詳細介紹
SP6體外轉錄試劑盒是基于 SP6 RNA 聚合酶的 RNA 體外轉錄試劑盒,它利用含有
SP6 啟動子的模版 DNA,以 NTP 為底物,從 SP6 啟動子下游開始合成與模版
DNA 中一條鏈互補的 RNA,簡單快速獲得大量的 RNA 分子。
本產(chǎn)品具有下列
特點:
1. 即開即用,用戶只需提供含 SP6 啟動子的 DNA 模板即可以進行體外轉錄實
驗,不需要單獨準備每一個成份。
2. 單溶液預配液,減少加樣次數(shù),避免了操作誤差,增加了可重復性。
3. 模版 DNA 可以是線性化的質(zhì)粒 DNA,也可以是 PCR 擴增產(chǎn)物。
4. 可以合成的 RNA 的*長度在 20nt 到 2000 nt 之間。
5. 產(chǎn)品配方經(jīng)過精心優(yōu)化,每 ug DNA 模版可以合成 2-6 ug RNA。
得到的 RNA 可以用于 RNA 結構研究、核酶生物化學、體外翻譯、RNA-
蛋白質(zhì)相互作用、反義技術、SELEX 技術和 RNA 干擾(RNAi)等實驗。
規(guī)格及成分 成份 編號 塑料袋包裝
轉錄預配液(2×) 91107A 0.5 mL
陽性對照 DNA
(1.3 kb 片段) 91107B
20 μL
(10 ng/μL)
SP6 RNA 聚合酶混合液 120307 50 μL
RNase-free 水 80403 1 mL
使用手冊 1 份
運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存, 有效期一年。
自備試劑 如果需要去除轉錄產(chǎn)物中的 DNA 模板,則需要 RNase-free DNase 、Tris 飽
和酚、氯、微量核酸沉淀劑、RNase-free 75%乙醇(均可從本公司另購)
SP6體外轉錄試劑盒使用方法 一、制備 DNA 模板
PCR 片段和質(zhì)粒 DNA 都可以用作體外轉錄的模板,但是必須注意以下幾點。
一是必須使用線性化的 DNA。如果是質(zhì)粒 DNA,則必須先用適當?shù)南拗菩?br />內(nèi)切酶切成線狀。二是需要轉錄的 DNA 序列的上游必須有 SP6 啟動子。如
果模板是 PCR 產(chǎn)物,則可以在設計引物時將 SP6 啟動子序列(5’ATT TAG
GTG ACA CTA TAG AGN G 3’)加上,轉錄其實是從 3 端 G AGN G 中
的*個 G 開始。如果是將 DNA 片段克隆到載體上,則需要選擇有 SP6
啟動子的載體,并且克隆位點必須位于 SP6 啟動子下游。三是需要轉錄的
DNA 序列的下游端zui不要是 3’突出。如果是 3’突出(如選擇了 Pst I
來線性化質(zhì)粒),則zui用 T4 DNA 聚合酶修平。四是必須保證 DNA 模板
中沒有 RNase。由于提取質(zhì)粒 DNA 的過程中一般要使用大量的 RNase A,
因此質(zhì)粒 DNA 一般都有嚴重的 RNase A 污染,所以在用作模板前,zui采
取膠回收得方法回收質(zhì)粒 DNA。并且加入少量總 RNA 一起保溫,然后電泳
檢測 RNA 是否被降解,以此判斷純化的 DNA 模板是否有殘留 RNase A。
二、體外轉錄反應
1. 在一個 RNase-free 的塑料離心管中,在室溫下(不是在 4℃下)按次序
加入下列成分:
成分 加入量 備注
DNA 模板 X uL
總量在 50 ng-1 ug(如果模板
是 PCR 片段,建議用 50 ng 左
右;如果模板是質(zhì)粒 DNA,建
議用 1 ug 左右;如果用本產(chǎn)品
提供的陽性對照,建議用 4 uL)
SP6 轉錄預配液(2×) 10 uL
