟細(xì)胞、MSC間充質(zhì)干細(xì)胞、基底膜基質(zhì)膠細(xì)胞支架、干細(xì)胞生長(zhǎng)分化調(diào)控因子、干細(xì)胞藥物研究的小分子抑制劑、調(diào)節(jié)劑、小分子化合物、功能膠原蛋白生物材料、3D細(xì)胞培養(yǎng)基質(zhì)膠、器官模型3D打印技術(shù)材料、神經(jīng)干細(xì)胞培養(yǎng)基、STEM121抗體、BD科研P100、P800蛋白質(zhì)組學(xué)管、BD血漿準(zhǔn)備管PPT管、BD PAXgene全血RNA樣本收集管、BD公司CPT/PRP美容管、Streck Cell-Free RNA BCT游離RNA樣本收集管、Streck Cell-Free DNA Urine Preserve游離DNA尿液保存管、Streck Cell-Free DNA BCT游離DNA管、循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTC及無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)管、illumina高品質(zhì)NGS文庫(kù)制備試劑盒、ThruPLEX ctDNA測(cè)序試劑盒、全基因組測(cè)序、全外顯子測(cè)序、靶向測(cè)序、ChIP-Seq測(cè)序、CNV和染色體異倍性分析、Rubicon Genomics單細(xì)胞全基因組測(cè)序試劑盒、生物醫(yī)學(xué)試劑耗材儀器等種類(lèi)豐富的產(chǎn)品，以“Focus on Tissue and Organ Regeneration專(zhuān)注組織器官再生與功能重建"為己任，我們與客戶(hù)攜手為中國(guó)再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展而前行。

【Rubicon Genomics公司 基因測(cè)序試劑盒產(chǎn)品詳情】

Rubicon RB4406/R400406 ThruPLEX DNA-seq 48D Kit DNA 基因測(cè)序試劑盒的綜合介紹

Rubicon 6DNA測(cè)序試劑盒紅榮微再授權(quán)代理

Illumina測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建

ThruPLEX^® DNA-seq Kit

· 高靈敏度、高性能：以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料
· 完整的文庫(kù)構(gòu)建試劑：優(yōu)化的檢索引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無(wú)核酸酶水
· 快速簡(jiǎn)便的工作流程：單管或單孔3步操作，2小時(shí)，無(wú)需轉(zhuǎn)移操作
· 兼容主流目標(biāo)區(qū)域富集平臺(tái)：Agilent SureSelect^®, Roche Nimblegen^® SeqCap^® EZ   及 IDT xGen^® Lockdown^® probes

■ 產(chǎn)品說(shuō)明：

ThruPLEX DNA-seq Kit 基于新的ThruPLEX 技術(shù)，可以低至50 pg的DNA起始構(gòu)建DNA文庫(kù)，在提高靈敏度的同時(shí)可以構(gòu)建多達(dá)96種檢索引物文庫(kù)。本試劑適用于多種樣品來(lái)源的片段化DNA樣品，基因組DNA或體液樣品如游離DNA，F(xiàn)FPE樣品來(lái)源DNA和cDNA。ThruPLEX DNA-seq Kit 整體流程可以在單管或單孔中進(jìn)行，約2個(gè)小時(shí)即可完成，無(wú)需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟。試劑盒提供12、48或96種Illumina單端或雙端檢索引物，該系列引物保存在反應(yīng)管中(6或12)或預(yù)分裝密封于條形碼標(biāo)記的微孔板中。ThruPLEX DNA-seq Kit 可以用于DNA-seq，RNA-seq，ChIP-seq，并且可以兼容主流平臺(tái)實(shí)現(xiàn)強(qiáng)有力的目標(biāo)區(qū)域富集。

