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          LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆試劑盒
          • LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆試劑盒
          舉報

          貨物所在地:北京北京市

          更新時間:2024-08-22 16:08:53

          瀏覽次數(shù):31

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          本制品和傳統(tǒng)的T4連接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)、高效(接近100%)連接DNA片段的原理采用本公司du創(chuàng)的工藝制成。LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆試劑盒

          LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆試劑盒



          產(chǎn)品貨號PT0101

          儲存溫度:-20℃儲存,至少12個月。冰袋運輸,1-2 天置于室外常溫不影響質(zhì)量。


          試劑盒組成

          20次

          80次

          TOPO-TA/Blunt Vector(30ng/ul)

          40ul

          160ul

          1000bp Control(30ng/ul

          5ul

          5ul

          10 Enhancer

          20ul

          80ul









          產(chǎn)品介紹

          本制品和傳統(tǒng)的T4連接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)、高效(接近100%)連接DNA片段的原理采用本公司du創(chuàng)的工藝制成。

          1)可以在瞬間(幾秒鐘-幾min)完成任意PCR產(chǎn)物(兼容A末端/平末端)連接。

          2)特制的新型載體質(zhì)粒大小僅僅不到2kb,充分發(fā)揮了TOPO載體越小,可容納片段越大的優(yōu)勢,最大限度提高了大片段連接效率;連接后質(zhì)粒大小比傳統(tǒng)載體小2kb以上,質(zhì)粒越小,轉(zhuǎn)化效率越高,極大的提高了各種片段連接后的轉(zhuǎn)化子數(shù)量。

          3)采用氨芐抗性載體只需10min復(fù)蘇時間,比卡那抗性載體1小時復(fù)蘇時間縮短6倍。

          4)最快可以不用冰浴和熱休克,室溫5min內(nèi)完成轉(zhuǎn)化;無需1小時復(fù)蘇,只需37℃10 min復(fù)蘇便可以涂板。從連接到涂板最快只需15-20min。

          5)zi殺基因零背景原理,無自連假陽性,無需繁瑣藍白斑篩選和菌落PCR篩選。大部分情況下隨機挑一個克隆便是有插入的(接近100%)。

          6)連接長片段能力遠超傳統(tǒng)TA/Blunt克隆載體,可連接長達10kb片段(例如連接5kb片段,也可能達到挑10個菌落,至少8個是有插入的效果),是新一代shi界領(lǐng)xian的簡單、快速、零背景免篩選的TOPO TA/Blunt克隆載體。

          注意:測序只能采用M13F/M13R通用引物測序(見后面圖譜),但是不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序。菌落 PCR 可使用和測序相同的引物。






          操作步驟

          1.連接反應(yīng)的準(zhǔn)備:

          PCR引物使用正常設(shè)計的引物即可,不需做任何改變(不能用磷酸化引物)。任意PCR產(chǎn)物(兼容A末端/平末端)均可以直接連接。PCR產(chǎn)物一般建議膠回收純化,這樣可以避免后續(xù)可能的問題。如果PCR產(chǎn)物僅有目的條帶、無非特異條帶和引物二聚體,也可嘗試直接進行連接反應(yīng)。如果是以質(zhì)粒為模板的PCR產(chǎn)物則最好進行純化,因為模板質(zhì)粒也可能長出菌落(但不是想構(gòu)建的目的載體)。

          2.連接反應(yīng):

          1室溫(25℃-37℃)設(shè)立10ul連接體系(建議用0.2ml PCR 管,PCR儀器控溫):

          純化后的PCR產(chǎn)物或1ul 1000bp control

          0.5-5ul

          TOPO-TA/Blunt Vector

          2ul

          10 x Enhancer

          1ul

          無菌水

          Xul

          總體積

          10ul

          加完試劑后,用移液器輕輕吹打混勻或者輕彈管底混勻,低速瞬時離心收集所有液體在離心管底,注意此步驟不能在冰上進行,只能在室溫(25℃-37℃)進行。

          注:如果使用5ul體系連接,各成分按照比例減半使用,使用次數(shù)可以加倍。不同大小插入片段的推薦用量(注意過量太多了,反而導(dǎo)致轉(zhuǎn)化子減少)

          插入片段大?。╞p)

          推薦用量(ng)

          100-1000

          10-40

          1000-2000

          40-80

          2000-5000

          80-180

          2室溫(25℃-37℃)連接5min。

          本載體推薦室溫(25℃-37℃)5min完成連接。長片段或者連接困難片段可以延長連接時間到10-15min,溫度可選37℃,可顯著增加轉(zhuǎn)化子數(shù)量。


