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        1. 產(chǎn)品推薦:氣相|液相|光譜|質(zhì)譜|電化學(xué)|元素分析|水分測定儀|樣品前處理|試驗(yàn)機(jī)|培養(yǎng)箱


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          pBM16A Toposmart Cloning Kit常見問題分析

          來源:上海研謹(jǐn)生物科技有限公司   2021年03月10日 11:15  

          pBM16A Toposmart Cloning Kit

           

           

          產(chǎn)品信息:

           

          組 成

          YCL071-01

          YCL071-02

          pBM16A Vector (20ng/ml )

          20ml

          20ml×3

          10×Toposmart

          20ml

          20ml×3

          Control Insert

          5ml

          5ml

          M13F Primer

          0.1OD

          0.1OD×3

          M13R Primer

          0.1OD

          0.1OD×3

          保存條件:-20℃保存,有效期一年。

          產(chǎn)品介紹:

          pBM16A Toposmart克隆試劑盒利用痘苗病毒的拓?fù)洚悩?gòu)酶I(Topoisomerase I)的切割再連接的特點(diǎn)將片段克隆到載體中。不僅適用于克隆由Pfu、KOD、Xerox、Phusion Q5等高保真DNA聚合酶擴(kuò)增的平末端PCR產(chǎn)物,也可克隆由Taq、TthklenTaqDNA聚合酶擴(kuò)增的帶A尾的PCR產(chǎn)物。試劑盒中的pBM16A載體為線性化的質(zhì)粒??梢杂靡飳?/font>M13FM13R進(jìn)行菌落PCR鑒定陽性克隆。

          產(chǎn)品特點(diǎn):

          1連接反應(yīng)僅需5 分鐘。

          2適用于平末端PCR產(chǎn)物和帶A尾的PCR產(chǎn)物。

          3載體采用了新的制備工藝,無需藍(lán)白斑篩選。

          1. 克隆位點(diǎn)兩旁都有Smal和EcoR V酶切位點(diǎn),適合單酶切鑒定。
          2. 載體具有氨芐青霉素抗性。

          操作步驟:

          1. 連接反應(yīng)

          按下表,在一個0.2ml PCR 管中依次加入加完試劑后,輕輕混勻低速離心,使溶液集中在管底。

          成分

          體積

          DNA -*片段

          0.5-8µl

          pBM16A Topo載體

          1ml

          10×Toposmart

          1ml

          補(bǔ)水至總體積

          10ml

           注意:此步驟不要在低溫條件下(冰水?。┥喜僮?。

           2. 反應(yīng)溫度及片段要求

          室溫下20-30℃)放置 0-5 分鐘,然后將離心管放置在冰上。如當(dāng)天不進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)。請將連接產(chǎn)物置于-20℃保存。

          注意:DNA-*片段的用量見下表

           

          片段大小(bp

          建議用量(ng

          100-1000

          20-50

          1000-2000

          50-100

          2000-5000

          100-200

           

          室溫下20-30℃)反應(yīng)時間 5-30 分鐘,如果室溫較低,推薦使用 PCR 儀器控制溫度。可以設(shè)置 25℃反應(yīng) 5 分鐘。如果 PCR 產(chǎn)物電泳檢測僅有很銳利明亮的條帶,無引物二聚體和非特異性條帶存在,可直接取 0.5-1µl PCR 產(chǎn)物原液進(jìn)行克隆。

          3. 陽性對照反應(yīng)

          1µl 試劑盒提供的1kb長度的對照片段LacZ 基因α肽片段進(jìn)行克隆,轉(zhuǎn)化具有α 互補(bǔ)功能的大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞( DH5α,*0,Mach1-T1 。菌液涂布在含有IPTG,X-gal LB 氨芐平板上,次日藍(lán)色菌落為陽性克隆,說明有片段插入,白色菌落為空載體。

          4. 轉(zhuǎn)化

          1.5µl 連接產(chǎn)物到50-100µl 剛剛?cè)诨母惺軕B(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻,冰浴2-30 分鐘。

          2.42℃水浴中熱擊30 秒鐘。

          3. 立刻置于冰水浴中2 分鐘。

          加入300-500µl 無菌的不含抗生素的SOC LB,37℃,200-250rpm 振蕩培養(yǎng)60 鐘。

          注:小于 2kb 片段可以不復(fù)蘇,直接涂平板。

          • 吸取200µl 菌液涂布。為了得到更多的菌落,可以先4000rpm 離心1 分鐘,去掉部分上清,用移液器輕吹菌體,充分懸浮菌液,取全部菌液涂布,然后 37℃培養(yǎng)過夜12-16 小時。

