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核酸質(zhì)譜，顧名思義是一種能檢測核酸的質(zhì)譜，它是基于MALDI-TOF MS質(zhì)譜發(fā)展起來的一種多重PCR分析檢測系統(tǒng)。
全自動核酸質(zhì)譜系統(tǒng)檢測系統(tǒng)不存在雜交錯配干擾，無需熒光染料，直接以核酸片段的分子量大 小為標記，適用于各種類型的核酸分析實驗。為生 物醫(yī)學、臨床分子診斷、轉(zhuǎn)化醫(yī)學、 腫瘤學、個體化醫(yī)療、微生物流行病學研究等多種核酸檢測領域 帶來了新的契機。質(zhì)譜分析作為定量檢測分 在檢測的靈敏度、特異性、分析速度、多指標同時 檢測等方面有非常強的優(yōu)勢，臨床上可實現(xiàn)對部分 傳統(tǒng)檢測方法的技術(shù)替代。
核酸質(zhì)譜系統(tǒng)的應用
1、 單核苷酸多態(tài)性
人類的好多遺傳性疾病是在SNP上的，單核苷酸多態(tài)性就是單個的核苷酸序列發(fā)生了變異，引起了DNA序列發(fā)生了多樣性，比例高達1%。它也是疾病易感基因和藥物反應差異性的決定因素。所以通過分析SNP的變異位點，提供疾病預測，診斷和提供用藥指導等。
目前熒光定量PCR適宜于檢測單基因幾個位點(2-8個)，但是隨著醫(yī)學技術(shù)的深入發(fā)展，涉及到多基因多位點的疾病越來越多，這時傳統(tǒng)熒光定量PCR的不足就會表現(xiàn)出來，工作量大，檢測速度慢。而核酸質(zhì)譜高靈敏度、分離速度快、雜質(zhì)干擾少等優(yōu)勢，可以一網(wǎng)打盡(比如耳聾基因，4個基因20個位點，核酸質(zhì)譜可以在一個檢測孔中解決)。
應用：藥物基因組檢測、腫瘤易感基因
2、 基因突變
基因突變檢測與SNP檢測原理相同，區(qū)別在于基因突變檢測存在的是突變型(發(fā)生突變后的樣子)和野生型(原來的樣子)，這一點與SNP的純合型(比如顯性純合)和雜合型(雜合子)有所區(qū)別。圖譜峰的面積與樣品中分子量所代表的核酸片段含量成正比，故可以通過突變型/野生型的比值確定突變點的比例，可檢測到0.5%以上的突變比例，與金標準驗證技術(shù)符合度>95%。
應用：腫瘤突變(EGFR突變)，耳聾基因篩查，地中海型貧血、代謝綜合 征、冠狀動脈疾病等
3、 DNA甲基化
最近腫瘤早篩比較火熱，其中提到的比較多的就是甲基化。人類基因組中含有3-5%的胞嘧啶，會在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下與甲基基團CpG二苷酸的C’5位上，形成一個CpG島(300-3000bp)，這個CpG島的甲基化水平異常提高，會抑制抑癌基因轉(zhuǎn)錄失活或者一些原癌基因被激活。另外DNA甲基化還與記憶缺陷，精神分裂癥、抑郁狂躁等復雜疾病有關(guān)。
相比較其他方法，核酸質(zhì)譜的優(yōu)勢就在于可檢測低至5%的甲基化水平，特異性好，靈敏度高。
應用：宮頸癌、胃癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、肝癌、食道癌、垂體腺瘤等
4、 基因拷貝數(shù)鑒定
人類的基因組會出現(xiàn)一段序列缺失或者增加導致序列發(fā)生變化而引起產(chǎn)物變化。這種表型上的差異就是拷貝數(shù)變異(CNV)，CNV涉及的DNA片段大小通常介于1kbp-3Mbp之間，在基因組中分布廣泛，其與臨床上罕見病相關(guān)，也與很多腫瘤等復雜病相關(guān)。因此對CNV的變異研究，能夠?qū)Χ喾N疾病并發(fā)機制形成新的認知，以更好地指導疾病的分子診斷和新治療方法的開發(fā)。
核酸質(zhì)譜可以通過SNP的多態(tài)性等位基因比例(SAR)檢測技術(shù)對待檢測標本中目標基因的拷貝數(shù)進行定量分析。
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