詳細介紹
公司產(chǎn)品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷!
貨號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
A-Hc2031 | 組織 / 細胞基因組 DNA 快速提取試劑盒 | 100 次 |
A-Hc2031 | 組織 / 細胞基因組 DNA 快速提取試劑盒 | 100 次×2 |
保存條件:本試劑盒在室溫儲存 12 個月不影響使用效果。
產(chǎn)品介紹:
結(jié)合液/蛋白酶 K 迅速裂解細胞和滅活細胞內(nèi)核酸酶,然后基因組 DNA 在 高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜,再通過一系列快速的漂洗-離心的 步驟,抑制物去除液和漂洗液將細胞代謝物、蛋白等雜質(zhì)去除,最后低鹽的洗脫緩沖 液將純凈基因組 DNA 從硅基質(zhì)膜上洗脫。
產(chǎn)品特點:
1.重復(fù)性好:離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進口特制吸附膜,柱與柱之間吸附量差異極小??朔藝a(chǎn)試劑盒膜質(zhì)量不穩(wěn)定的弊端。
2.多次柱漂洗確保高純度,OD260/OD280 典型的比值達 1.7~1.9,長度可達 30kb -50kb,可直接用于 PCR,Southern-blot 和各種酶切反應(yīng)。
注意事項:
1.結(jié)合液 CB 或者抑制物去除液 IR 低溫時可能出現(xiàn)析出和沉淀,可以在 37℃水浴幾分 鐘幫助重新溶解,恢復(fù)澄清透明后冷卻到室溫即可使用。
2.避免試劑長時間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、pH 值變化。
3.結(jié)合液 CB 和抑制物去除液 IR 中含有刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
4.洗脫液 EB 不含有螯合劑 EDTA,不影響下游酶切、連接等反應(yīng)。也可以使用水洗脫, 但應(yīng)該確保批 pH 大于 7.5,pH 過低影響洗脫效率。用水洗脫 DNA 應(yīng)該保存在-20℃。 DNA 如果需要長期保存,可以用 TE 緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,pH 8.0),但是 EDTA 可能影響下游酶切反應(yīng),使用時可以適當(dāng)稀釋。
自備試劑:無水乙醇、1xPBS 緩沖液、RNase A(10mg/ml)(RNase A(10 mg/ml) 有售)。
操作步驟:
提示:第一次使用前請先在漂洗液 WB 中加入定量無水乙醇,充分混勻,加入后請及時在方框打鉤標記已加入乙醇,以免多次加入!
如果需要去除 RNA,可在加蛋白酶 K 溶液前先加入 4μl RNaseA(10mg/ml)溶液振蕩 15sec,室溫放置 5 min
1.組織培養(yǎng)細胞
a. 收集約 105-10
6懸浮細胞到一個 1.5ml 離心管;對于貼壁細胞,應(yīng)該先用胰蛋白消化后吹打下來收集。
b. 12,000rpm 離心 10 sec,使細胞沉淀下來。棄上清,留下細胞團和大約 10-20μl殘留的液體。
c. 加 200μl 1×PBS 重懸洗滌細胞,12,000rpm 離心 10 sec,使細胞沉淀下來。棄上清, 將細胞沉淀重懸于 180μl 1XPBS 中。
d. 加入 20μl 蛋白酶 K (20mg/ml)溶液,充分混勻(可選步驟:為清除 RNA,加入 5µl RNase A(10mg/ml),振蕩混勻,可選擇室溫放置 5min),再加入 200μl結(jié)合液 CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在 70℃放置 10 min。
e. 冷卻后入 200μl 無水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀。
f. 將上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入吸附柱 AC 中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm 離心 1 min,倒掉收集管中的廢液。
g. 按操作步驟 4 繼續(xù)后續(xù)的實驗。
2.動植物組織(例如鼠肝腦或者植物葉片)
a. 新鮮或者解凍的組織在液氮中研磨成細粉后或者用解剖切成小碎塊(切成微塊可以提高產(chǎn)量)后取 20-50mg,轉(zhuǎn)入裝有 180μl 組織裂解液 TL 的 1.5ml 離心管中, 用大口徑槍頭吹打混勻。
b. 加入 20μl 的蛋白酶 K 溶液(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。
c. 將裂解物放置在 55℃水浴 1-3 小時或者直到組織消化全,期間輕柔的振蕩幾次幫助裂解。為清除 RNA,加入 5µl RNase A(10mg/ml),振蕩混勻(可選擇室溫放置 5 min)。
d. 加入 200μl 結(jié)合液 CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,70℃放置 10 min。
e. 冷卻后加入 200μl 無水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀。
f. 用 1ml 的槍頭吸取混合物,將混合物加入一個吸附柱 AC 中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm 離心 1 min,倒掉收集管中的廢液。
g. 按操作步驟 4 繼續(xù)后續(xù)的實驗。
3.動物組織(鼠尾)
a.將 0.2-0.5cm 的鼠尾巴尖(即 20-50mg)剪碎(一定要剪 0-2cm 范圍內(nèi)的尾巴尖,否則裂解效果不好),或者在液氮中研磨組織成細粉后,轉(zhuǎn)入裝有 180μl 組織裂解液 TL 的 1.5ml 離心管中, 用大口徑槍頭吹打混勻。
b.加入 20μl 的蛋白酶 K(20mg/ml),立刻渦旋振蕩充分混勻。
c.將裂解物放置在 55℃水浴 3 小時或者直到組織消化全,期間輕柔的振蕩幾次幫助裂解。為清除 RNA,加入 5µl RNase A(10mg/ml),振蕩混勻(可選擇室溫放置 5 min)。
d.用一個 1ml 不帶針頭的一次性輸液抽打裂解物 2-3 次。