          5. 陽性重組子的鑒定菌落 PCR

          (1) 菌落PCR方法鑒定陽性克隆

          ① 用10ml吸頭挑選克隆至預(yù)先加有10μl無菌水或LB培養(yǎng)基的PCR管中,吹打混合。

          25ml PCR反應(yīng)體系:取2μl細(xì)菌懸液為模板、加入5μM 濃度的M13F/M13R

          1μl進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

          PCR擴(kuò)增條件:95℃預(yù)變性5分鐘(裂解細(xì)胞,失活核酸酶),94℃變性10鐘,55℃退火10秒鐘,72℃延伸 根據(jù)片段的大小決定延伸時間,通常每1min/1kbX秒,30個循環(huán),72℃后延伸5分鐘。1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴(kuò)增結(jié)果,有強(qiáng)烈的明顯條帶的克隆為重組體,與插入片段大小相近M13F/M13R 引物在克隆位置的兩側(cè),所以PCR擴(kuò)增出的DNA的長度比插入片段大138bp 可視為陽性克隆。菌落PCR方法鑒定重組子時一定要設(shè)立一個不加菌液的陰性對照。

          (2) 測序:用M13FM13R通用引物對陽性質(zhì)粒進(jìn)行測序分析。

          pBM16A載體圖譜

           

           
           
          常見問題分析

           

          重組子克隆菌少,或陽性率低:

          (1) 感受態(tài)效率低,使用轉(zhuǎn)化效率>5×107cfu/µg 的感受態(tài)細(xì)胞

          (2) 連接反應(yīng)在低溫下(如放碎冰上)操作,應(yīng)該在室溫下操作。

          (3) PCR 片段加入量太多或太少,按照推薦量加入。

          (4) PCR 純度低,重新擴(kuò)增或重新純化PCR 產(chǎn)物。

          (5) PCR 質(zhì)量低,切膠時在紫外下照射時間長,需重新制備。

          (6) PCR 擴(kuò)增結(jié)束后,應(yīng)該再延伸5-10 分鐘,確保片段延伸*。

          (7) 轉(zhuǎn)化后沒有復(fù)蘇培養(yǎng),可以加入SOC LB,培養(yǎng)60分鐘。

          • 克隆基因可能對宿主菌有毒性,比如某些編碼膜蛋白和 DNA 結(jié)合蛋白的基因,某些啟動子和調(diào)節(jié)序列基因,或含有倒置或串聯(lián)重復(fù)序列的基因,選用室溫過夜培養(yǎng)平板。

           

          載體序列:

          >pBM16A Topo AGTGAGTTGATTGTGTAAAACGACGGCCAGTGTCTGAGGCTCGCTTCAGTCCTGATGCTTGATATCCCGGGCGT GTCGCCCTT$$$$AAGGGCGACACGCCCGGGATATCGCGTCTGCCTGAAGTCAATACTGACGATGGTCATAGCT GTTTCCTGTCCATAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTTGATCGGCACGTAAGAGGTTCC AACTTTCACCATAATGAAATAAGATCACTACCGGGCGTATTTTTTGAGTTATCGAGATTTTCAGGAGCTAAGGA AGCTAAAATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCACTTATTCCGTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTG CTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTG GATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGT TCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTC AGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGC AGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCT AACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCA TACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAA CTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCG CTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGCTCTCGCGGTATCATTG CAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGAT GAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAATGAGGGCCCAAATGTAATCA CCTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATC ACAAAAATCGATGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGA AGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAG CGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTG TGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGA CACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGA GTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAG TTACCTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTT GCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATTTTCTACCGAAGAAAGGCCCAC CCGTGAAGGTGAGCC

                                                                     本產(chǎn)品僅供研究不用于臨床診斷

          實(shí)驗(yàn)代做服務(wù):

          ELISA試劑盒免費(fèi)代檢測

          CCK8檢測

          HE染色

          蛋白相互作用分析

          Western Blot

          免疫組化IHC染色

          熒光定量PCR

          動物模型服務(wù)

          流式細(xì)胞檢測

          免疫熒光染色

          激光共聚焦

          DNA甲基化實(shí)驗(yàn)

          石蠟/冰凍切片

          透射電鏡服務(wù)

          掃描電鏡實(shí)驗(yàn)

          蛋白雙向(2-D)

          動物實(shí)驗(yàn)

          免疫共沉淀

          原位雜交(FIsh

          蛋白質(zhì)純化

          分子克隆和質(zhì)粒載體構(gòu)建服務(wù)

          組蛋白甲基化磷酸化乙酰化

           

          蛋白雙向2D-WB

           

          藥理毒理動物實(shí)驗(yàn)

           

          番紅O固綠染色

          明膠酶譜MMP

          酶活性檢測

          動物造模/模型實(shí)驗(yàn)服務(wù)

                                              

           

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