圖1. ThruPLEX DNA-seq Kit單管操作流程。

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提供產(chǎn)品：華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司-紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司為中國(guó)再生醫(yī)學(xué)和生物工程技術(shù)領(lǐng)域的組織器官再生研究、組織器官功能重建研究、干細(xì)胞技術(shù)研究、組織工程生物支架材料研究、醫(yī)療器械產(chǎn)品等再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)業(yè)鏈的相關(guān)客戶(hù)提供：iPS/ES胚胎干細(xì)胞的種子細(xì)胞、心肌細(xì)胞、人源肝臟細(xì)胞、MSC間充質(zhì)干細(xì)胞、基底膜基質(zhì)膠細(xì)胞支架、干細(xì)胞生長(zhǎng)分化調(diào)控因子、干細(xì)胞藥物研究的小分子抑制劑、調(diào)節(jié)劑、小分子化合物、功能膠原蛋白生物材料、3D細(xì)胞培養(yǎng)基質(zhì)膠、器官模型3D打印技術(shù)材料、神經(jīng)干細(xì)胞培養(yǎng)基、STEM121抗體、BD科研P100、P800蛋白質(zhì)組學(xué)管、BD血漿準(zhǔn)備管PPT管、BD PAXgene全血RNA樣本收集管、BD公司CPT/PRP美容管、Streck Cell-Free RNA BCT游離RNA樣本收集管、Streck Cell-Free DNA Urine Preserve游離DNA尿液保存管、Streck Cell-Free DNA BCT游離DNA管、循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTC及無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)管、illumina高品質(zhì)NGS文庫(kù)制備試劑盒、ThruPLEX ctDNA測(cè)序試劑盒、全基因組測(cè)序、全外顯子測(cè)序、靶向測(cè)序、ChIP-Seq測(cè)序、CNV和染色體異倍性分析、Rubicon Genomics單細(xì)胞全基因組測(cè)序試劑盒、生物醫(yī)學(xué)試劑耗材儀器等種類(lèi)豐富的產(chǎn)品，以“Focus on Tissue and Organ Regeneration專(zhuān)注組織器官再生與功能重建"為己任，我們與客戶(hù)攜手為中國(guó)再生醫(yī)學(xué)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展而前行。

圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術(shù)概要。ThruPLEX技術(shù)以片段化雙鏈DNA起始(0.05 ng至50 ng)只需3步反應(yīng)，簡(jiǎn)單高效。

圖3. ThruPLEX DNA-seq Kit 優(yōu)于其他NGS文庫(kù)制備試劑。與其他試劑相比，ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA，構(gòu)建多樣性更好（左圖），重復(fù)更少（右圖）的文庫(kù)（25 M read pairs）。NGS文庫(kù)分別采用圖示對(duì)照gDNA起始量，以相應(yīng)的文庫(kù)制備試劑制備，采用MiSeq v3 flow cell測(cè)序。
*數(shù)據(jù)來(lái)源于Takara Bio Inc.

圖4. ThruPLEX DNA-seq Kit 減少了GC偏差。以人類(lèi)基因組相對(duì)覆蓋度為GC含量（%）的函數(shù)（50 ng DNA起始）。（左圖）ThruPLEX DNA-seq Kit 在整個(gè)范圍內(nèi)都有出色的覆蓋。（右圖）ThruPLEX DNA-seq Kit （金色）與參試的其他試劑一樣好或更好。請(qǐng)注意，在這些圖中的覆蓋度應(yīng)該為1。人類(lèi)基因組中的GC含量分布以紅色柱形圖表示。
*數(shù)據(jù)來(lái)源于Takara Bio Inc.

圖5. ThruPLEX DNA-seq Kit的起始量更低、范圍更廣。與其他試劑相比，ThruPLEX DNA-seq Kit的起始量靈敏度是其他試劑的20倍，起始量范圍從50 pg至50 ng，無(wú)需流程或接頭濃度優(yōu)化，并且包含檢索引物和接頭。

圖6. ThruPLEX DNA-seq Kit工作流程優(yōu)勢(shì)：2小時(shí)即可獲得高質(zhì)量NGS文庫(kù)。ThruPLEX DNA-seq Kit將雙鏈DNA制備成檢索引物文庫(kù)只需3步：末端修復(fù)，接頭連接，及高保真文庫(kù)擴(kuò)增。 簡(jiǎn)化的工作流程，在單管或單孔中2個(gè)小時(shí)即可完成，避免樣品損失及操作誤差。

■ ThruPLEX DNA-seq Kit產(chǎn)品組成

· Template Preparation Buffer（Red）
· Template Preparation Enzyme（Red）
· Library Synthesis Buffer（Yellow）
· Library Synthesis Enzyme（Yellow）
· Library Amplification Buffer（Green）
· Library Amplification Enzyme（Green）
· Nuclease-Free Water（Clear）
· Indexing Reagent（Blue）or Indexing Plate

