什么是生物芯片呢?
簡單說,生物芯片就是在一塊玻璃片、硅片、尼龍膜等材料上放上生物樣品,然后由一種儀器收集信號,用計算機分析數(shù)據(jù)結(jié)果。人們可能很容易把生物芯片與電子芯片聯(lián)系起來,雖然,生物芯片和電子芯片確實有著聯(lián)系,但它們是不同的兩種東西。生物芯片并不等同于電子芯片,只是借用概念,它的原名叫“核酸微陣列”,因為它上面的反應(yīng)是在交叉的縱列中所發(fā)生。
生物芯片(biochip)是指采用光導(dǎo)原位合成或微量點樣等方法,將大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至組織切片、細(xì)胞等等生物樣品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝膠、尼龍膜等載體)的表面,組成密集二維分子排列,然后與已標(biāo)記的待測生物樣品中靶分子雜交,通過特定的儀器比如激光共聚焦掃描或電荷偶聯(lián)攝影像機(CCD)對雜交信號的強度進行快速、并行、高效地檢測分析,從而判斷樣品中靶分子的數(shù)量
生物芯片技術(shù)源于核酸分子雜交。所謂生物芯片一般指高密度固定在互相支持介質(zhì)上的生物信息分子(如基因片段、CDN*片段或多肽、蛋白質(zhì))的微陣列雜交型芯片(micro-arrays),陣列中每個分子的序列及位置都是已知的,并且是預(yù)先設(shè)定好的序列點陣,微流控芯片(microfluidic chips)和液態(tài)生物芯片是比微陣列芯片后發(fā)展的生物芯片新技術(shù)。生物芯片技術(shù)是系統(tǒng)生物技術(shù)的基本內(nèi)容。
生物芯片主要特點是高通量、微型化和自動化。生物芯片上高度集成的成千上萬密集排列的分子微陣列,能夠在很短時間內(nèi)分析大量的生物分子,使人們能夠快速準(zhǔn)確地獲取樣品中的生物信息,檢測效率是傳統(tǒng)檢測手段的很多倍。基因芯片是生物芯片技術(shù)中發(fā)展成熟和先實現(xiàn)商品化的產(chǎn)品?;蛐酒腔诤怂崽结樆パa雜交技術(shù)原理而研制的。所謂核酸探針只是一段人工合成的堿基序列,在探針上連接上一些可檢測的物質(zhì),根據(jù)堿基互補的原理,利用基因探針到基因混合物中識別特定基因。基因芯片,又稱DNA芯片,DNA微陣列(DNAmicroar ray),和我們?nèi)粘Kf的計算機芯片非常相似,只不過高度集成的不是半導(dǎo)體管,而是成千上萬的網(wǎng)格狀密集排列的基因探針,通過已知堿基順序的DN*片段,來結(jié)合堿基互補序列的單鏈DNA,從而確定相應(yīng)的序列,通過這種方式來識別異常基因或其產(chǎn)物等。目前,比較成熟的產(chǎn)品有檢測基因突變的基因芯片和檢測細(xì)胞基因表達水平的基因表達譜芯片?;蛐酒夹g(shù)主要包括四個基本技術(shù)環(huán)節(jié):芯片微陣列制備、樣品制備、生物分子反應(yīng)和信號的檢測及分析。
目前制備芯片主要采用表面化學(xué)的方法或組合化學(xué)的方法來處理固相基質(zhì)如玻璃片或硅片,然后使DN*片段或蛋白質(zhì)分子按特定順序排列在片基上。目前已有將近40萬種不同的DNA分子放在1平方厘米的高密度基因芯片,并且正在制備包含上百萬個DNA探針的人類基因芯片。生物樣品的制備和處理是基因芯片技術(shù)的第二個重要環(huán)節(jié)。生物樣品往往是非常復(fù)雜的生物分子混合體,除少數(shù)特殊樣品外,一般不能直接與芯片進行反應(yīng)。要將樣品進行特定的生物處理,獲取其中的蛋白質(zhì)或DNA、RNA等信息分子并加以標(biāo)記,以提高檢測的靈敏度。第三步是生物分子與芯片進行反應(yīng)。芯片上的生物分子之間的反應(yīng)是芯片檢測的關(guān)鍵一步。通過選擇合適的反應(yīng)條件使生物分子間反應(yīng)處于*佳狀況中,減少生物分子之間的錯配比率,從而獲取能反映生物本質(zhì)的信號?;蛐酒夹g(shù)的后一步就是芯片信號檢測和分析。目前常用的芯片信號檢測方法是將芯片置入芯片掃描儀中,通過采集各反應(yīng)點的熒光強弱和熒光位置,經(jīng)相關(guān)軟件分析圖像,即可以獲得有關(guān)生物信息。
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