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          沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR試劑盒說明書

          閱讀:311          發(fā)布時間:2019-8-9
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          沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

           

          中英文名稱

          規(guī)格

          價格

          說明書

          Haplosporidium costale

          沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR試劑盒

          50

          3490

           

          運輸:低溫

          保存:負(fù)20

          有效期:一年

          貨期:2-3

          產(chǎn)品及特點

          1. 即開即用,用戶只需要提供沿岸單孢子蟲樣品。

          2. 根據(jù)沿岸單孢子蟲探針法熒光定量保守序列設(shè)計的專一性引物,與相關(guān)病毒無交叉反應(yīng)。

          3. 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應(yīng)。

          4. 一管式熒光定量PCR檢測,避免后續(xù)污染。

          5. 本試劑盒足夠50次20μL反應(yīng)體系的熒光定量PCR。

          本產(chǎn)品只適用于科研,不能用于臨床診斷。

          規(guī)格及成分

          成分

          編號

          十孔盒包裝

          2×qPCR MagicMix

          試劑一

          500μL(棕色管)

          熒光PCR模板稀釋液

          試劑二

          1 mL(黃蓋)

          沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR引物混合物

          試劑三

          100μL(白蓋)

          沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR陽性對照

          (1×10E8 拷貝/μL)

          試劑四

          50μL(紅蓋)

          使用手冊

          試劑五

          1

          運輸及保存

          低溫運輸,-20℃保存,保存期限一年

          自備試劑 

          DNA模板、10×ROX(根據(jù)機型決定,具體見使用方法)。

          使用方法

          、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)

          1. 注意:由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的DNA片段作為陽性對照。

          2. 標(biāo)記6個離心管,分別為7,6,5,4,3,2。

          3. 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。

          4. 在7號管中加入5 μL 1×10E8拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩1分鐘,得1×10E7拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

          5. 換槍頭,在6號管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

          6. 換槍頭,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL的陽性對照到5號管中,充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的陽性對照。放冰上待用。

          7. 重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。

          二、樣品DNA的制備

          8. 如果有N個樣品,必須設(shè)置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL上步制備的PCR陽性對照的第4號(濃度為1×10E4 拷貝/μL,10μL相當(dāng)于1萬拷貝)或第5號(濃度為1×10E5 拷貝/μL,10μL相當(dāng)于10萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品,則PC和NC的體積也必須是200μL。

          9. 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。

          三、設(shè)置qPCR反應(yīng)(20 μL體系,在樣品制備室進行)

          10. 如果只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用于PCR陽性對照。如果做2-3次重復(fù),則反應(yīng)設(shè)置數(shù)量相應(yīng)增加2或3倍。

          11. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):

          成分

          樣品管

          N+2

          PCR陰性對照管

          PCR陽性

          對照管(2-7管)

          2×qPCR MagicMix

          (棕色管)

          10 μL

          10 μL

          各10 μL

          沿岸單孢子蟲探針法熒光定量PCR

          引物混合液(白蓋)

          2 μL

          2 μL

          各2 μL

          自備10×ROX (見注)

          2 μL

          2 μL

          各2 μL

           N+2待測樣品DNA模板

          6 μL

          不加

          不加

          第7步所得PCR陽性對照

          稀釋液(2-7號)

          不加

          不加

          各6μL(2號樣到2號管,3號樣到3號管…)

          注:僅ABI7500、7700和7900儀器需要使用ROX作為對照,其他熒光PCR儀器(如iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000和LightCycler480)不需要使用ROX,則用水替代。

          12. 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化)。

          過程

          溫度

          時間

          預(yù)變性

          92℃

          5分鐘

          PCR反應(yīng)

          (30個循環(huán))

          92℃

          60 

          54℃

          60 

          72℃

          60 

          13. 數(shù)據(jù)采集

          具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合DNA時,大吸收光譜在471 nm,結(jié)合DNA時的大吸收光譜在500 nm,大發(fā)射光譜在530 nm。信號采集可以設(shè)置在復(fù)性或延伸步驟。 

          四、數(shù)據(jù)處理

          14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品DNA濃度的log值,再推算出其濃度。

          如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。

           

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