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          兼容常規(guī)與鏈特異性mRNA文庫構建

          來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2019年10月30日 17:48  

          Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina

          ——兼容常規(guī)與鏈特異性mRNA文庫構建

          背景簡介

          RNA被認為是生物信息傳遞的“橋梁”。而轉錄組測序可利用NGS技術對組織或者細胞中的RNA反轉錄之后的cDNA文庫測序,通過分析可計算不同RNA的表達量、發(fā)現新的轉錄本、進行轉錄本定位、分析可變剪切、檢測基因融合等,提供全面的轉錄組信息。

           

          圖 遺傳學中心法則

          目前主流的mRNA建庫主要流程是mRNA純化,mRNA逆轉錄,雙鏈cDNA合成,末端修復,A尾添加,接頭連接,純化/分選,文庫擴增,時間上需要1.5 d甚至更久。

          翊圣生物結合自身多年的分子酶創(chuàng)新研發(fā)經驗,推出升級版快速mRNA建庫試劑盒,可在短的時間進行建庫。助力獲得優(yōu)異的轉錄組測序數據。

           

          亮點一覽

          1、建庫快速:完整建庫比主流方法縮減1.5-2 h,1 d內獲得高質量文庫。

           

          圖 升級版建庫試劑盒建庫流程

          2、兼容常規(guī)與鏈特異性文庫構建

          本產品搭配兩種二鏈合成buffer,即含dNTP(常規(guī)建庫)與dUTP(鏈特異性建庫),可兼容兩種模式的mRNA文庫構建。一個盒子兩種用處,不用再額外備貨。

          3、逆轉錄酶,更適合復雜模板

          RNaseH能特異的降解RNA-DNA雜交分子中RNA的特性,將RNA降解成小片段,影響反轉錄效率。YEASEN提供的第四代Hifair逆轉錄酶,去除RNase H活性,同時溫度的耐受性高達65℃,有利于復雜RNA模板二級結構的打開,更利于逆轉錄的進行。

           

           

          硬核支撐

          以1 μg的標準品RNA(Agilent#740000)為起始,分別構建鏈特異性文庫和非鏈特異性文庫,質控后的文庫用illumina Hiseq X-10 PE150測序。

          a. 優(yōu)異的測序質量

           

          b. 表達重復性高

           

          c. 優(yōu)異的文庫均一性

           

          d. rRNA殘留更低,有用數據更多

           

           

          e. 鏈特異性建庫:98.5%的Reads比對到正義鏈上

           

           

          客戶案例

          單位:廣州某生物公司J*

          樣本:草莓,油菜,核盤菌

          結論:高質量文庫,優(yōu)異的測序數據

          a. 文庫報告

           

          b. 測序質量

           

          c. 數據比對

           

          d. 數據分布

           

          e. 基因覆蓋度分析

           

          單位:上海某生物公司O*

          樣本:人,大鼠,西瓜

          結論:高質量文庫,優(yōu)異的測序數據

          a. 建庫報告

           

          b. 測序質量

           

          c. 數據比對

           

          d. 數據分布

           

          e. 基因覆蓋度分析

           

           

          相關產品:

           

          類型

          名稱

          貨號

          規(guī)格

          建庫試劑盒

          Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual mode mRNA Library Prep Kit for Illumina®

          12300ES24/96

          24/96 T

          mRNA富集磁珠

          Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit

          12603ES24/96

          24/96 T

          rRNA去除試劑盒

          Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

          12253ES24/96

          24/96 T

          RNA純化磁珠

          Hieff NGS® RNA Cleaner

          12602ES56/75

          60/450 mL

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