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FZ32實(shí)驗(yàn)服務(wù) 高通量測(cè)序
| 參考價(jià): | 面議 |
具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)- FZ32 產(chǎn)品型號(hào)
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訪問次數(shù)：2469更新時(shí)間：2024-06-12 18:01:19
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產(chǎn)品簡(jiǎn)介
| 供貨周期 | 兩周 | 規(guī)格 | 小RNA測(cè)序 |
|---|---|---|---|
| 貨號(hào) | FZ32 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生 |
| 主要用途 | 高通量測(cè)序 |
1、提供實(shí)驗(yàn)材料，其必須保證新鮮，請(qǐng)您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩(wěn)定劑。
2、如果提供DNA，我們要對(duì)其進(jìn)行評(píng)估?；蚪MDNA無明顯降解，濃度≥500 ng/ul，總量
大于30μg。
3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA ，也可以將樣品研
產(chǎn)品介紹
產(chǎn)品選型:
高通量測(cè)序
| 服務(wù)編號(hào) | 服務(wù)項(xiàng)目 | 收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)（元） | 實(shí)驗(yàn)周期 |
| FZ32 | 基因組de novo測(cè)序 | 面議 | 面議 |
| FZ33 | 基因組重測(cè)序 | 面議 | 面議 |
| FZ34 | 宏基因組測(cè)序 | 面議 | 面議 |
| FZ35 | 小RNA測(cè)序 | 面議 | 面議 |
| FZ36 | 真核生物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 | 面議 | 面議 |
| FZ37 | 簡(jiǎn)化基因組測(cè)序 | 面議 | 面議 |
| FZ38 | 細(xì)菌16S測(cè)序 |
產(chǎn)品介紹：
服務(wù)內(nèi)容：
l 基因組de novo測(cè)序
1 基因組DNA提取
2 構(gòu)建不同長(zhǎng)度的基因組文庫
3 上機(jī)測(cè)序
4 數(shù)據(jù)處理：去除接頭序列、污染序列等
5 基因組拼裝統(tǒng)計(jì)：原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、測(cè)序深度分析、覆蓋度統(tǒng)計(jì)、GC含量分析等；
6 基因組注釋：基因預(yù)測(cè)、基因功能注釋、重復(fù)序列分析、nocoding RNA注釋等；
7 基因功能分析 GO分析，KEGG通路分析等；
8 比較基因組學(xué)及進(jìn)化分析：物種系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建、基因家族鑒定、基因共線性分析等。
l 基因組重測(cè)序
1 基因組DNA提取
2 構(gòu)建基因組測(cè)序文庫
3 上機(jī)測(cè)序
4 數(shù)據(jù)處理：去除接頭序列、污染序列等
5 序列比對(duì)
6 SNP、 InDel、CNV、SV檢測(cè)等
l 宏基因組測(cè)序
1 基因組DNA提取
2 構(gòu)建基因組測(cè)序文庫
3 上機(jī)測(cè)序
4 數(shù)據(jù)處理：去除接頭序列、污染序列等
5 宏基因組組裝：原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、測(cè)序深度分析、覆蓋度統(tǒng)計(jì)、GC含量分析等；
6 樣品復(fù)雜度分析：將測(cè)序所得Reads與業(yè)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)統(tǒng)計(jì)；
7 物種分類：基因預(yù)測(cè)、相對(duì)豐度計(jì)算等；
l 真核生物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1 RNA提取
2 構(gòu)建測(cè)序文庫
3 上機(jī)測(cè)序
4 數(shù)據(jù)分析：
無參考基因組的轉(zhuǎn)組分析
Ø 基本數(shù)據(jù)處理（圖像識(shí)別，堿基識(shí)別，測(cè)序街頭序列過濾，樣品污染可能性檢測(cè)）
Ø 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)，數(shù)據(jù)成分和質(zhì)量評(píng)估；
Ø Contig及Scaffold長(zhǎng)度分布；
Ø Unigene的長(zhǎng)度分布，GO分類，功能注釋，代謝通路分析，表達(dá)差異分析。
有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析
Ø 基本數(shù)據(jù)處理（圖像識(shí)別，堿基識(shí)別，測(cè)序街頭序列過濾，樣品污染可能性檢測(cè)）；
Ø 與參考基因組比對(duì)后的注釋信息；
Ø 基因在基因組上的分布；
Ø 測(cè)序深度分布，測(cè)序隨機(jī)性評(píng)估，基因差異表達(dá)分析；
l Small RNA測(cè)序
1 RNA提取
2 連接接頭及純化Samll RNA
3 上機(jī)測(cè)序
4 數(shù)據(jù)處理：去除接頭序列、污染序列等
5 樣品間的公共序列和特異序列的分析
6 Small RNA 與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比對(duì)信息
7 Small RNA 與重復(fù)序列的比對(duì)信息（需提供選定參考基因組對(duì)應(yīng)的重復(fù)序列注釋信息）；
8 Small RNA 與 miRBase 中范圍的已知的 miRNA 的比對(duì)；
9 按照優(yōu)先將 small RNA 進(jìn)行分類注釋；
10 利用Mireap 對(duì)沒有注釋的small RNA 進(jìn)行預(yù)測(cè)，預(yù)測(cè)新的 miRNA ；
11樣品間miRNA 差異分析（2個(gè)或2個(gè)以上樣品）和聚類分析（3個(gè)或3個(gè)以上樣品) ；
12 MiRNA 靶基因預(yù)測(cè)（需要提供基因編碼序列）；
l 簡(jiǎn)化基因組測(cè)序
1 基因組DNA提取 酶切 接接頭
2 上機(jī)測(cè)序
3 數(shù)據(jù)分析
未知參考基因組的信息分析流程
Ø 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評(píng)估；
Ø 標(biāo)記位點(diǎn)分析（標(biāo)記位點(diǎn)鑒定，SNPs位點(diǎn)與InDel位點(diǎn)鑒定）；
Ø 全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）；
Ø 連鎖分析和QTL定位；
Ø 種群進(jìn)化分析。
已知參考基因組的信息分析流程
Ø 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評(píng)估；
Ø 標(biāo)記位點(diǎn)分析（標(biāo)記位點(diǎn)鑒定，SNPs位點(diǎn)與InDel位點(diǎn)鑒定）；
Ø SNP單體型圖譜分析；
Ø 全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）；
Ø 連鎖分析和QTL定位；
Ø 種群進(jìn)化分析。
l 細(xì)菌16S rDNA測(cè)序
1 基因組DNA提取 PCR擴(kuò)增
2 上機(jī)測(cè)序
3 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評(píng)估；
4 OTU列表生成及注釋；
5 豐度分析（Alpha多樣性分析、物種豐度差異分析、聚類分析）；
6 群落結(jié)構(gòu)分析（單樣品物種分布、 多樣品物種分布、含進(jìn)化關(guān)系的
物種分布、Beta多樣性分析）。
服務(wù)說明：
1、提供實(shí)驗(yàn)材料，其必須保證新鮮，請(qǐng)您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩(wěn)定劑。
2、如果提供DNA，我們要對(duì)其進(jìn)行評(píng)估?；蚪MDNA無明顯降解，濃度≥500 ng/ul，總量
大于30μg。
3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA ，也可以將樣品研磨后放在 Trigol中。
4、如果提供RNA，我們需要我們?cè)u(píng)估請(qǐng)?zhí)峁舛?ge;500 ng/ul，總量≥20 ug 的total RNA樣品
樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)DNase處理。
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