為什么要進(jìn)行進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定
據(jù)統(tǒng)計(jì)約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí),只因使用了交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……,這將浪費(fèi)大量時(shí)間、精力和金錢(qián)。
為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?
進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定是很重要的。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細(xì)胞來(lái)進(jìn)行,這些細(xì)胞可能是受贈(zèng)于其它研究人員,也可能是從細(xì)胞庫(kù)(如美國(guó)?ATCC,American?Type?Culture?Collection)得來(lái)。據(jù)估計(jì),15-20%的實(shí)驗(yàn)室,實(shí)驗(yàn)中所使用的細(xì)胞已經(jīng)不是原來(lái)的細(xì)胞系,或者與其它細(xì)胞系發(fā)生了交叉污染。顯然,細(xì)胞系遭到污染、特征鑒別錯(cuò)誤,將會(huì)極大的威脅著基于這些細(xì)胞而發(fā)表的論文質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系身份?
收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及 STR 信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè) STR 位點(diǎn)和參考細(xì)胞 STR 位點(diǎn)都能重合匹配,即說(shuō)明該細(xì)胞系正確,反之則說(shuō)明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說(shuō)來(lái),匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說(shuō)明該細(xì)胞系的來(lái)源需要被懷疑。
如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問(wèn)題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購(gòu)買(mǎi)一株新的細(xì)胞系。
生物細(xì)胞STR鑒定服務(wù)
STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等機(jī)構(gòu)作為鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。海星生物對(duì)人源細(xì)胞21個(gè)STR位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè),可方便與數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),具有較高的準(zhǔn)確性。
STR基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3~7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成, 這些重復(fù)序列廣泛存在于人類(lèi)基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋。STR 基因座位上的等位基因可通過(guò)擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別。隨后通過(guò)一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。
| 海星生物細(xì)胞系鑒定位點(diǎn)
| 細(xì)胞系鑒定服務(wù)流程
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