做了這么多年的分子實(shí)驗(yàn),對于其中的工具酶大家都了解嗎?他們的作用原理都知道嗎?本期Absin分子小課堂小愛要教大家如何分清這些復(fù)雜的酶。
工具酶是一類在DNA重組過程中,用于不同DNA分子的制備、切割、修飾、擴(kuò)增、核酸分子的標(biāo)記以及核苷酸序列測定的酶的統(tǒng)稱,是基因重組技術(shù)所需的工具。根據(jù)催化反應(yīng)特性可分為限制性內(nèi)切酶、聚合酶、連接酶、逆轉(zhuǎn)錄酶等多種類型。
限制性內(nèi)切酶
限制性內(nèi)切酶主要從原核生物中發(fā)現(xiàn),以內(nèi)切方式水解核酸中磷酸二酯鍵,對外源性的DNA進(jìn)行切割、水解,被稱為“基因剪刀"。限制酶來源于細(xì)菌的“限制—修飾"系統(tǒng),最早發(fā)現(xiàn)于20世紀(jì)60年代末。根據(jù)限制酶的結(jié)構(gòu)與作用方式,可將其分為Ⅰ類限制酶(TypeⅠ)、Ⅱ類限制酶(TypeⅡ)和Ⅲ類限制酶(TypeⅢ)3種類型。其中,Ⅱ類限制酶識別切割位點(diǎn)比較專一,且不具有甲基化酶的活性,在DNA重組中被廣泛應(yīng)用。
愛必信擁有不同的TypeⅡ型限制性內(nèi)切酶產(chǎn)品:
產(chǎn)品優(yōu)勢:
1、快速:5-15min內(nèi)即可完成酶切;
2、便捷:共用一種酶切Buffer,簡化酶切體系;
3、兼容性高:在不同緩沖液中均具有很高活性;
4、良好酶活冗余度,輕松應(yīng)對底物過量或困難模板酶切。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs60200 | 快速內(nèi)切酶ApaLI | 200T |
abs60201 | 快速內(nèi)切酶AscI | 50T |
abs60202 | 快速內(nèi)切酶AvrII | 25T |
abs60203 | 快速內(nèi)切酶BamHI | 500T |
abs60204 | 快速內(nèi)切酶BclI | 125T |
abs60205 | 快速內(nèi)切酶BglII | 100T |
abs60206 | 快速內(nèi)切酶BsaI | 50T |
abs60207 | 快速內(nèi)切酶BstBI | 100T |
abs60208 | 快速內(nèi)切酶BstEII | 100T |
abs60209 | 快速內(nèi)切酶ClaI | 50T |
DNA連接酶
DNA連接酶主要用于基因工程中,將由限制性核酸內(nèi)切酶“剪"出的粘性末端重新組,故也稱“基因針線"。作用原理為DNA連接酶催化雙鏈DNA鏈一條鏈上切口的連接,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA鏈的5'-Po4與另一DNA鏈的3'-OH生成磷酸二酯鍵。T4 DNA連接酶是ATP依賴的DNA連接酶,可催化雙鏈DNA的粘性末端、平末端及RNA-DNA雜合體中單鏈的連接,在分子生物學(xué)中有廣泛的應(yīng)用。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 特點(diǎn) |
abs60084 | T4 DNA Ligase | 500U | 該酶不僅能夠催化雙鏈DNA的平末端或粘性末端之間的連接,還可以修復(fù)雙鏈DNA、RNA或DNA/RNA雜交雙鏈中的單鏈切刻。 |
DNA聚合酶(DNA polymerase)
DNA聚合酶以DNA為復(fù)制模板,從將DNA由5'端點(diǎn)開始復(fù)制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具備模板、引物、dNTP等的情況下)及其相輔的活性。實(shí)驗(yàn)室常用的DNA聚合酶有普通耐熱型Taq DNA聚合酶、高保真型DNA聚合酶。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs60251 | 重組高熱穩(wěn)定DNA聚合酶 | 1000U |
abs60036 | 2×Taq PCR Mix | 1mL*5 |
abs60056 | 2×Pfu Master Mix | 1mL*5 |
abs601511 | 2 × 預(yù)混實(shí)時熒光定量快速PCR反應(yīng)體系 | 1.7mL*3 |
逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄酶(反轉(zhuǎn)錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,根據(jù)堿基配對的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補(bǔ)的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補(bǔ)DNA (complementary DNA, CDNA)。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 產(chǎn)品特點(diǎn) |
