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        1. 北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司

          中級(jí)會(huì)員·11年

          聯(lián)系電話

          13146220038

          當(dāng)前位置:> 供求商機(jī)> FZ32-實(shí)驗(yàn)服務(wù) 高通量測(cè)序

          FZ32-實(shí)驗(yàn)服務(wù) 高通量測(cè)序
          FZ32-實(shí)驗(yàn)服務(wù) 高通量測(cè)序

          地:北京鼎國(guó)

          貨物所在地:北京北京市

          更新時(shí)間:2024/9/9 8:39:52

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          中級(jí)會(huì)員·11年
          聯(lián)人:
          譚柳
          話:
          010-62210403
          機(jī):
          13146220038
          真:
          86-010-89756821
          址:
          北京昌平區(qū)北七家鎮(zhèn)東沙工業(yè)園384號(hào)
          個(gè)化:
          www.dingguocs.com
          機(jī)站:
          m.dingguocs.com
          網(wǎng)址:
          www.dingguocs.com

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          供應(yīng)簡(jiǎn)介
          服務(wù)說(shuō)明:
          1、提供實(shí)驗(yàn)材料,其必須保證新鮮,請(qǐng)您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩(wěn)定劑。
          2、如果提供DNA,我們要對(duì)其進(jìn)行評(píng)估?;蚪MDNA無(wú)明顯降解,濃度≥500&#160;ng/ul,總量
          &#160;&#160; 大于30μg。
          3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA&#160;,也可以將樣品研


          詳細(xì)介紹

           產(chǎn)品選型:                                                                                                                             
          高通量測(cè)序

           

          服務(wù)編號(hào)服務(wù)項(xiàng)目收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)(元)實(shí)驗(yàn)周期
          FZ32基因組de novo測(cè)序面議面議
          FZ33基因組重測(cè)序面議面議
          FZ34宏基因組測(cè)序面議面議
          FZ35小RNA測(cè)序面議面議
          FZ36真核生物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序面議面議
          FZ37簡(jiǎn)化基因組測(cè)序面議面議
          FZ38細(xì)菌16S測(cè)序

          產(chǎn)品介紹:
          服務(wù)內(nèi)容:
          基因組de novo測(cè)序
          1  基因組DNA提取
          2  構(gòu)建不同長(zhǎng)度的基因組文庫(kù)
          3  上機(jī)測(cè)序
          4  數(shù)據(jù)處理:去除接頭序列、污染序列等
          5  基因組拼裝統(tǒng)計(jì):原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、測(cè)序深度分析、覆蓋度統(tǒng)計(jì)、GC含量分析等;
          6  基因組注釋:基因預(yù)測(cè)、基因功能注釋、重復(fù)序列分析、nocoding RNA注釋等;
          7  基因功能分析 GO分析,KEGG通路分析等;
          8  比較基因組學(xué)及進(jìn)化分析:物種系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建、基因家族鑒定、基因共線性分析等。
           
          基因組重測(cè)序
          1  基因組DNA提取
          2  構(gòu)建基因組測(cè)序文庫(kù)
          3  上機(jī)測(cè)序
          4  數(shù)據(jù)處理:去除接頭序列、污染序列等
          5  序列比對(duì)
          6  SNP、 InDel、CNV、SV檢測(cè)等
           
          宏基因組測(cè)序
          1  基因組DNA提取
          2  構(gòu)建基因組測(cè)序文庫(kù)
          3  上機(jī)測(cè)序
          4  數(shù)據(jù)處理:去除接頭序列、污染序列等
          5  宏基因組組裝:原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、測(cè)序深度分析、覆蓋度統(tǒng)計(jì)、GC含量分析等;
          6  樣品復(fù)雜度分析:將測(cè)序所得Reads與業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)統(tǒng)計(jì);
          7  物種分類:基因預(yù)測(cè)、相對(duì)豐度計(jì)算等;
           