■ ThruPLEX DNA-seq Kit保存  －20℃

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2017年1月，Rubicon Genomics，Inc.成為T(mén)akara Bio的一員，現(xiàn)在寶日醫(yī)生物技術(shù)（北京）有限公司（Takara Bio北京分公司）開(kāi)始在國(guó)內(nèi)銷(xiāo)售Rubicon公司開(kāi)發(fā)的下一代測(cè)序試劑。Rubicon公司成立于2000年，公司總部位于美國(guó)密歇根州。Rubicon公司開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品主要基于“ThruPLEX®技術(shù)"和“PicoPLEX®技術(shù)"，可以微量DNA起始構(gòu)建下一代測(cè)序文庫(kù)。ThruPLEX®技術(shù)"可從血漿中的微量游離DNA構(gòu)建高多樣性文庫(kù)，準(zhǔn)確檢測(cè)低豐度DNA變異，用途廣泛?！癙icoPLEX®技術(shù)"，可從單細(xì)胞等微量DNA起始構(gòu)建高重復(fù)再現(xiàn)性文庫(kù)，用于拷貝數(shù)變異分析和染色體異倍性分析。Rubicon產(chǎn)品豐富了Takara基于SMART®技術(shù)的下一代測(cè)序產(chǎn)品線(xiàn)，為科研工作者在基因組學(xué)、單細(xì)胞和臨床應(yīng)用研究等領(lǐng)域提供更多解決方案。代表產(chǎn)品之一為：Rubicon Genomics RB3050/R30050 PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒Whole Genome Amplification from Single Cells。

2016年年底，TAKARA寶日醫(yī)生物技術(shù)（北京）有限公司的市場(chǎng)部部長(zhǎng)與寶生物工程（大連）有限公司的銷(xiāo)售部部長(zhǎng)分別從北京和大連飛往上海，對(duì)華雅再生醫(yī)學(xué)的旗艦營(yíng)銷(xiāo)公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司進(jìn)行了實(shí)地考察，雙方深入地探討了未來(lái)干細(xì)胞及再生醫(yī)學(xué)市場(chǎng)發(fā)展的趨勢(shì)和方向，在雙方公司中長(zhǎng)期發(fā)展戰(zhàn)略上，志同道合地看好再生醫(yī)學(xué)市場(chǎng)的發(fā)展前景，歷史性的醫(yī)療革命是我們這代人肩負(fù)的偉大使命！

TAKARA公司日本總部是：“iPS干細(xì)胞之父"諾貝爾獎(jiǎng)獲得者的故鄉(xiāng)，具有zui前沿的iPS干細(xì)胞技術(shù)實(shí)力，TAKARA公司旗下的Cellartis子公司，擁有超過(guò)40人的研發(fā)團(tuán)隊(duì)，擁有超過(guò)15年的人干細(xì)胞研究經(jīng)驗(yàn)，建立并儲(chǔ)存大量的人iPS和ES細(xì)胞系。TAKARA旗下的Stem Cells公司SC Proven系列：憑借20多年干細(xì)胞技術(shù)經(jīng)驗(yàn)研發(fā)，包括干細(xì)胞研究用培養(yǎng)基、抗體等耗材，具有龐大的客戶(hù)群(美國(guó)、歐洲、日本)。

2017年TAKARA寶生物日本總部又收購(gòu)了：美國(guó)Rubicon Genomics單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建的，代表性產(chǎn)品之一為：Rubicon Genomics RB3050/R30050 PicoPLEX® WGA Kit 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒Whole Genome Amplification from Single Cells，ThruPLEX® Plasma-seq Kit，ThruPLEX® DNA-seq Kit，PicoPLEX® DNA-seq Kit，PicoPLEX® WGA Kit， TransPLEX® C-WTA Kit.

• ThruPLEX DNA-seq kit可以使用什么樣的樣品和投入？

ThruPLEX DNA-seq試劑盒設(shè)計(jì)用于各種各樣的DNA樣品，其量在50pg和50ng之間變化。為了確保實(shí)驗(yàn)提供高品質(zhì)的數(shù)據(jù)，下表提供了一系列的依據(jù)（1）應(yīng)用程序和（2）的源材料的人DNA的推薦的輸入量。您選擇使用的實(shí)際數(shù)量可能與以下建議的不同。注意，隨著輸入DNA的量減少，文庫(kù)的多樣性也可能降低

