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新型冠狀病毒系列解決方案二:糞便及環(huán)境水體類樣本病毒提取方法匯總
閱讀:2472 發(fā)布時間:2020-2-10對于糞-口傳播,除了病患的排泄物及嘔吐物還需注意環(huán)境水源中的污染檢測及控制。針對這類樣本的核酸檢測,其主要難點在于糞便及環(huán)境廢水中存在的各類高濃度抑制劑,如果在核酸提取過程中沒有*去除會導(dǎo)致下游檢測的假陰性風(fēng)險,延誤病毒的發(fā)現(xiàn)。
I
糞便&環(huán)境水體類樣本處理方法匯總
TissueRuptor
TissueLyser LT
TissueLyser II
研磨珠
2×10ml 研磨鋼罐T
2×24 2ml 適配器
使用勻漿器TissueRuptor(貨號9001272)或高通量組織研磨器TissueLyser II( 貨號85300) 可以實現(xiàn)各種組織、細菌、酵母等樣品的快速破碎和均質(zhì)化。TissueRuptor 處理單個樣品快至30 秒,TissueLyser 在2-4分鐘可處理192個樣品。
TissueRuptor TissueLyser LT&TissueLyser樣本破碎系統(tǒng):
TissueRuptor 是一款單通道的手持式電動勻漿器,使用一次性鉆頭,可對動物及人細胞或組織進行快速、高效的破碎和勻漿。
TissueLyser LT是一款中低通量的研磨器,一次可在幾分鐘內(nèi)處理12個新鮮或冰凍樣本,TissueLyser II 是一款中到高通量的研磨器,一次可處理2×24 或2×96個樣本,可在5 分鐘以內(nèi)完成,TissueLyser 系列適合各種動物組織、植物、酵母或細菌樣本。
一次性鉆頭有效降低交叉污染
快速、高效地破碎各類生物樣本
與QIAGEN 樣本純化技術(shù)無縫整合
可重復(fù)的、標(biāo)準(zhǔn)化的樣本破碎
產(chǎn)品 | 說明 | 貨號 |
Vortex Adapter for 24 (1.5–2.0 ml) tubes | 24 孔 (1.5–2 ml) Tubes | 13000-V1-24 |
Vortex Adapter for 6 (5 ml) tubes | 6 孔 (5.0 ml) Tubes | 13000-V1-5 |
Vortex Adapter for 4 (15 ml) tubes | 4 孔 (15 ml) Tubes | 13000-V1-15 |
Vortex Adapter for 2 (50 ml) tubes | 2 孔 (50 ml) Tubes | 13000-V1-50 |
TissueLyser II | 研磨儀 | 85300 |
TissueLyser Adapter Set 2×24 | Tissuelyser 適配器2×24 | 69982 |
TissueLyser Adapter Set 2×96 | Tissuelyser 適配器2×96 | 69984 |
II
糞便&環(huán)境水體類樣本處理方法匯總
01
RNeasy PowerMicrobiome Kit(50)貨號:26000-50
• 可從多至250mg糞便樣本中提取微生物總RNA。包含抑制因子去除zhuan利技術(shù),可*去除糞便樣本中各類復(fù)雜高濃度抑制劑。包含柱上DNase消化過程,獲得不含gDNA污染的總RNA。*包含2ml珠磨研磨管,搭配PowerLyzer 24(貨號:13155),30秒或渦旋振蕩儀匹配Vortex Adapter for 24(1.5-2.0 ml) tubes (貨號:13000-v1-24)10-20分鐘可獲得*裂解效果??稍赒IAcube Connect(貨號:9002864)上自動純化。從血漿、血清和無細胞體液中同時純化毒 DNA 和 RNA,無需有機提取或乙醇沉淀,*去除污染物和抑制劑。起始樣品體積可多至 0.2 ml,使用選擇性結(jié)合的硅膠膜,具有 20–150μl 的靈活洗脫體積。表格中列出的試劑盒除了可以靈活的手工操作外,均可以在 QIAcube 全自動核酸純化儀上實現(xiàn)自動化操作。
02
Allprep PowerViral DNA/RNA Kit(50) 貨號:28000-50
• 可從多至250mg糞便、腸容物樣本或200ul廢水或拭子樣本中提取所有病毒DNA和RNA。包含抑制因子去除zhuan利技術(shù),可*去除樣本中高濃度抑制劑。*包含2ml珠磨研磨管,搭配PowerLyzer 24(貨號:13155),30秒或渦旋振蕩儀匹配Vortex Adapter for 24(1.5-2.0 ml) tubes (貨號:13000-v1-24)10-20分鐘可獲得*裂解效果。
03
RNeasy PowerWater Kit(50) 貨號:14700-50-NF
• 可從一張47mm水體濾膜或25mm空氣濾膜中提取微生物總RNA。無需剪碎濾膜,避免額外接觸引入交叉污染。包含抑制因子去除zhuan利技術(shù),可*去除樣本中高濃度抑制劑。*包含5ml珠磨研磨管,搭配渦旋振蕩儀匹配Vortex Adapter for 6(5 /15 ml) tubes (貨號:13000-v1-5)10-20分鐘可獲得*裂解效果。
III
病毒定性檢測(有效提升陽性篩查率)
QuantiNova Pathogen +IC Kit (100/500) 貨號:(208652/ 208654)
• 凱杰208652內(nèi)置Internal Control(IC),幫助監(jiān)控提取及PCR效果,助力疫情篩查出真陽性!
• 內(nèi)置合成的轉(zhuǎn)錄本,可以非常好的監(jiān)控從提取,反轉(zhuǎn)錄到熒光定量的整個環(huán)節(jié),確保每個環(huán)節(jié)都精準(zhǔn)可控
• 通過內(nèi)置顏色指示劑實現(xiàn)準(zhǔn)確的反應(yīng)構(gòu)建,避免重復(fù)或者漏加樣