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          無細胞蛋白表達

          閱讀:509        發(fā)布時間:2022-6-27

          選擇細胞裂解物對活細胞中重組蛋白表達是很有用的,它們可以裂解真核細胞或細菌細胞,并去除蛋白質(zhì)中所有不需要表達的成分。這些裂解物可以與DNA模板和其他所需成分在試管中結合,進行蛋白質(zhì)的表達(1)。

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          Figure 1: Cell-free expression components and additives

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          Figure 2: Production of a target protein with living cells

          優(yōu)勢

          1. 無細胞反應很容易建立,僅需幾個小時就可以完成蛋白質(zhì)表達。這種方法可以用小規(guī)模(50-100微升)的反應快速完成反應條件的優(yōu)化,優(yōu)秀的條件能被線性放大到其所需的數(shù)量。


          2. 總處理量?。簩τ诳扇苄缘鞍?,幾毫升的反應就可以得到毫克量的蛋白。


          3. 作為一個開放的系統(tǒng),許多成分(天然的和非天然的),均可以被添加到反應混合物中,如還原/氧化元素、分子伴侶、標記的氨基酸或去污劑。如此,蛋白質(zhì)可以直接用于核磁共振,也可將膜蛋白在新生狀態(tài)下重組到納米盤系統(tǒng)中,而無需任何人造去污劑(10-12)。


          4. 真核細胞的裂解物能進行翻譯后修飾,如糖基化或磷酸化,并可將天然的細胞膜成分(如微粒體)插入膜蛋白(9)。


          5. 通常可以在無細胞系統(tǒng)中進行活細胞毒性蛋白的表達,由于已經(jīng)去除了負責(功能)的細胞成分,所以不會受到如蛋白消化酶或DNA模板不穩(wěn)定的影響。

          6. 多聚體蛋白和復合物都能被表達,且DNA模板滴定會影響不同亞基的比例。

          劣勢

          1. 如果蛋白質(zhì)需求量大或者蛋白質(zhì)表達低,無細胞表達會相當昂貴。因此,對于每一種蛋白質(zhì),應在小規(guī)模實驗中評估可達到的產(chǎn)量,并計算放大的成本,這對來自真核生物更復雜的無細胞裂解物來說更應如此。

          1 不同無細胞表達系統(tǒng)的比較

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          應用

          由于蛋白質(zhì)是在一個開放性的系統(tǒng)中表達的,與活細胞表達相比,無細胞表達使許多應用受益,包括:

          ·表達篩選:通過無細胞表達,您可以在兩天內(nèi)從DNA模板-甚至是多個平行應得到免疫印跡的結果,這使得該系統(tǒng)對于快速篩選多個構建體和反應條件更具吸引力。

          ·蛋白標記:開放式系統(tǒng)可以與標記的氨基酸相結合,例如生物素或熒光標簽。

          ·核磁共振:可以很容易地將同位素標記的氨基酸添加到混合物中,獲得準備用于核磁共振的蛋白質(zhì)。

             ·結晶:與硒代蛋氨酸結合,在一個簡單的步驟中獲得蛋白質(zhì)重金屬衍生物。


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          Figure 2: Production of a target protein with living cells

          膜蛋白特殊的適應性

          由于蛋白質(zhì)是在一個開放的系統(tǒng)中表達的,與活細胞表達相比,無細胞表達促進了許多應用,包括:

          ·不溶性表達:在不添加任何種類的脂質(zhì)或去污劑的情況下,形成膜蛋白聚集體,在諸多情況下可以重新折疊成功能蛋白。

          ·去污劑:尤其是Brij系列的去污劑,多數(shù)情況下將其加入以溶解膜蛋白。如果需要,可以在后續(xù)步驟中交換去污劑,但需要是在純化過程中。(2-7)

          ·納米磷脂盤:在無細胞反應中加入納米磷脂盤,是獲得穩(wěn)定性蛋白質(zhì)簡單和簡便的方法,不需要去污劑,可用于各種檢測10-15)。其應用范圍包括生物物理學分析、表面等離子共振、核磁共振和冷凍電鏡的質(zhì)譜分析。最近有研究表明,通過納米磷脂盤,膜蛋白在無細胞裂解物中的表達可通過中觀方法進行結晶14),了解更多關于納米磷脂盤的信息。

          ·脂質(zhì)體和其他脂質(zhì)顆粒:如脂質(zhì)體、微粒體和其他含脂質(zhì)的結構(如雙層膜微胞),已被添加到無細胞反應中,尤其是與昆蟲細胞裂解物結合進行膜蛋白的表達9)。使用適量的去污劑,還可以將膜蛋白從納米磷脂盤轉(zhuǎn)移到雙層膜微胞中13)。


