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          簡(jiǎn)單的質(zhì)粒DNA提取實(shí)驗(yàn)

          閱讀:1659        發(fā)布時(shí)間:2019/3/18
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                  在我們的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中經(jīng)常會(huì)用到質(zhì)粒DNA,現(xiàn)在都用劑盒非常方便,而且菌體培養(yǎng)后,可以多管濃縮提取,提到的質(zhì)粒量多,可以-20℃保存,以后用于酶切、轉(zhuǎn)化等實(shí)驗(yàn),可以提前跑個(gè)膠,只要不降解,就可以繼續(xù)用,避免每次要用,都要培養(yǎng)一遍再提取一遍。

           

                  質(zhì)粒DNA的提取

                  質(zhì)粒多為一些雙鏈、環(huán)狀的DNA分子,是獨(dú)立于細(xì)菌染色體之外進(jìn)行復(fù)制和遺傳的輔助性遺傳單位。質(zhì)粒是進(jìn)行分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)操作,進(jìn)行遺傳工程改良物種等工作時(shí)MAX主要的DNA載體。

           

                  實(shí)驗(yàn)步驟

                  1.搖菌培養(yǎng)

          1)將鑒定測(cè)序正確的克隆菌液涂在LB固體平板。

          2)置于37℃恒溫培養(yǎng)箱,培養(yǎng)12-17h,待長(zhǎng)出菌落。

          3) 滅菌15ml離心管內(nèi)加入5ml含抗生素的LB液體培養(yǎng)基,編號(hào)標(biāo)記。

          4) 挑取單克隆菌團(tuán)放置液體培養(yǎng)基,每個(gè)培養(yǎng)基放置1個(gè)菌落。

          5) 37℃,180rpm,振蕩培養(yǎng)過夜。

                  2.收獲細(xì)菌并裂解

          1) 離心擴(kuò)增好的菌液,按說明書將菌液重懸,轉(zhuǎn)入1.5ml離心管中。

          2)用質(zhì)粒小量抽提試劑盒,按說明書要求提取質(zhì)粒。

          3) 細(xì)菌高速離心1min,*去除上清。

          4)加入250ulRB溶液,振蕩器充分懸浮細(xì)菌。

          5)加入250ulLB溶液。立即上下顛倒10次,使細(xì)菌裂解,室溫,放置2min。

          6)加入250ulNB溶液。立即上下顛倒10次,使之充分中和,室溫,放置2min。

          7)室溫,1500rpm,高速離心15min。

          8)將吸附柱放入收集管內(nèi),離心得到的上清轉(zhuǎn)移至吸附柱,室溫,15000rpm,高速離心30s。

          9)棄廢液,將吸附柱放入收集管,加入700ul WB溶液到吸附柱中,15000rpm,高速離心30s。

          10)重復(fù)上一操作。

          11)將吸附柱放入干凈的1.5ml 離心管中,加30-50ul預(yù)熱的Elution Buffer,室溫,放置2min,高速離心1min。

          12)樣品進(jìn)行電泳檢測(cè):1%瓊脂糖凝膠電泳,上樣量為2ul,紫外燈下觀察,MAX明亮的帶為超螺旋形式,可以在一定程度上表明提取質(zhì)粒的純度。

                  3.質(zhì)粒的純化

          1)將之前提取好的質(zhì)粒放入1.5ml離心管中,加入1/10體積的3mol/L 無菌乙酸鈉溶液。

          2)加入2倍體積的無水乙醇,放置于-20℃沉淀4-6h或過夜。

          3)4℃,高速離心機(jī)14000rpm,離心20min.

          4)棄去上清,70%乙醇洗2次。

          5)空氣干燥,可置超凈工作臺(tái)干燥。

          6)加200ul無菌水溶液干燥后所得沉淀,即為質(zhì)粒溶液。

          7)紫外分光光度計(jì)測(cè)量質(zhì)粒濃度和產(chǎn)量。

          測(cè)量OD260和OD280的值:質(zhì)粒DNA濃度=OD260×50×稀釋倍數(shù)(μg/mL)。

           

                  10個(gè)常見問題

                  一.時(shí)間控制問題

                  裂解時(shí)間太長(zhǎng),加入溶液P2后裂解時(shí)間不應(yīng)超過5 分鐘;吸附時(shí)間不夠;溶解時(shí)間不夠都會(huì)導(dǎo)致質(zhì)粒DNA提取實(shí)驗(yàn)失敗。

                  二.大腸桿菌老化

                  建議涂布平板培養(yǎng)后,重新挑選新菌落進(jìn)行液體培養(yǎng)。

                  三.質(zhì)粒拷貝數(shù)低

                  由于使用低拷貝數(shù)載體引起的質(zhì)粒DNA 提取量低,可更換具體相同功能的高拷貝數(shù)載體。

                  四.溶液使用不當(dāng)

                  溶液P2、P3 在溫度較低時(shí)可能出現(xiàn)渾濁,應(yīng)置于37℃培養(yǎng)箱保溫片刻直至溶解為清亮的溶液,才能使用。

                  五.吸附柱過載

                  不同產(chǎn)品中吸附柱吸附能力不同,如果需要提取的質(zhì)粒量很大,請(qǐng)分多次提取。若用富集培養(yǎng)基,例如TB 或者 ×YT 菌液體積必須減少;若質(zhì)?;蛩拗骶欠浅8叩目截悢?shù)或生長(zhǎng)率,則需調(diào)整LB 培養(yǎng)液體積。

                  六.質(zhì)粒未全部溶解

                  洗脫溶解質(zhì)粒時(shí),可適當(dāng)加溫或延長(zhǎng)溶解時(shí)間。

                  七.乙醇?xì)埩?/p>

                  漂洗液洗滌后應(yīng)離心盡量去除殘留液體,樹脂型試劑盒漂洗后應(yīng)晾干樹脂,再加入洗脫緩沖液。

                  八.洗脫液加入位置不正確

                  洗脫液應(yīng)加在硅膠膜中心部位以確保洗脫液會(huì)*覆蓋硅膠膜的表面達(dá)到MAX大洗脫效率。

                  九.洗脫液不合適

                  DNA 只在低鹽溶液中才能被洗脫。洗脫效率取決于pH 值。MAX大洗脫效率在pH7.0~ 8.5 間。當(dāng)用水洗脫時(shí)確保其 pH 值在此范圍內(nèi),如果pH 過低可能性導(dǎo)致洗脫量低。洗脫時(shí)將滅菌蒸餾水或洗脫緩沖液加暖至 60 ℃后使用有利于提高洗脫效率。

                  十.洗脫體積太小

                  洗脫體積對(duì)來回收率有一定影響。隨著洗脫體積的增大回收率增高,但產(chǎn)品濃度降低。為了得到較高的回收率可以增大洗脫體積。

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