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在選擇色譜柱之前，先多了解自己的樣品和雜質(zhì)，他們的類型結(jié)構(gòu)、極性、酸堿性、分子量大小等等。
1.樣品是極性的且弱酸性的；就可以選擇C18在酸性水溶液條件下檢測(cè)，即要選擇承受純水且對(duì)極性化合物保留很好的色譜柱
2. 如果樣品極性太強(qiáng)，或酸性太強(qiáng)；可以選擇CN，NH2，或硅膠柱，HILIC（親水色譜），也有使用C18+強(qiáng)陰離子對(duì)試劑或強(qiáng)陰離子交換色譜柱（缺點(diǎn)是離子對(duì)試劑平衡時(shí)間長(zhǎng)，對(duì)流動(dòng)相pH要求比較精密，否 則很難重復(fù)實(shí)驗(yàn)，另外離子對(duì)試劑很難洗下來，基本上用了離子對(duì)的色譜柱就不能再用于其它實(shí)驗(yàn)）
3. 若樣品是堿性的；可選擇高純硅膠柱（高純硅膠缺少金屬雜質(zhì)，且硅膠端基封尾）或一些經(jīng)過修飾的C18柱（如極性嵌入技術(shù)或堿去活技術(shù)等），他們都會(huì)減少堿性化合物的拖尾，一般會(huì)選擇中性或偏堿的條件下做，因?yàn)檫@樣可增加堿性樣品的保留
4.如果堿性化合物的極性太強(qiáng)，或堿性太強(qiáng)；可以選擇寬pH的C18色譜柱在高pH值檢測(cè)（優(yōu)點(diǎn)是方法開發(fā)簡(jiǎn)單，缺點(diǎn)是目前實(shí) 現(xiàn)這一技術(shù)的色譜柱品牌比較少，價(jià)格也高）或者選用HILIC色譜柱（硅膠柱在反相條件下使用，這也是很經(jīng)典的檢測(cè)堿性樣品的方法）選擇強(qiáng)離子交換柱（缺點(diǎn) 是不能用來分析其它樣品，對(duì)流動(dòng)相pH要求比較精密，否則很難重復(fù)實(shí)驗(yàn)）也有使用C18+強(qiáng)陰離子對(duì)試劑或強(qiáng)陰離子交換色譜柱
色譜柱按用途可分為分析型和制備型兩類
①常規(guī)分析柱（常量柱），內(nèi)徑2~5mm,柱長(zhǎng)10~30cm；
②窄徑柱（narrowbore），內(nèi)徑1~2mm，柱長(zhǎng)10~20cm；
③毛細(xì)管柱（又稱微柱microcolumn），內(nèi)徑0.2~0.5mm；
④半制備柱，內(nèi)徑＞5mm；
⑤實(shí)驗(yàn)室制備柱，內(nèi)徑20~40mm，柱長(zhǎng)10~30cm；
⑥生產(chǎn)制備柱內(nèi)徑可達(dá)幾十厘米。
色譜柱的性能除了與固定相性能有關(guān)外，還與填充技術(shù)有關(guān)。在正常條件下，填料粒度>20um時(shí)，干法填充制備柱較為合適；顆粒<20um時(shí)，濕法填充較為理想。填充方法一般有四種：
①高壓勻漿法，多有用于分析柱和小規(guī)模制備柱的填充；
②徑向加壓法，Waters**；
③軸向加壓法，主要用于裝填大直徑柱；
④干法，柱填充的技術(shù)性強(qiáng)，大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室使用己填充好的商品柱。
須指出，高效液相色譜柱的獲得，裝填技術(shù)是重要環(huán)節(jié)，但根本問題還在于填料本身性能的優(yōu)劣，以及配套的色譜儀系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)是否合理。
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