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制備PCR反應(yīng)模板
閱讀：1024 發(fā)布時(shí)間：2012-3-8| 提 供 商 | 上海恒遠(yuǎn)生物科技有限公司 | 資料大小 | 25.7KB |
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傳統(tǒng)的核酸模板提取方法是采用去垢劑如SDS等來破壞細(xì)胞組份，溶解細(xì)胞膜， 使蛋白質(zhì)變性，再用蛋白酶K來消化去除蛋白質(zhì)，尤其是與DNA結(jié)合的蛋白質(zhì)，再用 酚:氯仿抽提，然后用乙醇或異丙醇沉淀核酸，供PCR實(shí)驗(yàn)用.但近幾年來也發(fā)展了些 簡(jiǎn)便實(shí)用較為有效的標(biāo)本消化處理方法.亦可滿足PCR實(shí)驗(yàn)的要求.采用哪種方法消化 處理標(biāo)本，視PCR實(shí)驗(yàn)的目的（是科研還是檢測(cè)）及環(huán)境條件而定.
模板核酸的提取制備方法
?。ㄒ唬┑鞍酌窴消化裂解法：適用于所有標(biāo)本的消化處理，尤以DNA樣品為佳.如組 織細(xì)胞（包括石蠟包埋組織）絨毛、毛發(fā)、精斑、血液（血清、血漿、全血）局部分泌 物、尿，糞便等.
1.試劑配制
①蛋白酶K消化液:10mmol/L Tris.cl（PH8.0）
10mmol/LEDTA
150mmol/LNaCL
0.5%SDS
100～200ug/ml蛋白酶K.
②蛋白酶K用水配成20mg/ml，臨用時(shí)加入消化液中.
2.提取方法:
有些標(biāo)本、在用蛋白酶K消化前，還需預(yù)處理一下，如糞便、分泌物、痰液、組 織塊、石蠟包埋組織等，其方法有離心去掉雜質(zhì)，脫蠟等.
臨床標(biāo)本或經(jīng)預(yù)處理的標(biāo)本加蛋白酶K裂解液50～100ul.混勻，55℃1～3小時(shí)， 或37℃過夜.加等體積的飽和酚抽提1～2次，再加等體積的氯仿:異戊醇（49:1）抽提一 次，上清加入1/10體積的pH值5.23mmol/L醋酸鈉緩沖液，加入2.5倍體積的冰冷無水 乙醇（或加等體積的異丙醇）-20℃放置至少3h.取出后14000轉(zhuǎn)/min離心15min.小心吸 棄或倒出上清，沉淀加入75%冰冷乙醇15000r/min5min離心洗滌1～2次，特別小心的 吸棄或倒掉上清，真空或37℃溫箱或室溫干燥，加TE緩沖液20ul.溶解后，取3～8ul 用于PCR擴(kuò)增，或放-20℃保存.
蛋白酶K消化法除上述經(jīng)典處理法外，亦可在蛋白K消化處理標(biāo)本，經(jīng)離心處理 后，吸取上清經(jīng)95～97℃或煮沸10min滅活蛋白酶K后，直接作核酸模板用于PCR擴(kuò)增. 如雜質(zhì)較多，還可經(jīng)酚:氯仿抽提后，即可用于PCR反應(yīng).此法蛋白質(zhì)及其它雜質(zhì)消除 *，Taq酶活性不受影響，具有良好的重復(fù)性與穩(wěn)定性.但操作繁復(fù)，技術(shù)要求高.
?。ǘ┲苯恿呀夥?標(biāo)本（組織細(xì)胞，分泌物）加PBS或生理鹽水離心洗滌后，加消化 裂解液20～50ul（0.5%NP-40和0.5%吐溫-20），95～98℃，15～30min以裂解病原體， 裂解細(xì)胞.然后12000r/min離心5～10min，取上清20～30ul用于PCR擴(kuò)增.血清標(biāo)本可 直加等體積的消化液，加熱處理離心后PCR擴(kuò)增.亦有用5%的NP-40和1.5%2-ME做裂解 液，95℃30min消化處理，離心取上清，PCR擴(kuò)增檢測(cè)HBV DNA.
（三）堿變性法:取血清20ul，加入1mol/L NaOH 20ul，37℃30min，離心，加 1mol/L HCl 20ul，離心后，取上清5ul，用于PCR擴(kuò)增.*亦有用10ul血清加NaOH至 0.2mol/L，37℃1h，再加HCL中和離心后取上清10ul做PCR，其特異性和敏感性較前法 更好.
?。ㄋ模┲蠓蟹?經(jīng)離心洗滌過的組織細(xì)胞，分泌物及血液標(biāo)本，加適量無菌蒸餾水或PBS，混勻 后，100℃煮沸10～15min，14000r/min 10min，取上清做PCR.
?。ㄎ澹┑饣c法:取組織細(xì)胞及抗凝血液10～100ul，加等體積的6MNaI，反復(fù)輕混 20s，加等體積氯仿:異戊醇（49:1）振勻后，離心取上清加0.6體積的異丙醇，混勻后 置室溫3min.14000r/min 10min，沉淀加10～100ul，TE溶解，取5～10ul做PCR，亦有 用100ul血清加裂解液300ul（6M NaI，0.5%十二烷基肌酸鈉，10ug糖原，26mmol/L pH8.0 Tris-HCL，13mmol/LEDTA）混勻后，60℃15min，加等體積異丙醇，離心沉定 后，加TE液用于PCR擴(kuò)增，其產(chǎn)量和質(zhì)量較高.
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此法主要用于RNA的提取.標(biāo)本為組織細(xì)胞及血清等.
1.異硫氰酸胍消化液
異硫氰酸胍4mol/L
檸檬酸鈉（PH7.0）25mmol/L
十二烷基肌酸鈉0.5%
β-巰基乙醇0.1mol/L
2.消化方法:用50～100ul細(xì)胞懸液及血清，加等體積的異硫氰酸胍消化液振混勻 后，或65℃1小時(shí)，或室溫放置數(shù)分鐘，然后加1/10體積的3mmol/L pH5.2的醋酸鈉緩 沖液，再加等體積的酚:氯仿，用力振搖約10s，10000r/min，離心5min，取上清加等 體積異丙醇-20℃放置3h后，14000r/min離心15min，沉定用75%冰冷乙醇離心洗滌1～ 2次，真空干燥，沉淀用TE緩沖液溶解即可用于逆轉(zhuǎn)錄PCR擴(kuò)增，或放-20℃保存.
其它消化處理標(biāo)本提模板核酸的方法有①異硫氰酸胍一二氧化硅法②異硫氰酸胍 -玻璃粉法.③Chelex-100法.④全血直接擴(kuò)增法⑤尿素消化裂解法.各有千秋，可根據(jù) 情況選用.