詳細(xì)介紹
隨機(jī)引物法DNA探針標(biāo)記試劑盒(A)是基于 Feinberg 和 Vogelstein 發(fā)明的隨機(jī)引物標(biāo)記法而開(kāi)發(fā)出來(lái)的即用型DNA 探針標(biāo)記試劑盒,標(biāo)記過(guò)程由雙鏈 DNA 熱變性、隨機(jī)引物與單鏈 DNA 結(jié)合、在Klenow DNA 聚合酶催化下,引物的延伸合成 DNA 探針并摻入標(biāo)記的核苷酸三步組成,
可用下面的示意圖表示:
隨機(jī)引物法DNA探針標(biāo)記試劑盒(A)對(duì) Feinberg 和 Vogelstein 經(jīng)典方法進(jìn)行了改良,具有下列特點(diǎn):
1. 提供的標(biāo)記反應(yīng)液整合了除酶和模板外的所有成分,簡(jiǎn)化了反應(yīng)加樣步驟,提高了
標(biāo)記反應(yīng)的可重復(fù)性。
2. 使用無(wú)外切活性的 Klenow exo- DNA 聚合酶,已標(biāo)記 DNA 探針不會(huì)被酶降解。
3. 快速,zui快 1 小時(shí)即可完成標(biāo)記反應(yīng)。
4. 得到的 DNA 探針比活性高(如果是同位素,可以達(dá)到 109cpm/ug DNA),檢測(cè)靈
敏度高。
5. 所需模版 DNA 量少(只需要 10ng 以上即可),DNA 可以是各種形狀(線(xiàn)狀和環(huán)狀)
的、也可以是單鏈或雙鏈的,長(zhǎng)度在 100 bp 以上均可。
6. 得到的探針長(zhǎng)度在 200-400 nt 之間,可以用于 Southern 雜交、Northern 雜交、
原位雜交、菌落和斑點(diǎn)印跡雜交等。
7. 提供三種標(biāo)記選擇,其中 90603A 可用于各種同位素標(biāo)記和其他任何非同位素標(biāo)記,
但需自備標(biāo)記底物;90603B 和 90603C 可分別用于生物素和標(biāo)記,不需自
備標(biāo)記底物。
規(guī)格及成分 成 份 編 號(hào) 小塑料盒包裝
2×A 型標(biāo)記反應(yīng)液(自備標(biāo)記物型) 90603A 50 uL(僅 A 型有)
2×B 型標(biāo)記反應(yīng)液(生物素型) 90603B 50 uL(僅 B 型有)
2×C 型標(biāo)記反應(yīng)液(DIG 型) 90603C 50 uL(僅 C 型有)
dATP,2 mM 90603D 10 uL(僅 A 型有)
dTTP,2 mM 90603D 10 uL(僅 A 型有)
dGTP,2 mM 90603D 10 uL(僅 A 型有)
dCTP,2 mM 90603D 10 uL(僅 A 型有)
Klenow exo-聚合酶(2U/uL) 90603E 5 uL
超純水 100935 1 mL
使用手冊(cè) 90603sc 1 份
運(yùn)輸及保存 低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑 0.5M EDTA(pH8.0)。如果是 A 型,則需要自備標(biāo)記的核苷酸。
使用方法 1. 在一干凈的硅化的塑料離心管中加入下列成分:
成分 用量
模板 DNA 50-150 ng
2×標(biāo)記反應(yīng)液(ABC 三種之一) 10 uL
超純水 補(bǔ)水到 15 uL
注意:非同位素標(biāo)記物由于疏水性強(qiáng),容易與常用的塑料離心管表面非特異性結(jié)合,
所以一定要使用硅化的塑料離心管。模板 DNA 并非越多越好,因?yàn)槟0鍟?huì)在雜交反
應(yīng)中跟標(biāo)記的探針雜交,競(jìng)爭(zhēng)性抑制探針跟靶分子的雜交。
2. 沸水浴 5-10 分鐘,或在 PCR 儀上 100℃加熱 5-10 分鐘使 DNA 模版充分變性,
立即放冰上待用。注意:如果 PCR 儀器不能設(shè)置到 100℃,99℃加熱 5 分鐘也可。
3. 高速離心數(shù)秒使所有液體集中在管底,根據(jù)試劑盒類(lèi)型加入下列成份:
試劑盒類(lèi)型 成分及用量
A 型 dATP、dGTP、dCTP 各 1 uL(共 3uL,濃度均為 2mM)
自備的 2mM dTTP/標(biāo)記 dUTP 混合物(見(jiàn)注)1uL
1 uL Klenow exo 聚合酶
B 型 1 uL Klenow exo 聚合酶
4 uL 超純水
C 型 1 uL Klenow exo 聚合酶
4 uL 超純水
注:上表中的 dTTP/標(biāo)記 dUTP 混合物中 dTTP 和標(biāo)記的 dUTP 的總濃度為 2mM
(在 20uL 體系中混合液的終濃度為 0.1mM,dTTP 與生物素或 DIG 標(biāo)記的 dUTP
的比例為 65:35)。由于空間阻礙,并非標(biāo)記生物素或 DIG 標(biāo)記的 dUTP 越
多靈敏度越高,一般 dTTP 與標(biāo)記 dUTP 的比例在 65:35 為*。但如果使用自
備 的 其 他 標(biāo) 記 核 苷 酸, 如 fluorescein 、 hydroxycoumarin 、 resorufin 和
aminoallyl 標(biāo)記的 dUTP,則用戶(hù)需要自己摸索其與 dTTP 之間的*比例,如果
使用 32P 標(biāo)記的 dUTP,則比活為 3000Ci/mmol,濃度為好為 10uCi/uL,
并且不需要加入 dTTP。
4. 輕柔吹打混勻。如有液滴沾在管壁上,高速離心數(shù)秒使所有液體集中在管底。
5. 37℃保溫 1-20 小時(shí)。標(biāo)記效率跟模版量和保溫時(shí)間相關(guān),具體見(jiàn)下表:
模版 DNA 用量
(ng)
1 小時(shí)后探針合成量
(ng)
20 小時(shí)后探針合成量
(ng)
10 80 900
30 150 1350
100 350 1650
300 750 2200
1000 1300 2600
3000 1600 2600
6. 加 1 uL 自備的 0.5M EDTA(pH 8.0)終止反應(yīng),立即放冰上待用或放-20℃保存
一年。用前需要加熱 100℃ 5 分鐘使 DNA 探針變性成單鏈,然后直接加入到雜交
反應(yīng)液中即可。如果電泳檢測(cè),標(biāo)記產(chǎn)物將是彌散狀態(tài)。
注意:本方法標(biāo)記核苷酸摻入率*,因此可以不經(jīng)純化直接使用。如果需要純化,
注意不要用酚抽提法純化非同位素(生物素、DIG 和其他等)標(biāo)記的 DNA 探針,
因?yàn)檫@些標(biāo)記分子疏水性強(qiáng),能使標(biāo)記的 DNA 進(jìn)入疏水的有機(jī)相而丟失,但可以
用乙醇沉淀和 Sephadex G50 回收(可另購(gòu)非同位素探針柱式純化試劑盒)。對(duì)比
活高的同位素探針,由于其極其不穩(wěn)定,因此應(yīng)該立即使用,不要長(zhǎng)久放置。
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