          真核生物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
          1  RNA提取
          2  構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)
          3  上機(jī)測(cè)序
          4   數(shù)據(jù)分析:
               無(wú)參考基因組的轉(zhuǎn)組分析
          Ø 基本數(shù)據(jù)處理(圖像識(shí)別,堿基識(shí)別,測(cè)序街頭序列過(guò)濾,樣品污染可能性檢測(cè))
          Ø 測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì),數(shù)據(jù)成分和質(zhì)量評(píng)估;
          Ø Contig及Scaffold長(zhǎng)度分布;
          Ø Unigene的長(zhǎng)度分布,GO分類,功能注釋,代謝通路分析,表達(dá)差異分析。
          有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析
          Ø 基本數(shù)據(jù)處理(圖像識(shí)別,堿基識(shí)別,測(cè)序街頭序列過(guò)濾,樣品污染可能性檢測(cè));
          Ø 與參考基因組比對(duì)后的注釋信息;
          Ø 基因在基因組上的分布;
          Ø 測(cè)序深度分布,測(cè)序隨機(jī)性評(píng)估,基因差異表達(dá)分析;
           
          Small RNA測(cè)序
          1  RNA提取
          2  連接接頭及純化Samll RNA
          3  上機(jī)測(cè)序
          4  數(shù)據(jù)處理:去除接頭序列、污染序列等
          5  樣品間的公共序列和特異序列的分析
          6  Small RNA 與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比對(duì)信息
          7  Small RNA 與重復(fù)序列的比對(duì)信息(需提供選定參考基因組對(duì)應(yīng)的重復(fù)序列注釋信息);
          8  Small RNA 與 miRBase 中范圍的已知的 miRNA 的比對(duì);
          9  按照優(yōu)先將 small RNA 進(jìn)行分類注釋; 
          10 利用Mireap 對(duì)沒(méi)有注釋的small RNA 進(jìn)行預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)新的 miRNA ;
          11樣品間miRNA 差異分析(2個(gè)或2個(gè)以上樣品)和聚類分析(3個(gè)或3個(gè)以上樣品) ;
          12  MiRNA 靶基因預(yù)測(cè)(需要提供基因編碼序列);
           
          簡(jiǎn)化基因組測(cè)序
          1  基因組DNA提取 酶切 接接頭
          2  上機(jī)測(cè)序
          3  數(shù)據(jù)分析
           
          未知參考基因組的信息分析流程
          Ø 原始數(shù)據(jù)整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估;
          Ø 標(biāo)記位點(diǎn)分析(標(biāo)記位點(diǎn)鑒定,SNPs位點(diǎn)與InDel位點(diǎn)鑒定);
          Ø 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS);
          Ø 連鎖分析和QTL定位;
          Ø 種群進(jìn)化分析。
          已知參考基因組的信息分析流程      
          Ø 原始數(shù)據(jù)整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估;
          Ø 標(biāo)記位點(diǎn)分析(標(biāo)記位點(diǎn)鑒定,SNPs位點(diǎn)與InDel位點(diǎn)鑒定);
          Ø SNP單體型圖譜分析;
          Ø 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS);
          Ø 連鎖分析和QTL定位;
          Ø 種群進(jìn)化分析。
           
          細(xì)菌16S rDNA測(cè)序
           
          1  基因組DNA提取 PCR擴(kuò)增
          2  上機(jī)測(cè)序
          3  原始數(shù)據(jù)整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估;
          4  OTU列表生成及注釋;
          5  豐度分析(Alpha多樣性分析、物種豐度差異分析、聚類分析);
          6  群落結(jié)構(gòu)分析(單樣品物種分布、 多樣品物種分布、含進(jìn)化關(guān)系的
          物種分布、Beta多樣性分析)。
          服務(wù)說(shuō)明:
          1、提供實(shí)驗(yàn)材料,其必須保證新鮮,請(qǐng)您采樣后立即放入液氮中速凍或加入樣品穩(wěn)定劑。
          2、如果提供DNA,我們要對(duì)其進(jìn)行評(píng)估?;蚪MDNA無(wú)明顯降解,濃度≥500 ng/ul,總量
             大于30μg。
          3、如果樣品可以用Trigol法提總RNA ,也可以將樣品研磨后放在 Trigol中。
          4、如果提供RNA,我們需要我們?cè)u(píng)估請(qǐng)?zhí)峁舛?ge;500 ng/ul,總量≥20 ug 的total RNA樣品
             樣品請(qǐng)去蛋白并進(jìn)DNase處理。
           

           

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