Chromatin Isolation via RNA Precipitation 基本信息
ChIRP是一種快速技術(shù)，可發(fā)現(xiàn)與RNA相關(guān)的DNA序列，并以高靈敏度和低背景定位與染色質(zhì)相關(guān)的長(zhǎng)非編碼RNA（lncRNA）的基因組結(jié)合位點(diǎn).

Chromatin Isolation via RNA Precipitation

Chromatin Isolation via RNA Precipitation

基本信息

ChIRP是一種快速技術(shù)，可發(fā)現(xiàn)與RNA相關(guān)的DNA序列，并以高靈敏度和低背景定位與染色質(zhì)相關(guān)的長(zhǎng)非編碼RNA（lncRNA）的基因組結(jié)合位點(diǎn).

通過這種方法，您可以定位哪些染色質(zhì)區(qū)域在一起進(jìn)行協(xié)調(diào)表達(dá)，確定哪些基因一起表達(dá)，并了解lncRNA在染色質(zhì)調(diào)節(jié)中的作用。使用我們的ChIRP探針設(shè)計(jì)者設(shè)計(jì)的反義寡核苷酸捕獲目標(biāo)lncRNA的親和力，并對(duì)與lncRNA相關(guān)的DNA染色質(zhì)進(jìn)行測(cè)序以創(chuàng)建測(cè)序文庫(kù)。利用DNA序列數(shù)據(jù)，可以生成幾百個(gè)堿基分辨率的基因組結(jié)合位點(diǎn)圖。ChIRP是一種快速技術(shù)，可發(fā)現(xiàn)與RNA相關(guān)的DNA序列，并以高靈敏度和低背景定位與染色質(zhì)相關(guān)的長(zhǎng)非編碼RNA（lncRNA）的基因組結(jié)合位點(diǎn)。通過這種方法，您可以定位哪些染色質(zhì)區(qū)域在一起進(jìn)行協(xié)調(diào)表達(dá)，確定哪些基因一起表達(dá)，并了解lncRNA在染色質(zhì)調(diào)節(jié)中的作用。使用我們的ChIRP探針設(shè)計(jì)者設(shè)計(jì)的反義寡核苷酸捕獲目標(biāo)lncRNA的親和力，并對(duì)與lncRNA相關(guān)的DNA染色質(zhì)進(jìn)行測(cè)序以創(chuàng)建測(cè)序文庫(kù)。利用DNA序列數(shù)據(jù)，可以生成幾百個(gè)堿基分辨率的基因組結(jié)合位點(diǎn)圖。

ChIRP寡核苷酸集可在LGC Biosearch的基于Web的設(shè)計(jì)師中進(jìn)行設(shè)計(jì)并直接訂購(gòu)。寡核苷酸以每孔5 nmol每個(gè)寡核苷酸的平板形式交付，因此可以將它們組合成合適的組。我們建議每組使用8至48個(gè)寡核苷酸。我們使用的連接子是C3（生物素）；3'修改與初使用的修改不同，但已被該技術(shù)的發(fā)起者批準(zhǔn)。完整的ChIRP方法的緩沖液和其他試劑由EMD / Millipore提供。