          間歇式和無細胞持續(xù)交換方法

          通常可按兩種方法進行無細胞反應:

          1. 間歇式:可以輕松的在簡易管中進行間歇式無細胞反應,如離心管。其反應時間很短(1-3小時),因為能量物質(zhì)很快就被消耗完了,而最終產(chǎn)物的積累會減緩酶促反應的速度,因此蛋白質(zhì)的產(chǎn)量通常會很低。


          2.無細胞持續(xù)交換或半透膜:無細胞持續(xù)交換(CECF)反應是通過半透膜進行的,所以可向反應提供能量物質(zhì),并去除最終產(chǎn)物,如ADP。如此,反應時間就可以達到24小時,對于表達量高的可溶性蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)每毫升的產(chǎn)量可以達到幾毫克(8)

          References:

          1. Endo, Y. et al. (eds) Cell-Free Protein Production, Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology vol. 607 (2010)

          2. Nirenberg, M. W., Matthaei, J. H. "The Dependence of Cell- Free Protein Synthesis in E. Coli Upon Naturally Occurring or Synthetic Polyribonucleotides". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America47 (10): 1588–1602 (1961)

          3. Roos, C. et al. Characterization of co-translationally formed nanodisc complexes with small multidrug transporters, proteorhodopsin and with the E.coli MraY translocase. Biochim. Biophys. Acta 1818; 3098-3106 (2012)

          4. Proverbio, D. et al. Functional properties of cell-free expressed human endothelin A and endothelin B receptors in artificial membrane environments. Biochim. Biophys. Acta 1828, 2182-92 (2013)

          5. Roos, C. et al. High-level cell-free production of membrane proteins with nanodiscs. In: Cell-free Protein Synthesis: Methods and Protocols. Alexandrov, K., and Johnston, W.A. (eds), Methods in Molecular Biology vol. 1118, Chapter 7 (2014)

          6. Sachse, R. et al. Membrane protein synthesis in cell-free systems: From bio-mimetic systems to bio-membranes. FEBS Lett. 588,2774-2781 (2014)

          7. Jackson, A.M. "Cell-free protein synthesis for proteomics". Briefings in Functional Genomics and Proteomics2 (4): 308–319 (2004)

          8. Court, R., Cook, N., Saikrishnan, K., Wigley, D. The Crystal Structure of λ-Gam Protein Suggests a Model for RecBCD Inhibition, Journal of Molecular Biology, Volume 371, Issue 1 (2007)

          9. Suzuki, T. et al. An insect cell-free system for recombinant protein expression using cDNA resources. Methods in molecular biology vol. 577 (2009): 97-108.

          10. Boland, C. et al. Cell-free expression an in meso crystallization of an integral membrane kinase for structure determination. Cell. Mol. Life Sci (2014)

          11. Hein, C. et al. Hydrophobic environments in cell-free systems: Designing artificial environments for membrane proteins. J. Eng. Life Sci. 14, 365-79 (2014)

          12. Proverbio, D. et al. Membrane protein quality control in cell-free expression sysems: Tools, strategies and case studies. Membrane proteins production for structural analysis (Isabelle Mus-Veteau, ed.) Springer Heidelberg. ISBN:978-1-4939-0662-8.

          13. Haberstock, S. et al. A systematic approach to increase the efficiency of membrane protein production in cell-free expression systems. Prot. Exp. Purific. 82, 308-16 (2012)

          14. Matthies, D. et al. Cell-free expression and assembly of a macromolecular membrane protein complex. J. Mol. Biol. 413, 593-603 (2011)

          15. Schneider, B. et al. Membrane protein expression in cell-free systems. Metho. Mol. Biol. 601, 165-86 (2010)

          16. Laguerre, A. et al. From nanodiscs to isotropic bicelles: A procedure for solution nuclear magnetic resonance studies of detergent-sensitive integral membrane proteins. Structure 24, 1-12 (2016)

          17. Nikolaev, M. et al. Integral membrane proteins can be crystallized directly from nanodiscs. Cryst. Growth Des. 17(3), 945–948 (2017)

          18. Henrich, E. et al. Analyzing native membrane protein assembly in nanodiscs by combined non-covalent mass spectrometry and synthetic biology. eLife 6:e20954 (2017)

          19. Schwarz, D. et al. Preparative scale expression of membrane proteins in E.coli based continuous exchange cell-free systems. Nat. Protocols 2, 2945-57 (2007)

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