e.加入 200μl 結(jié)合液 CB 和 200μl 無水乙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻。
f.12,000rpm 離心 5 min,將上清加入一個吸附柱 AC 中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm 離心 30-60 sec,倒掉收集管中的廢液。
g.按操作步驟 4 繼續(xù)后續(xù)的實驗。
4.加入 500μl 抑制物去除液 IR,12,000rpm 離心 30 sec,棄廢液。
5.加入 500μl 漂洗液 WB(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000rpm 離心 30 sec,棄掉廢液。
6.重復(fù)操作步驟 5。
7.將吸附柱 AC 放回空收集管中,12,000rpm 離心 2 min,將吸附柱置于室溫放置數(shù)分鐘,以晾干吸附材料中殘余的漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。
8. 取出吸附柱 AC,放入一個干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加 50-100 洗脫緩沖液 EB(洗脫緩沖液事先在 65℃水浴中預(yù)熱效果更好),室溫放置 3-5 min,12,000rpm 離心 1 min。為了增加基因組 DNA的得率,將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置 2 min,12,000rpm 離心 1 min。(注意: DNA 產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃,以防 DNA降解。)
PCR 反應(yīng)需要使用哪些試劑和設(shè)備?
試劑:
模板DNA:PCR反應(yīng)需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;引物:PCR反應(yīng)的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成等生物學(xué)過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;Taq DNA聚合酶:PCR反應(yīng)需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;PCR buffer溶液:對PCR反應(yīng)具有緩沖作用,調(diào)節(jié)反應(yīng)pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應(yīng)特異性,從而提高反應(yīng)效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構(gòu)建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物;
設(shè)備:
PCR儀:用于控制反應(yīng)溫度,保證PCR反應(yīng)時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制;電泳槽:用于分離PCR擴增產(chǎn)物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸。 這些試劑和設(shè)備在PCR分子生物學(xué)技術(shù)中均是,只有在有序齊全的基礎(chǔ)上,才能進行PCR反應(yīng)并得出準確結(jié)果。
PCR相關(guān)基礎(chǔ)實驗:
PCR反應(yīng)基本步驟一般的聚合酶鏈式反應(yīng)由20到35個循環(huán)組成,每個循環(huán)包括以下3個步驟:
一、變性:
利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段。
二、退火或稱接合,復(fù)性:
在DNA雙鏈分離后,降低溫度使得引物可以結(jié)合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導(dǎo)致引物不與模板結(jié)合或者錯誤地結(jié)合。該步驟時間1-2分鐘。
三、延伸:
DNA聚合酶由降溫時結(jié)合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒。
PCR反應(yīng)條件優(yōu)化:
1、變性溫度和時間:
保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關(guān)鍵。加熱90~95°C, 30~60s,再復(fù)雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。
2、復(fù)性溫度和時間:
PCR擴增特異性取決于復(fù)性過程中引物與模板的結(jié)合。復(fù)性溫度越高,產(chǎn)物特異性越高。復(fù)性溫度越低,產(chǎn)物特異性越低。需根據(jù)引物的Tm值具體設(shè)定。
3、延伸溫度和時間:
一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結(jié)合,可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應(yīng)時間,可根據(jù)待擴增片段的長度而定,小于1kb, 1min足夠;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據(jù)1kb/min增加時間。這里需要注意,延伸時間過長可能出現(xiàn)非特異擴增。因此需要設(shè)置恰到好處的延伸時間。
4、循環(huán)數(shù):
其他參數(shù)選定后,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環(huán)后,PCR產(chǎn)物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應(yīng)的產(chǎn)率不可能達到100%,因此不管模板濃度是多少,20~30次是比較合理的循環(huán)次數(shù)。循環(huán)次數(shù)越多,非特異擴增增加。
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