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          類器官污染鑒別與除菌攻略(一)

          閱讀:241      發(fā)布時間:2024-10-29
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          一、概述

           

          類器官污染是一個老生常談的事情,尤其是做胃腸道,組織本身帶來的菌群數(shù)量非常龐大,一旦消毒不到位,就會導(dǎo)致類器官培養(yǎng)失敗。類器官污染常見類型有細(xì)菌、真菌、支原體、黑膠蟲等污染源,今天小愛帶大家學(xué)習(xí)鑒別類器官污染及除菌方案。

           

          二、類器官污染鑒別

           

          1、細(xì)菌污染

           

          細(xì)菌污染-肉眼下

           

          污染特征:

          ● 肉眼下可明顯觀察基質(zhì)內(nèi)有明顯黑色球體物;

          ● 而且呈多個黑色球狀物分布;

          ● 生長迅速,通常D1就有會出現(xiàn);

          ● 培養(yǎng)液隔夜即會變紅黃渾濁。

           

          細(xì)菌污染-鏡下類器官原代提取D1

           

          細(xì)菌污染特征:

          ● 細(xì)菌集落呈黑色團(tuán)球狀,wan全不透;

          ● 外圍模糊,有朦朧感;

          ● 爆發(fā)非???/strong>,一般1-2天即可出現(xiàn)大量集落。

           

          細(xì)菌克星

          貨號

          抗生素

          作用對象

          使用比例

          儲存條件

          abs42020125

          卡那霉素B硫酸鹽

          細(xì)菌(G+,G-)支原體

          母液濃度10mg/mL(無菌水溶解),工作濃度稀釋1:100

          -20℃

          abs42018967

          硫酸慶大霉素溶液(10mg/mL)

          細(xì)菌(G+,G-)支原體

          稀釋1:200

          -20℃

          abs9244

          青鏈雙抗

          細(xì)菌(G+,G-)

          稀釋1:100

          -20℃

          abs9246

          青霉素-鏈霉素-兩性霉素B三抗

          細(xì)菌(G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)

          稀釋1:100

          -20℃

          abs9245

          青霉素-鏈霉素-慶大霉素三抗

          細(xì)菌(G+,G-)、支原體

          稀釋1:100

          -20℃

           










          2、真菌污染

           

          左圖 真菌污染特征——霉菌

          右圖 真菌污染特征——根霉

           

          霉菌污染特征:

          ● 早期并不會使得培養(yǎng)基變黃變渾濁,但在顯微鏡下可觀察到菌絲體;

          ● 真菌形成的菌絲呈絲狀,管狀,樹枝狀,串珠狀。

           

          真菌污染——酵母菌

           

          小鼠胃類器官P0D1中發(fā)現(xiàn)的酵母菌團(tuán)從左到右依次是4X、10X、20X

           

          類器官基質(zhì)膠中的酵母菌污染

           

          類器官基質(zhì)膠中的酵母菌+根霉污染

           

          酵母菌污染特征:

          ● 酵母菌呈類似棉花絮狀的團(tuán)狀物;

          ● 酵母菌等,當(dāng)其行出芽生殖時可從一大一小的連體結(jié)構(gòu)識別;

          ● 細(xì)胞被污染后,仍可生長,長時間類器官活力狀態(tài)會變差;

          ● 梅雨季時的污染率會提高。

           

          真菌克星

          貨號

          抗生素

          作用對象

          使用比例

          儲存條件

          abs42013298

          兩性霉素B

          真菌(如:酵母菌,霉菌)

          母液濃度2.5mg/mL(DMSO溶解),工作濃度稀釋1:1000

          -20℃

          abs44071148

          制霉菌素

          真菌(如:酵母菌,霉菌)

          母液濃度2mg/mL(DMSO溶解),工作濃度稀釋1:100

          -20℃

          abs9246

          青霉素-鏈霉素-兩性霉素B混合溶液(100×三抗)

          細(xì)菌(如G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)

          稀釋1:100

          -20℃

           








          3、黑膠蟲

           

           

          黑膠蟲污染特征:

