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          什么是納米盤(Nanodisc)?

          來源:成都正民德思生物科技有限公司   2022年12月08日 11:07  

          1:穩(wěn)定膜蛋白的納米盤示意圖

          綠色:穩(wěn)定帶 - 在本例中為MSP 蛋白

          灰色:磷脂

          橙色:穩(wěn)定的膜蛋白


          納米盤一詞描述了一種小尺寸(直徑:7-50 nm)圓盤狀結(jié)構(gòu)物,可應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)和生物醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域。納米盤主要由兩個組件構(gòu)成:1、磷脂,可以是人造磷脂或細(xì)胞膜磷脂2、將磷脂綁定在一起的穩(wěn)定帶,可以是 MSP 蛋白或合成聚合物。


          Nanodisc納米盤的用途

          2:膜蛋白同時具有疏水性和親水性。納米盤可以使膜蛋白溶于水溶液。


          問題是,與可溶性蛋白質(zhì)不同,膜蛋白嵌在脂質(zhì)膜中,因此很難在天然環(huán)境中對其進行分析。磷脂雙分子層疏水核心中的膜蛋白表層也具有疏水性,而與水性膜環(huán)境接觸的表層區(qū)與普通可溶性蛋白的表層一樣具有親水性(2)。同一分子上廣泛存在疏水和親水表面,這是膜蛋白的特征。因此,在缺乏增溶劑的情況下,膜蛋白不溶于標(biāo)準(zhǔn)緩沖水溶液。例如,納米盤需要溶解膜蛋白,以模擬磷脂雙分子層的兩親環(huán)境,同時將膜蛋白的結(jié)構(gòu)維持在生理相似的狀態(tài)。


          兩種納米盤類型

          3:兩種類型的納米盤:合成納米盤(藍(lán)色穩(wěn)定劑)和 MSP 納米盤(綠色穩(wěn)定劑)


          納米盤用于模擬細(xì)胞的天然磷脂雙分子層,以此來尋找靶分子(通常為膜蛋白)。膜蛋白是細(xì)胞間通訊的關(guān)鍵物質(zhì),介導(dǎo)基本的生物過程,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、跨膜轉(zhuǎn)運過程、化學(xué)信號傳感及胞間相互作用的協(xié)調(diào)。


          多種人體疾病都與膜蛋白有關(guān),膜蛋白因而成為藥物開發(fā)的重要靶標(biāo)。然而,出乎意料的是,膜蛋白由高達約23%的基因進行編碼,而其占已知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的比率卻不足1%(1)。


          1:MSP 納米盤和合成納米盤之間的簡要對比

          但首先,我們將分別介紹這兩種納米盤,先從 MSP 納米盤開始。


          MSP納米盤

          MSP 納米盤通過膜支架蛋白(MSP)固定在一起。MSP可以是截短型載脂蛋白(apo)A-I,其包裹在一小塊磷脂雙分子層上,形成圓盤狀顆粒或納米盤(5)。MSP提供了面向脂質(zhì)疏水尾的疏水面,以及外部的親水面。這樣設(shè)置使得納米盤在水溶液中高度可溶。一旦組裝成納米盤,就可以在沒有去污劑的情況下將膜蛋白保持在溶液中(5)。 尺寸:MSP 納米盤的尺寸范圍為 7 - 17 nm。尺寸由所采用的膜支架蛋白決定。表 2 描述了 由Cube Biotech 提供的膜支架蛋白及相關(guān)的納米盤尺寸。相同 MSP 蛋白的MSP 納米盤尺寸均一,直徑僅相差 +/- 1 nm。非常適合進行使用冷凍電鏡(Cryo-EM)的研究。


          2:MSP 蛋白質(zhì)及相關(guān)納米盤尺寸概述


          MSP納米盤的其他優(yōu)點

          與其他膜蛋白增溶和重組系統(tǒng)相比,MSP納米盤具備許多優(yōu)勢,尤其在配體結(jié)合研究、構(gòu)象動力學(xué)分析以及蛋白質(zhì)相互作用研究等方面(6)。納米盤可用于在類似于天然膜的人工環(huán)境中重組GPCR 或轉(zhuǎn)運蛋白等膜蛋白質(zhì)。

          4:MSP 納米盤示意圖。


          這些經(jīng)由納米盤穩(wěn)定的蛋白質(zhì)可通過常規(guī)的色譜層析程序直接純化。得到的純化膜蛋白-納米盤復(fù)合物可應(yīng)用于需要接觸蛋白質(zhì)的生理細(xì)胞內(nèi)及細(xì)胞外表面的場景,從而能夠不受限制地接觸拮抗劑、激動劑、G 蛋白及其他相互作用對象(7)。


