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一是制種快：菌種培養(yǎng)在液體菌種培養(yǎng)罐內(nèi)菌體細(xì)胞處于zui適溫度、酸堿度、氧氣、碳氮比等條件下，以動態(tài)方式培養(yǎng)，菌絲分裂迅速，在短期內(nèi)能獲得大量菌絲體（球）。固體菌種培養(yǎng)，其菌絲體是以自然數(shù)的速度自上而下勻速生長；而液體菌種培養(yǎng)，其菌體細(xì)胞是以幾何數(shù)字的倍數(shù)加速增殖。液體菌種培養(yǎng)器液體菌種一般4天完成一個培養(yǎng)周期，而固體菌種從原種再到栽培種，每級擴(kuò)繁都得1個多月。
二是活力強(qiáng)。液體菌種不僅營養(yǎng)、溫度、氧氣、酸堿度等環(huán)境通過控制，zui大限度地滿足了菌體的生長需求，而且呼吸作用產(chǎn)生的代謝廢氣能及時排除，新陳代謝旺盛，所有菌球菌齡基本一致，因此菌絲活力強(qiáng)。而固體菌種菌體細(xì)胞代謝物積留混雜于培養(yǎng)基營養(yǎng)物中間，自然影響菌體質(zhì)量。況且固體菌種往往是瓶（袋）上下菌齡不一致，下面剛長好，上面可能老化，并失去活力。
三是純度高。菌種培養(yǎng)液體菌種所用母種一般需經(jīng)篩選純化制備而成，種源純度高。而固體菌種所用斜面母種經(jīng)一些商家無限轉(zhuǎn)代后純度降低。液體菌種培養(yǎng)是在密閉罐體內(nèi)運(yùn)行，供氧系統(tǒng)空氣經(jīng)過濾，其純度達(dá)到99.99%，從而保證所培養(yǎng)的液體菌種是純種。
四是防污染。液體菌種具有流動性，接種后易分散，萌發(fā)點多，菌球接入后萌發(fā)快，在適宜條件下，接種后24小時左右菌絲布滿接種面，使栽培污染得到有效控制。而固體菌種接種時，菌體經(jīng)過剝離與撕裂和藥物薰殺，從萌發(fā)吃料到封閉接種面，一般得5~7天。所以雜菌污染機(jī)率多。
五是縮短栽培周期。液體菌種使栽培發(fā)菌速度快一倍，出菇集中，周期縮短，栽培的用工、能耗、場地等成本都大大下降。六是成本低。100L的發(fā)酵罐，每罐菌種成本100元左右，可接種4000~5000袋，菌種培養(yǎng)每袋菌種成本不超過3分錢。