吳珊湖 李向軍
Orbitrap Astral 與您一起探索生命世界的星辰大海:
生命科學(xué)的研究中,代謝組作為蛋白組的下游組學(xué),是一切生命活動的總體映射,是更能反應(yīng)生命體實(shí)時狀態(tài)的組學(xué),代謝組和蛋白組一起,構(gòu)成了生命科學(xué)領(lǐng)域中的重點(diǎn)研究部分。
Asymmetric Track Lossless (Astral) analyzer——非對稱軌道無損質(zhì)量分析器,對比Orbitrap具有更快的掃描速度、更高的靈敏度,不光可以幫助科研工作者探索蛋白組的星辰大海,還能在代謝組研究上重塑深度鑒定的可能性,更深入地解析生命活動的奧秘,讓我們來看一下Astral在代謝組學(xué)上的表現(xiàn)。
代謝組學(xué)研究案例:
UC Davis的西海岸代謝組學(xué)研究中心進(jìn)行了一項(xiàng)疼痛隊(duì)列研究,收集了膝關(guān)節(jié)疼痛患者的血漿樣本,分為了三個組,分別是膝關(guān)節(jié)置換術(shù)前(基礎(chǔ)狀態(tài))、6周和3個月后,目的是通過檢測代謝譜的變化來了解疼痛感覺的機(jī)制。在Orbitrap Astral儀器上開發(fā)了4min內(nèi)的Hilic模式分析方法,并對比了不同的采集模式,分別是OT-AT和OT-OT,OT-AT代表Orbitrap一級分析,Astral二級分析,OT-OT代表Orbitrap做一二級分析;
圖1 OT-AT 與OT-OT方法模板
圖2對比了OT-AT與OT-OT兩模式分別檢測乙酰異羥肟酸的一級質(zhì)譜譜圖,圖3對比了OT-AT與OT-OT分別檢測次黃嘌呤的一級質(zhì)譜譜圖,雖然一級譜圖均由Orbitrap采集,但由于Astral二級掃描速度更快,從而OT-AT模式下比OT-OT模式一級的譜圖點(diǎn)數(shù)更多,點(diǎn)數(shù)更多帶來更穩(wěn)定的定量峰面積結(jié)果,同時,在一定程度上可以提高靈敏度(如圖2所示)。
圖2 OT-AT與OT-OT檢測乙酰異羥肟酸一級譜圖對比
圖3 OT-AT與OT-OT檢測次黃嘌呤一級譜圖對比
從圖4結(jié)果來看,對比OT-OT分析模式,OT-AT模式下檢測到的化合物(以帶分子式的feature計(jì))數(shù)目提高了兩倍,而帶二級譜圖的化合物數(shù)目提高了4倍,證明了Astral的快掃描速度可以帶來更多的化合物鑒定結(jié)果;從圖5 的化合物色譜分布圖來看,在峰面積更低的區(qū)域里,OT-AT的檢測覆蓋度遠(yuǎn)超OT-OT儀器,從側(cè)面證明了Astral更高的靈敏度;
圖4 OT-AT與OT-OT的化合物檢測結(jié)果對比
圖5 OT-AT與OT-OT的化合物色譜分布圖對比
更多的化合物鑒定結(jié)果帶來的好處是更能準(zhǔn)確反應(yīng)樣本間的差異,從PCA圖的對比來看,OT-AT分析模式下的組間差異要比OT-OT的組間差異更加明顯,更能反應(yīng)樣本的差異情況(圖6);
圖6 OT-AT 與OT-OT的PCA圖對比
基于Orbitap Astral更多的化合物鑒定結(jié)果,鑒定到了之前膝關(guān)節(jié)患者血漿樣本中沒有檢測到的差異性化合物,包括泮托拉唑(治療消化系統(tǒng)疾病的藥物,副作用為關(guān)節(jié)痛、肌肉痛)、水蘇堿、賴氨酸、乙酰肉堿,通過差異性化合物的發(fā)現(xiàn),可以更深入地發(fā)掘疼痛機(jī)制。
Orbitrap Astral 完美實(shí)現(xiàn)SQUAD (Simultaneous Quantitation and Discovery)—— 同時定性定量代謝組學(xué)分析流程(圖7),對比老一代orbitrap儀器,可以實(shí)現(xiàn)更低的樣本上樣量、更快的數(shù)據(jù)采集方法、更多的化合物鑒定結(jié)果、更準(zhǔn)確的化合物定量結(jié)果,精準(zhǔn)鑒定的同時完成準(zhǔn)確的定量分析。
圖7 Orbitrap Astral SQUAD代謝組學(xué)流程圖
常言道,天下武功,唯快不破,ms/ms 200 Hz 的掃描速度, Astral 無疑把“快"字拿下了,搭配Orbitrap 真正實(shí)現(xiàn)了“快、穩(wěn)、準(zhǔn)、狠"四字訣,其中“穩(wěn)"體現(xiàn)在大隊(duì)列數(shù)據(jù)的穩(wěn)定性上,“準(zhǔn)"體現(xiàn)在質(zhì)量精度和定量結(jié)果準(zhǔn)確性上,“狠"體現(xiàn)在Astral不遺余力的儀器性能,“快、穩(wěn)、準(zhǔn)、狠"四字訣的實(shí)現(xiàn)讓Orbitrap Astral牢牢把握住了探索生命科學(xué)領(lǐng)域的“武功",讓我們與Orbitrap Astral 一起駛向生命科學(xué)的星辰大海。
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