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江口蘿卜豬UCP3 基因變異及其表達量與肉質(zhì)性狀關聯(lián)性分析
閱讀:1253 發(fā)布時間:2021-5-28提 供 商 | 上海騰拔儀器科技有限公司 | 資料大小 | 2.2MB |
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解耦聯(lián)蛋白(uncoupling protein, UCPs)是線粒體上的質(zhì)子載體,以質(zhì)子漏方式把H+從外膜傳遞到內(nèi)膜(Ricquier, Frédéric, 2000)。在氧化磷酸化過程中,可以降低膜內(nèi)外的電化學梯度,在電子傳遞過程中實現(xiàn)質(zhì)子回流,從而起到讓呼吸鏈與ATP合成過程解耦聯(lián)的作用,使能量以熱能的形式散發(fā),氧化磷酸化合成ATP 的效率下降(張雷等, 2010)。UCP3 基因是UCPs 家族成員之一,與UCP2 基因緊密連鎖并定位于豬的9 號染色體(Stone et al.,2015)。當受到脂肪酸刺激時,UCP3 基因表達量上調(diào),且UCP3 蛋白參與脂肪酸和其他陰離子跨膜轉(zhuǎn)運(Lapice et al., 2017)。UCP3 活性對脂肪酸氧化和氨基酸代謝及其相關的生化途徑具有重要調(diào)節(jié)作用(Aguer et al., 2016)。所以,很多畜禽研究者將其作為一個影響肉品質(zhì)的重要功能候選基因展開研究。方美英等(2002)在對豬(Sus scrofa) UCP3 基因多態(tài)性的研究中,在內(nèi)含子3 發(fā)現(xiàn)了T272G變異位點。李艷華等(2006)分析了長白豬、杜洛克等5個國內(nèi)外豬種UCP3 基因的多態(tài)位點,發(fā)現(xiàn)位于啟動子區(qū)的SNPs位點會造成轉(zhuǎn)錄因子結合位點的改變,影響對UCP3 基因的轉(zhuǎn)錄和調(diào)控,從而影響豬的生產(chǎn)性能。陳哲(2011)在UCP3 基因cDNA上檢測到A448G突變位點,并發(fā)現(xiàn)該位點等位基因A對于改善豬脂肪性狀具有積極作用。王陽等(2011)研究發(fā)現(xiàn)UCP3 參與豬骨骼肌細胞脂肪代謝的調(diào)節(jié),從而影響地方豬種的肉質(zhì)和其他性狀。但是關于UCP3 基因表達量與肉質(zhì)性能之間的相關性尚未見研究報道。
本研究以貴州優(yōu)良地方品種江口蘿卜豬為實驗材料,屠宰后測定其11 項主要肉質(zhì)性能指標,并提取背最長肌中的基因組DNA建立混合DNA池,擴增UCP3 基因全部外顯子并測序,初步篩選多態(tài)位點,然后以單個樣本DNA為模板,擴增篩選到的位點對應外顯子,用以測序驗證并分型。對應肉質(zhì)指標,對不同基因型豬進行肉質(zhì)性能差異分析。提取背最長肌總RNA,檢測不同基因型江口蘿卜豬背最長肌中UCP3 基因的平均表達量做差異顯著性分析,分析基因型、表達量與及肉質(zhì)性能三者之間的關聯(lián)性,以期探尋UCP3 基因多態(tài)性對江口蘿卜豬肉質(zhì)性能的影響,為科學的選種選育提供基礎材料。