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          SNP序列查詢SOP

          來源:上海宇玫博生物科技有限公司   2018年04月26日 12:02  

           

          1, SNP序列查詢

              https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/

           

          2, 搜索目的SNP位點(diǎn):(rs114234235為例)

           

          3,搜索結(jié)果

          4, 點(diǎn)擊查看明細(xì)

          5, SNP明細(xì)信息:

           

          6, 獲取SNP上下游序列:

           

          >gnl|dbSNP|rs114234235|allelePos=201|totalLen=401|taxid=9606|snpclass=1|alleles='A/C'|mol=Genomic|build=151

           GGGAGGGGGT CTCAGGGGAG GAAGGGCAGC TCTAATTGGT TTCTCAATGA AAGATAATCA

           CCTACTCCCC AGAGAGGCTG GAGATTAGCA CTCTGCCTCT CCTCTCCATC GCTTTTAGAC

           TTCTCATCCT CCCCTCGGTG CTTTTAGTCC ATTCAGCAGA AGCGGATCGA AGCAGGAGGC

           TCCCCGCGCC GCATTAGGGG

           M

           GCACTCCGCC GCGCTCGAGT ACTTAGCGCC CATTCACTCG CTCACCCGCG CTCTCCGCTG

           CCGGCTGCCG TCCCAGCCGC CGCCGCCGCC GCCGCCGCCG CCGCCGCCCG AGAAAAAGTT

           TCGCGGAGGG GCTCAGTGAA AAAATGAGCG AGCTAGAGGA AGACTTTGCC AAGATTCTCA

           TGCTCAAGGA GGAGAGGATC

           

          7 SNP對應(yīng)基因中進(jìn)行比對

             rs114234235位于PRKG1基因的啟動子區(qū)域;

          http://www.umibio。。cn/Luciferase

           

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