應(yīng)用輸入樣品量（50 - 500 bp ds DNA）推薦輸入量

WGS，WES，SNV，indels，SNP，STR gDNA 10 - 50 ng

FFPE DNA 100 ng

血漿DNA 1 - 50 ng

CNV血漿，gDNA或FFPE DNA 50 pg - 100 ng *

ChIP-seq ChIP DNA 50 pg - 50 ng *

RNA-seq cDNA 50 pg - 50 ng *

*科學(xué)出版物中引用少于50 pg的用途。

• ThruPLEX DNA-seq Kit是否與任何目標(biāo)濃縮系統(tǒng)兼容？

是的，ThruPLEX DNA-seq的套件是與主要外顯子組和靶向富集產(chǎn)品，包括安捷倫SureSelect®，羅氏NimbleGen®SeqCap®EZ和自定義面板兼容。 ThruPLEX DNA-seq Kit目標(biāo)富集方案和應(yīng)用筆記可以在這里訪(fǎng)問(wèn)。

• 我購(gòu)買(mǎi)了一種ThruPLEX DNA-seq 48D試劑盒，一次使用4-5個(gè)樣品。為什么我用完試劑？

ThruPLEX DNA-SEQ試劑盒的試劑包含足夠的體積，以制備主混合物四次，隨著時(shí)代的索引試劑應(yīng)使用的號(hào)碼*（zui多4個(gè)冷凍/解凍循環(huán)）。當(dāng)訪(fǎng)問(wèn)套件超過(guò)四次時(shí)，我們不能保證有足夠的試劑量可用。

• ThruPLEX DNA-seq是否有足夠的過(guò)量填充以在我的自動(dòng)化設(shè)備上使用？

每個(gè)自動(dòng)化平臺(tái)都有自己的死體積和試劑要求;因此，ThruPLEX DNAs-seq Kit中試劑的體積可能不能提供手動(dòng)進(jìn)行的預(yù)期反應(yīng)數(shù)。

• 剪切后，我需要對(duì)DNA樣本進(jìn)行清理嗎？

沒(méi)有，只是繼續(xù)到ThruPLEX DNA-seq的試劑盒使用手冊(cè)中的模板制備步驟（第直噴），以維護(hù)您的總DNA和圖書(shū)館的整體多樣性。

• ThruPLEX DNA-seq Kit可以使用什么樣的DNA樣本？

分離的雙鏈DNA，如：

機(jī)械剪切DNA

酶切片段DNA

來(lái)自血漿，尿液和其他生物流體的低分子量無(wú)細(xì)胞DNA

雙鏈cDNA

染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）DNA

來(lái)自福爾馬林固定材料（FFPE）的超聲處理DNA

• RNA可以與ThruPLEX DNA-seq Kit一起使用嗎？

是的，但是在使用ThruPLEX DNA-seq Kit制備之前，需要將RNA轉(zhuǎn)化為雙鏈cDNA并將其片段化至適當(dāng)?shù)拇笮　?/span>

• 血漿，尿液或其他生物流體可以直接與ThruPLEX DNA-seq Kit一起使用嗎？

不，模板DNA必須首先用DNA提取/純化試劑盒提取。由于來(lái)自這些來(lái)源的DNA通常被降解/分裂，所以不需要額外的分裂。樣品中使用的體積

ThruPLEX DNA-seq Kit必須不超過(guò)10μL。

• 我可以為單端和雙端NGS測(cè)序準(zhǔn)備樣品嗎？

是的，ThruPLEX DNA-seq Kit與單端和雙向序列測(cè)序兼容。zui終擴(kuò)增的文庫(kù)將包含與Illumina相容的索引序列。

• ThruPLEX DNA-seq Kit是否需要DNA樣本輸入體積？

是的，所需的DNA樣品量為10μL。

出版物：

無(wú)細(xì)胞DNA包含通知其原始組織的體內(nèi)核小體足跡。 Snyder等。

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Rubicon ThruPLEX DNA-seq 48D Kit DNA 基因測(cè)序試劑盒產(chǎn)品規(guī)格

SPECIFICATIONS

Store at -20 °C.

Guaranteed for 9 months at -20 °C in a constant temperature freezer.

Ordering Information

CAT. NO. R400406 ThruPLEX DNA-seq 48D Kit (48 reactions, 48 dual indexes)

CAT. NO. R400407 ThruPLEX DNA-seq 96D Kit (96 reactions, 96 dual indexes)

CAT. NO. R400427 ThruPLEX DNA-seq 48S Kit (48 reactions, 48 single indexes)

CAT. NO. R400428 ThruPLEX DNA-seq 12S (48) Kit (48 reactions, 12 single indexes)

CAT. NO. R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S (12) Kit (12 reactions, 6 single indexes)

ThruPLEX DNA-seq contains everything needed, including indexes in a barcoded 96-well plate.

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