          如何生成 MSP納米盤 + 蛋白質(zhì) - 復(fù)合物

          5:兩種將重組蛋白插入納米盤的方法示意圖。A:將組裝好的納米盤添加到無細(xì)胞反應(yīng)中。初生蛋白可自然插入。B:將去污劑和MSP添加到表達目的蛋白的細(xì)胞質(zhì)中。組成膜磷脂、蛋白質(zhì)和 MSP的復(fù)合物。


          A:結(jié)合納米盤與無細(xì)胞表達系統(tǒng)從表達質(zhì)粒開始,可在無細(xì)胞系統(tǒng)中生成膜蛋白。在整合了初生膜蛋白(8)的混合物中提供預(yù)組裝納米盤。不需要額外添加去污劑,這樣可以最大限度地減少偽影的存在。作為一個可選項,可以將生物素?;蛲凰貥?biāo)記等修飾包含在內(nèi)。


          B:去污劑增溶蛋白質(zhì)的兩步重組從合適去污劑中的純化膜蛋白開始,添加膜支架蛋白和磷脂。包含膜蛋白的納米盤可自發(fā)形成,并通過親和或排阻層析法純化得到(6,7)。


          C:直接從膜增溶從表達目標(biāo)蛋白的膜開始,添加去污劑和膜支架蛋白(MSP)。膜磷脂、膜蛋白和 MSP 組裝形成納米圓盤復(fù)合物(5)。此處,獲得了表征膜蛋白群的納米盤復(fù)合物的混合物,可用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究。如果需要,可采用親和色譜法純化對單個膜蛋白-納米盤復(fù)合物進行純化處理。與方法 B 相比,接觸去污劑的時間明顯縮短了(從按天數(shù)縮短為按小時)。


          磷脂的選擇——維持適當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)活性的關(guān)鍵

          如前所述,MSP 納米盤的磷脂成分是人造的。這意味著,必須事先確定好構(gòu)成目的膜蛋白所需人工膜環(huán)境的磷脂。但存在多種磷脂可供選擇,應(yīng)該選擇哪一種呢?

          對于這個問題,請參閱我們常用于 MSP 納米盤的磷脂列表:


          二肉豆蔻酰磷脂酰膽堿(DMPC)

          棕櫚酰-油酰-磷脂酰膽堿(POPC)

          磷脂酰甘油(DMPG)

          這些選項以及其他眾多磷脂已成功實現(xiàn)單獨或組合應(yīng)用(8,25)。脂質(zhì)的選擇已經(jīng)被證明對蛋白質(zhì)活性是至關(guān)重要的(8),例如在脂質(zhì)促進蛋白質(zhì)低聚反應(yīng)的情況下(25)。使用組裝好的納米盤進行無細(xì)胞表達是圍繞各種脂質(zhì)和脂質(zhì)混合物對蛋白質(zhì)的影響對其進行篩選的快捷簡便方法。


          納米盤在科學(xué)中的應(yīng)用實例

          MSP納米盤最初是由Sligar及其同事一起發(fā)表的(3,4)。MSP納米盤為穩(wěn)定膜蛋白提供良好的環(huán)境,使得通過NMR 和 SPR(9,10)等方法研究配體、激動劑或拮抗劑的結(jié)合成為可能。納米盤被證實可以提高 在冷凍電鏡中跨膜蛋白區(qū)的分辨率(22,26)。膜支架蛋白可采用組氨酸標(biāo)記,以促進蛋白質(zhì)納米盤復(fù)合物的純化、檢測和固相處理。其他納米盤應(yīng)用的實例包括共振拉曼(11)、MALDI(13)、非共價質(zhì)譜法(25)、蛋白激活研究(14)、時間分辨熒光光譜(15)和蛋白質(zhì)結(jié)晶(24)。重組成納米盤的抗原已被用于提高小鼠的免疫原應(yīng)答,顯示出其作為疫苗的潛力 (16)。此外,“大腸桿菌”的整個膜蛋白質(zhì)組被重組為納米盤,從而創(chuàng)建出水溶性膜蛋白庫 (15)。在納米盤中重組的蛋白質(zhì)可以轉(zhuǎn)移到雙層膜微胞中以提高 NMR 分辨率(23)。在納米盤的協(xié)助下,甚至實現(xiàn)了對可溶性蛋白質(zhì)以及與脂質(zhì)相互作用的蛋白質(zhì)的分析 (20)。表 3 列出了納米盤應(yīng)用的實例。


          3:提及MSP蛋白的相關(guān)刊物:


          參考文獻

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