          ● 活躍扭動;

          ● 多呈桿狀;

          ● 培養(yǎng)基不渾濁。

           

          黑膠蟲清除劑PLUS (500×) abs9841

           

          產(chǎn)品優(yōu)勢:

          1)性能穩(wěn)定:通過細(xì)菌、真菌、支原體、內(nèi)毒素檢測;通過滲透壓、pH檢測;通過產(chǎn)品性能檢測;

          2)高效快速:有效實現(xiàn)對“黑膠蟲"的抑制和滅殺,減少不必要的實驗損失;

          3)環(huán)保安全:經(jīng)上百種細(xì)胞驗證無毒害作用。

           

          使用方法:

          1)請在收到貨后, 將試劑管瞬時離心(3000rpm,3~5s)保存;

          2)使用黑膠蟲清除劑處理時, 建議現(xiàn)配現(xiàn)用, 并保持細(xì)胞密度在50%~60%

          3)推薦稀釋比例為1:500。例如5mL培養(yǎng)基中加入10μL的黑膠蟲清除劑。丟棄舊的培養(yǎng)基, 用PBS將細(xì)胞清洗干凈, 再加入含有黑膠蟲清除劑的新鮮培養(yǎng)基, 2天一次,連續(xù)處理一周。

           

          黑膠蟲預(yù)防劑(1000×)abs9842

           

          產(chǎn)品優(yōu)勢:

          1)高效穩(wěn)定:通過產(chǎn)品性能檢測,能夠有效防治細(xì)胞培養(yǎng)中的“黑膠蟲"污染問題;

          2)環(huán)保安全:對細(xì)胞無毒性作用,在細(xì)胞培養(yǎng)過程中不會對細(xì)胞造成影響,本產(chǎn)品為多肽類,不像抗生素會影響細(xì)胞生長狀態(tài)并讓細(xì)胞產(chǎn)生耐藥性。

           

          使用方法:

          1)使用黑膠蟲預(yù)防劑(1000X)時, 建議現(xiàn)配現(xiàn)用;

          2)推薦黑膠蟲預(yù)防劑(1000X)的稀釋比例為1:1000, 例如:10mL的培養(yǎng)基加入10μL的黑膠蟲預(yù)防劑(1000X)。

           

          4、支原體污染

           

          支原體是實驗室中常見的污染細(xì)胞的原核生物,污染主要來自組織、血清等動物性原材料和操作者本身。支原體直徑在0.1-0.3μm,顯微鏡下也很難分辨,一般通過吸取培養(yǎng)液上清采用qPCR技術(shù)擴(kuò)增DNA檢測。

           

          1)檢測原理

           

          TaqMan熒光探針是一種寡核苷酸探針,其5’末端攜帶熒光基團(tuán)(報告基團(tuán)),如FAM、CY5、VIC等,3’端攜帶淬滅基團(tuán),如TAMRA、BHQ1等。PCR擴(kuò)增時在加入一對引物的同時加入一條特異性的熒光探針,探針完整時,熒光基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收。PCR擴(kuò)增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)(熒光定量PCR儀)可接收到熒光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成wan全同步。本試劑盒采用多重PCR的方法,用2種不同的熒光探針分別檢測目標(biāo)序列與內(nèi)參。

           

          2)清除試劑

           

          支原體清除試劑Plus abs9253

           

          產(chǎn)品優(yōu)勢:

          ● 特異性清除培養(yǎng)基中的支原體;

          ● 只需要3-6天,便可以有效清除支原體;

          ● 活性成分為抗生素,不會產(chǎn)生耐藥性;

          ● 對細(xì)胞幾乎無毒性,在100多種細(xì)胞上進(jìn)行過驗證,包括但不限于HEK293、Hela、MCF-7、MRC-5、NIH-3T3、CCC-ESF、CHO-S、CHO-K1、CHO-DG44、H295R、HL-60、K562、MDA-MB-231、SP2/0、T47D、BM和BV2等;

          ● 廣譜性,可替代雙抗,可以清除常見的革蘭氏陰性和陽性菌;

