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詳細介紹
公司產(chǎn)品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷！
描述：
核酸內(nèi)切酶 IV 來源于 E.coli,參與 DNA 損傷修復。該酶可識別雙鏈 DNA 分子上的脫嘌呤/脫嘧啶（AP）位點，并切割 AP 位點 5′ 端的第一個磷酸二酯鍵，產(chǎn)生 3′羥基和 5′ 脫氧核糖磷酸末端(deoxyribose phosphate,dRP)。另外該酶還具有 3′二酯酶活性，能從 DNA 的 3′末端釋放磷酸甘油醛、完整的脫氧核糖 5′-磷酸和磷酸。
該酶的最佳底物為 AP 雙鏈 DNA，但對 AP 單鏈 DNA 也有一定活性。
儲存：置于-20°C 可保存 2 年，避免反復凍融。
活性定義：一單位指在 10μl 反應體系中，37°C 反應15min，切割 1 pmol 含一個 AP 位點的 34mer 寡核苷酸雙鏈，所需要的酶量。
1×Endo IV Buffer：20mM Tris-HCl，pH8.5； 50mM KCl；0.1% Tween20；0.02% BSA, 5mM Mg2+。
熱失活：85°C，20min。
酶儲存液：50 mM Tris-HCl, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1
mM EDTA, 50% Glycerol, pH 7.5。
使用方法
含 AP 位點的 DNA 2-20pmol
10X Endon IV Buffer 2 μl
Endonuclease IV (20 U/μl) 1 μl
ddH2O Up to 20 μl
37°C 反應 15-30min。
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
A-PJ1129 | Tth Endonuclease IV | 1000U |
PCR 反應需要使用哪些試劑和設(shè)備？
試劑:
模板DNA：PCR反應需要模板DNA，如從細胞、組織、血液中提取DNA等；引物：PCR反應的兩個引物，分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域，引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物；dNTPs：PCR反應中需要四種dNTPs，包括脫氧腺苷酸（dATP）、脫氧胸苷酸（dCTP）、脫氧鳥苷酸（dGTP）、脫氧胞嘧啶酸（dTTP），用于細胞分裂、DNA合成等生物學過程，用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增；Taq DNA聚合酶：PCR反應需要的聚合酶，一般使用Taq聚合酶，還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等，用于擴增DNA鏈；PCR buffer溶液：對PCR反應具有緩沖作用，調(diào)節(jié)反應pH，硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛，可增強PCR反應特異性，從而提高反應效率；酶切體系：PCR擴增往往涉及到重組、構(gòu)建和測序等等實驗步驟，常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準，用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒：用于純化PCR反應產(chǎn)物；
設(shè)備：
PCR儀：用于控制反應溫度，保證PCR反應時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制；電泳槽：用于分離PCR擴增產(chǎn)物；核酸提取儀：從組織樣本中全自動提取核酸。 這些試劑和設(shè)備在PCR分子生物學技術(shù)中均是，只有在有序齊全的基礎(chǔ)上，才能進行PCR反應并得出準確結(jié)果。
PCR相關(guān)基礎(chǔ)實驗：
PCR反應基本步驟一般的聚合酶鏈式反應由20到35個循環(huán)組成，每個循環(huán)包括以下3個步驟：
一、變性：
利用高溫（93-98℃）使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前，通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離，僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘，接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段。
二、退火或稱接合,復性：
在DNA雙鏈分離后，降低溫度使得引物可以結(jié)合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導致引物不與模板結(jié)合或者錯誤地結(jié)合。該步驟時間1-2分鐘。
三、延伸：
DNA聚合酶由降溫時結(jié)合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr（來自于嗜熱菌Thermus brockianus）約40秒、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒。
PCR反應條件優(yōu)化：
1、變性溫度和時間：
保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關(guān)鍵。加熱90~95°C, 30~60s，再復雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長，可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。
2、復性溫度和時間:
PCR擴增特異性取決于復性過程中引物與模板的結(jié)合。復性溫度越高，產(chǎn)物特異性越高。復性溫度越低，產(chǎn)物特異性越低。需根據(jù)引物的Tm值具體設(shè)定。
3、延伸溫度和時間:
一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時，過高的延伸溫度不利于引物與模板的結(jié)合，可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應時間，可根據(jù)待擴增片段的長度而定，小于1kb, 1min足夠；大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據(jù)1kb/min增加時間。這里需要注意，延伸時間過長可能出現(xiàn)非特異擴增。因此需要設(shè)置恰到好處的延伸時間。
4、循環(huán)數(shù):
其他參數(shù)選定后，PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環(huán)后，PCR產(chǎn)物的積累即可達到最大值，實際操作中由于每步反應的產(chǎn)率不可能達到100%，因此不管模板濃度是多少，20~30次是比較合理的循環(huán)次數(shù)。循環(huán)次數(shù)越多，非特異擴增增加。
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