一、原理
PCR技術(shù)的本質(zhì)是體外核酸擴增,加熱使雙鏈DNA解開螺旋,在退火溫度條件下引物同模板DNA雜交,在Taq DNA聚合酶,dNTPs,Mg2+和合適pH緩沖液存在條件下延伸引物,重復 “變性→退火→引物延伸”過程至25~40個循環(huán),呈指數(shù)級擴大待測樣本中的核酸拷貝數(shù)。
二、分類
1. 普通的PCR儀
一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀,又叫傳統(tǒng)的PCR儀。
用途:主要是做一些簡單的、對單一退火溫度的目的基因進行擴增。
(1)梯度PCR儀: 一次PCR擴增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),通常為12種溫度梯度的普通PCR儀。
用途:研究未知DNA退火溫度的擴增。
?。?)原位PCR:將具有細胞定位能力的原位雜交技術(shù)運用于從細胞內(nèi)靶DNA的定位分析,在細胞內(nèi)實現(xiàn)基因擴增的普通PCR儀。
用途:用于在細胞的靶DNA所在位置上進行基因擴增。
2. 實時熒光定量PCR儀
PCR擴增時加入的引物利用熒光素進行標記,使引物和熒光探針同時與模板進行特異性結(jié)合,擴增結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號并輸送到計算機分析處理系統(tǒng),實時輸出量化結(jié)果,這樣的PCR儀叫實時熒光定量PCR儀。
?。?)金屬板式實時定量PCR儀
可作為普通PCR儀使用
可帶梯度功能
可容納的樣本量大,無需特殊耗材
溫度均一性欠佳,有邊緣效應(yīng),標準曲線的反應(yīng)條件難以做到與樣品全一致
?。?)離心式實時定量PCR儀
溫度均一性較好
使用的是同一個激發(fā)光源和檢測器,隨時檢測旋轉(zhuǎn)到跟前的樣品,有效減少系統(tǒng)誤差
可容納樣品量少,有的需用特殊毛細管作樣品管,增加了使用成本,也不帶梯度功能
?。?)各孔獨立控溫的定量PCR儀
不同樣品槽分別擁有獨立的智能升降溫模塊,各孔獨立控溫,適合多指標快速檢測。
SmartCyclerⅡ的軟件允許一臺儀器同時操作六個樣品模塊,既滿足高速批量要求,又能靈活運用,還可實現(xiàn)任意梯度反應(yīng)。
SmartCyclerⅡ上樣不如傳統(tǒng)方法方便,而且需要有的扁平反應(yīng)管,使用成本較高。
三、操作規(guī)程
普通PCR擴增儀的操作非常簡便,接通電源,儀器自檢,設(shè)置溫度程序或調(diào)出儲存的程序運行即可。
定量PCR擴增儀的操作和普通PCR儀基本相同。
四、常見故障
?、贌晒馊玖衔廴緲悠房?;
?、赑CR管融化,原因可能是溫度傳感器出問題或是熱蓋出問題;
?、蹅€別孔擴增效率差異很大,可能的原因是半導體模塊出現(xiàn)壞點;
?、軣晒鈴姸葴p弱或不穩(wěn)定,產(chǎn)生的原因有濾光片發(fā)霉或有水汽,或光源損耗(以鹵鎢燈為光源的),需更換光源;或需調(diào)節(jié)檢測元件靈敏度;
⑤儀器工作時出現(xiàn)噪音。
以上故障部分可自行檢查,部分需工程師檢修。
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