          3連接產(chǎn)物置于冰上備用。立即接標(biāo)準(zhǔn)的感受態(tài)轉(zhuǎn)化步驟或者快速轉(zhuǎn)化步驟。

          3.快速轉(zhuǎn)化:

          1感受態(tài)細胞從-80℃拿出,迅速插入冰浴中,解凍融化(約1-3min左右)。


          2立刻加入5ul連接液(最多可全部加入,只要體積不超過感受態(tài)細胞體積的1/10), 用手撥da離心管底輕輕混勻(避免用槍吸打),冰浴放置5min。



          342℃水浴熱激60秒,迅速放回冰浴靜置2-3min,該過程不要搖動離心管。

          注意:此步驟shou選建議 42℃水浴 60 秒熱激。但是根據(jù)我們的經(jīng)驗,大部分商品化的TOP 10 和 DH5a 感受態(tài)細胞此步驟也可將離心管置于室溫(?22℃)進行, 時間不需十分準(zhǔn)確,夏季或室溫較高時,可放置 5-8min左右;如果室溫較低,可延長時間至8-15min左右。有經(jīng)驗的客戶可以根據(jù)具體情況嘗試無熱激轉(zhuǎn)化。

          4) 300-500ul LB或者SOC培養(yǎng)基(不含抗生素),37℃ 200 rpm 振蕩培養(yǎng)10min。


          根據(jù)經(jīng)驗,一般可以直接將培養(yǎng)基(如從冰箱取出溫度低,應(yīng)事先置37℃溫箱回溫至22℃-37℃)加入到感受態(tài)細胞的1.5 ml 離心管,蓋上離心管蓋,水平固定在振蕩培養(yǎng)箱中振蕩培養(yǎng)復(fù)蘇即可,不需要轉(zhuǎn)移到試管培養(yǎng)復(fù)蘇。


          一般商品化的感受態(tài)細胞不超過 2kb 插入片段情況下,熱休克后 10-15 min復(fù)蘇可以得到足夠多轉(zhuǎn)化子,如果使用實驗室自制的感受態(tài)效率低、或者轉(zhuǎn)化子少、插入片段長的情況下可以提高復(fù)蘇時間到 30-60 min以得到更多的轉(zhuǎn)化子。


          5)100-200ul菌液涂板(培養(yǎng)板含氨芐qing霉素100ug/ml),培養(yǎng)過夜。(如果預(yù)計轉(zhuǎn)化子少,為得到較多克隆,4000rpm 離心1min,吸棄掉部分上清,保留100-150ul,輕彈懸浮菌體,取全部菌液涂板)

          4.轉(zhuǎn)化子的篩選鑒定:

          本制品采用zi殺基因零背景原理,無插入自連的細菌會zi殺無法生長,因此幾乎沒有假陽性,一般情況下,可以達到所見即所得,只要是長出來的菌落正常(不是污染的雜菌,轉(zhuǎn)化子數(shù)量也不算太少),基本就包含插入。因此插入片段不超過 2-3kb 的情況下可以不用菌落PCR 鑒定,直接挑 1-2 個菌去測序。


          1)一般本公司TOPO 載體陽性率非常高,所以菌落生長正常,數(shù)量也不是太少的情況下建議省略菌落 PCR/菌液 PCR 鑒定直接去測序。注意測序引物不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物測序。

          2) TOPO 載體的菌落 PCR 結(jié)果容易出現(xiàn)假陰性。因此在使用菌落 PCR 鑒定的情況下,如菌落 PCR 結(jié)果陽性,一般可以相信此結(jié)果。如結(jié)果是陰性,或者顯示擴增出大小和預(yù)期不符合,一般不可相信,要考慮到菌落 PCR 結(jié)果假陰性的可能。需要進一步提取質(zhì)粒電泳跑大小,或者酶切鑒定來確認(rèn)。


          用上述培養(yǎng)的白色菌落的菌液抽提質(zhì)粒,插入片段較大的情況下,直接跑電泳看質(zhì)粒大小就直接能鑒定出有插入的質(zhì)粒,還可用 EcoR I/Ecor V 單酶切釋放插入片段或用其它合適的酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢查片段大小,確定是否含有目的片段。


          pTOPO-TA/Blunt 載體圖譜:

          pTOPO-TA/Blunt 載體多克隆位點序列:






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