          ● 可直接加入血清、培養(yǎng)基中,用于清除支原體污染。

           

          3)使用方法

           

          A、儲存液的配制: 

          稱取適量支原體清除試劑,配制成10mg/mL的儲存液。適當(dāng)分裝后-20℃保存。如長時間不使用,也可以-80℃保存;

           

          B、預(yù)防支原體污染或抑制支原體:

          在細(xì)胞培養(yǎng)液中加入適量支原體清除試劑儲存液,使最終濃度為0.01-0.5μg/mL,通常推薦使用的濃度為0.2μg/mL或0.5μg/mL。在添加了前述劑量的支原體清除試劑的情況下,可以有效防止支原體污染或抑制支原體增殖;

           

          C、清除污染的支原體:

          對于發(fā)現(xiàn)或懷疑有支原體污染的細(xì)胞,在細(xì)胞培養(yǎng)液中加入適量支原體清除試劑儲存液,使最終濃度為0.5-250μg/mL。推薦依次嘗試使用25、50、100和250μg/mL這4個濃度。在添加了前述劑量的支原體去除試劑的細(xì)胞培養(yǎng)液中培養(yǎng)1周后,檢測是否還存在支原體污染。如果還是存在支原體污染,可以酌情提高支原體清除試劑的工作濃度。

           

          5、非污染情況

           

          因為類器官原代培養(yǎng)中,會有很多雜質(zhì)、組織碎片、成纖維細(xì)胞等,容易造成細(xì)胞“污染"的假象,其實并非污染,如下所示:

           

          1)成纖維細(xì)胞

          成纖維細(xì)胞的胞體細(xì)長,又呈纖維樣,很容易被誤認(rèn)為是菌絲體,被誤判成真菌污染。其實仔細(xì)觀察,成纖維細(xì)胞成梭形,胞體中間粗,兩頭細(xì)長,而菌絲體整體粗細(xì)均勻。

           

          左圖 基質(zhì)膠底層貼壁生長的成纖維細(xì)胞

          右圖 真菌污染特征——霉菌

           

          2)組織碎片

          在提取原代細(xì)胞的過程中,在組織解離過程中產(chǎn)生很多細(xì)胞碎片及雜質(zhì),故原代培養(yǎng)背景會比較臟,這種情況也容易被誤認(rèn)為污染。接下來,小愛帶大家了解一下組織碎片特點:

           

           

          ● 原代組織碎片往往成不規(guī)則形狀,區(qū)別于菌團(tuán)橢圓形菌落形態(tài);

           

           

          ● 原代組織雜質(zhì)往往大小不一,形態(tài)各異;菌團(tuán)形態(tài)均一,均為橢圓狀。

           

          今天講解就到這了,大家如有實驗問題,歡迎一起交流哦!

            

          本期小愛推薦


          貨號

          品名

          規(guī)格

          貨期

          abs9841

          黑膠蟲清除劑PLUS(500×)

          400uL×5

          現(xiàn)貨

          abs9842

          黑膠蟲預(yù)防劑(1000×)

          500uL×5

          現(xiàn)貨

          abs9925

          支原體檢測試劑盒(qPCR法)

          50T

          1-2周

          abs9253

          支原體清除試劑Plus

          20mg/100mg

          1-2周

          abs42020125

          卡那霉素B硫酸鹽

          250mg

          現(xiàn)貨

          abs42018967

          硫酸慶大霉素溶液(10mg/mL)

          10mL

          現(xiàn)貨

          abs9244

          青鏈雙抗

          100mL

          現(xiàn)貨

          abs9246

          青霉素-鏈霉素-兩性霉素B三抗

          100mL

          現(xiàn)貨

          abs9245

          青霉素-鏈霉素-慶大霉素三抗

          100mL

          現(xiàn)貨

          abs42013298

          兩性霉素B

          1g/5g

          現(xiàn)貨

          abs44071148

          制霉菌素

          1g/5g

          現(xiàn)貨




           

          Absin產(chǎn)品線:

          爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...

          特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

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