abs60073 | Reverse Transcriptase | 10000U | 本酶的RNase H活性缺失,延伸能力強(qiáng),可用于較長的cDNA合成,高比例的全長cDNA文庫的構(gòu)建以及Real Time RT-PCR反應(yīng)等。 |
核酸酶
核酸酶主要有三類,分別是:
1、脫氧核糖核酸酶(DNase):DNase只能水解DNA的磷酸二酯鍵。胰DNasel可切割雙鏈和單鏈DNA,產(chǎn)物為5’-磷酸寡核首酸,牛脾DNasell降解DNA則產(chǎn)生3’-磷酸為未端的寡核苷酸;
2、核糖核酸酶(RNase):將RNA降解為小片段的核酸酶;
3、非特異性核酸酶:將DNA、RNA都可進(jìn)行水解。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs60539 | 脫氧核糖核酸酶Ⅰ | 1KU |
abs47047435 | 脫氧核糖核酸酶Ⅰ(牛胰) | 100mg |
abs9330 | 核糖核酸酶A | 150uL |
abs44075580 | 核糖核酸酶A | 50mg |
abs60326 | DNase–Free RNA酶A | 1mL |
abs60157 | 全能核酸酶 | 10KU |
其他酶
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 產(chǎn)品描述 |
abs60248 | 雙鏈DNA酶 | 50T | dsDNase也是一種核酸內(nèi)切酶,能夠特異性的消化雙鏈DNA而不會消化單鏈DNA |
abs60340 | PfAgo核酸內(nèi)切酶 | 200U | PfAgo核酸內(nèi)切酶可在5’磷酸化的guide DNA引導(dǎo)下精準(zhǔn)剪切單鏈DNA底物 |
abs9118 | 蛋白酶K | 1g | 主要應(yīng)用于基因診斷試劑盒、基因組DNA提取試劑盒、RNA提取試劑盒中去除核酸酶和其它蛋白污染 |
FAQ:
1、限制性內(nèi)切酶無法切割DNA有哪些原因?
a. 內(nèi)切酶失活:用標(biāo)準(zhǔn)底物檢測酶活性;
b. DNA不純,含有SDS、酚、EDTA等內(nèi)切酶抑制因子:將DNA過柱純化,乙醇沉淀DNA;
c. 條件不適(試劑、溫度):檢查反應(yīng)系統(tǒng)是否最佳;
d. DNA不存在該酶識別序列:換用其它的酶切割DNA或過量酶消化驗(yàn)證。
2、酶切后的DNA片段連接效率低?
a. 含磷酸鹽的濃度高:透析,乙醇沉淀去除磷酸鹽;
b. 內(nèi)切酶失活或含有ATP酶:更換內(nèi)切酶;
c. 平末端連接:加大T4 DNA Ligase用量;
d. 連接緩沖液不合適:重新配制連接緩沖液。
3、脫氧核糖核酸酶I(abs60539)濃度、體積怎么換算?用于組織的解離該怎么用?
對于濃度、體積計算:本產(chǎn)品規(guī)格為1KU,酶活濃度是5U/mL,總體積則為200uL。根據(jù)說明書最后一個表格計算酶體積用量:例如1ugRNA,相應(yīng)所需酶就是1U,1KU/1U=200uL/需要體積,最后計算得到0.2uL。對于動物組織解離,可以適用,具體操作步驟及使用量可參考網(wǎng)絡(luò)文獻(xiàn)。
4、pfAgo核酸內(nèi)切酶buffer是否含有金屬離子?
Buffer中不含金屬離子,對于擴(kuò)增反應(yīng)沒有任何影響。一般PfAgo酶可以兼容絕大多數(shù)PCR buffer,但普通Taq酶不兼容PfAgo buffer。
5、pfAgo核酸內(nèi)切酶和Ago核酸內(nèi)切酶(微球)有哪些差別?
兩者狀態(tài)不一樣、保存條件不一樣;檢測方法、使用的效果幾乎一樣。
名詞解釋:
酶活性單位:在一定溫度、PH及離子強(qiáng)度下,1h內(nèi)酶解(切割)特定底物DNA,所需酶的量。采用國際單位(IU,簡寫為U)來統(tǒng)一表示酶活性的大小。
酶活性濃度:以每單位體積所含的酶活性單位數(shù)表示。目前幾乎都習(xí)慣用U/L來表示液體中酶活性濃度。
Absin產(chǎn)品線:
爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...
特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...
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