室溫時使用,以免精胺將 DNA
模板沉淀下來
SP6 RNA 聚合酶
混合液
1 uL
本成分還含其他促進劑,所以是
混合物
RNase-free 水 補水到 20 uL
注:此為 20 uL 反應體系的用量,對其他反應體系,各成分的用量可以按
比例增減。如果需要標記 RNA 探針,則需要訂購 NTP 分開的試劑盒。如
果需要得到加帽 RNA,則需要加入自備的加帽修飾核苷酸(本公司有各種
加帽修飾核苷酸)。
2. 37℃保溫 1-2 小時。注意:延長保溫時間并不能提高產(chǎn)量。
3. 70℃加熱 10 分鐘滅活 SP6 RNA 聚合酶。
4. 取 1-3uL 電泳檢測轉錄效果。一般 1 ug DNA 可以合成 5-10 ug 的 RNA。
5. 得到的 RNA 可以放-80℃保存。
注:若需進一步去除 DNA 模板,可參考下列操作步驟,但所用試劑需另行購買,
本試劑盒不提供。
1. 在體外轉錄體系中加入 3-5 U 自備的 RNase-free DNase(CAT#:90903;
3-5 U/uL)。
2. 37℃保溫 15-30 分鐘。
3. 補水到 100 uL。
4. 用等體積(100 uL)的 Tris 飽和酚-氯抽提一次去除殘留的 DNase 和
RNA 聚合酶。
5. 在上清中加 200 uL 自備的微量核酸沉淀劑(CAT#50903;用前需要搖晃
混勻),振蕩后 15000 rpm 離心 3-5 分鐘,棄上清。
6. 加入 1 mL 75%乙醇,震蕩 10 秒后 15000 rpm 離心 3-5 分鐘,棄上清。
7. 短暫離心數(shù)秒,用槍頭吸棄上清。
8. 晾干半分鐘,所得沉淀即去除 DNA 模板后的 RNA??扇苡?RNase-free
水中后立即使用或放-80℃長期保存。
答客問
1、沒有 RNA 產(chǎn)物。zui常見原因是模板有 RNase 污染,可用純化的 RNA 跟模
板 DNA 一起保溫,再檢測 RNA 是否降解。還可以增加 RNase Inhibitor
用量,本試劑盒緩沖液和酶混合液中有 RNase inhibitor,如果模板 RNase
污染嚴重,可能需要用戶補加 RNase inhibitor。
2、RNA 產(chǎn)量低。zui常見的原因是 DNA 模板。在轉錄序列的*個和第二個堿
基zui都是 G,在前 14 個堿基內(nèi)避免有 U 存在。
3、RNA 長度比預期的短??赡苁悄0逍蛄兄杏?SP6 RNA 聚合酶的終止序列。
可以改用 SP6 體外轉錄試劑盒(啟動子也必須改成 SP6 啟動子)。
4、RNA 長度比預計的長。SP6 RNA 聚合酶跟 Taq DNA 聚合酶一樣,有不依
賴于模板的加尾功能,zui多有一半的 RNA 可以帶一個或兩個堿基的尾巴。
如果 RNA 長度比預計的長很多,使用的模板又是質(zhì)粒 DNA,則可能是質(zhì)粒
DNA 線性化不*。
5、5’單磷酸還是三磷酸。如果使用 GTP,則得到的 RNA 是三磷酸,體外轉
錄時如果保溫時間太長(如 12 小時),則有 50%的三磷酸會變成單磷酸。
如果在轉錄體系中加入 GMP,則 SP6 RNA 聚合酶將優(yōu)先使用 GMP,所得
RNA 產(chǎn)物中 5’端是單磷酸的比例將大大增加。
6、如何得到帶帽 RNA?需加入帶帽 NTP 類似物即可,本公司提供 5 種供選擇
(產(chǎn)品編號 130694-130698)。
關聯(lián)產(chǎn)品 T7 體外轉錄試劑盒(CAT#:91106)、T3 體外轉錄試劑盒(CAT#:91108)
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