Hieff NGS® MaxUp II Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina
——兼容常規(guī)與鏈特異性mRNA文庫構建
背景簡介
RNA被認為是生物信息傳遞的“橋梁”。而轉錄組測序可利用NGS技術對組織或者細胞中的RNA反轉錄之后的cDNA文庫測序,通過分析可計算不同RNA的表達量、發(fā)現新的轉錄本、進行轉錄本定位、分析可變剪切、檢測基因融合等,提供全面的轉錄組信息。
圖 遺傳學中心法則
目前主流的mRNA建庫主要流程是mRNA純化,mRNA逆轉錄,雙鏈cDNA合成,末端修復,A尾添加,接頭連接,純化/分選,文庫擴增,時間上需要1.5 d甚至更久。
翊圣生物結合自身多年的分子酶創(chuàng)新研發(fā)經驗,推出升級版快速mRNA建庫試劑盒,可在短的時間進行建庫。助力獲得優(yōu)異的轉錄組測序數據。
亮點一覽
1、建庫快速:完整建庫比主流方法縮減1.5-2 h,1 d內獲得高質量文庫。
圖 升級版建庫試劑盒建庫流程
2、兼容常規(guī)與鏈特異性文庫構建
本產品搭配兩種二鏈合成buffer,即含dNTP(常規(guī)建庫)與dUTP(鏈特異性建庫),可兼容兩種模式的mRNA文庫構建。一個盒子兩種用處,不用再額外備貨。
3、逆轉錄酶,更適合復雜模板
RNaseH能特異的降解RNA-DNA雜交分子中RNA的特性,將RNA降解成小片段,影響反轉錄效率。YEASEN提供的第四代Hifair逆轉錄酶,去除RNase H活性,同時溫度的耐受性高達65℃,有利于復雜RNA模板二級結構的打開,更利于逆轉錄的進行。
硬核支撐
以1 μg的標準品RNA(Agilent#740000)為起始,分別構建鏈特異性文庫和非鏈特異性文庫,質控后的文庫用illumina Hiseq X-10 PE150測序。
a. 優(yōu)異的測序質量
b. 表達重復性高
c. 優(yōu)異的文庫均一性
d. rRNA殘留更低,有用數據更多
e. 鏈特異性建庫:98.5%的Reads比對到正義鏈上
客戶案例
單位:廣州某生物公司J*
樣本:草莓,油菜,核盤菌
結論:高質量文庫,優(yōu)異的測序數據
a. 文庫報告
b. 測序質量
c. 數據比對
d. 數據分布
e. 基因覆蓋度分析
單位:上海某生物公司O*
樣本:人,大鼠,西瓜
結論:高質量文庫,優(yōu)異的測序數據
a. 建庫報告
b. 測序質量
c. 數據比對
d. 數據分布
e. 基因覆蓋度分析
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類型 | 名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
建庫試劑盒 | Hieff NGS® MaxUpⅡ Dual mode mRNA Library Prep Kit for Illumina® | 12300ES24/96 | 24/96 T |
mRNA富集磁珠 | Hieff NGS® mRNA Isolation Master Kit | 12603ES24/96 | 24/96 T |
rRNA去除試劑盒 | Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) | 12253ES24/96 | 24/96 T |
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