1, SNP序列查詢
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
2, 搜索目的SNP位點(diǎn):(rs114234235為例)
3,搜索結(jié)果
4, 點(diǎn)擊查看明細(xì)
5, SNP明細(xì)信息:
6, 獲取SNP上下游序列:
>gnl|dbSNP|rs114234235|allelePos=201|totalLen=401|taxid=9606|snpclass=1|alleles='A/C'|mol=Genomic|build=151
GGGAGGGGGT CTCAGGGGAG GAAGGGCAGC TCTAATTGGT TTCTCAATGA AAGATAATCA
CCTACTCCCC AGAGAGGCTG GAGATTAGCA CTCTGCCTCT CCTCTCCATC GCTTTTAGAC
TTCTCATCCT CCCCTCGGTG CTTTTAGTCC ATTCAGCAGA AGCGGATCGA AGCAGGAGGC
TCCCCGCGCC GCATTAGGGG
M
GCACTCCGCC GCGCTCGAGT ACTTAGCGCC CATTCACTCG CTCACCCGCG CTCTCCGCTG
CCGGCTGCCG TCCCAGCCGC CGCCGCCGCC GCCGCCGCCG CCGCCGCCCG AGAAAAAGTT
TCGCGGAGGG GCTCAGTGAA AAAATGAGCG AGCTAGAGGA AGACTTTGCC AAGATTCTCA
TGCTCAAGGA GGAGAGGATC
7, 在SNP對應(yīng)基因中進(jìn)行比對
rs114234235位于PRKG1基因的啟動子區(qū)域;
http://www.umibio。。cn/Luciferase
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