詳細(xì)介紹
siRNA干擾檢測服務(wù)
原理:RNA干擾 (RNA interference, RNAi)技術(shù),是將與內(nèi)源mRNA 編碼區(qū)同源的小片段(19 -23bp)外源雙鏈 RNA(siRNA)導(dǎo)入細(xì)胞中,引發(fā)細(xì)胞中相應(yīng)mRNA 高效特異性降解,從而導(dǎo)致特定基因表達(dá)沉默(knock down)的一種實驗技術(shù),其中通過構(gòu)建表達(dá)載體表達(dá)siRNA是多種siRNA制備方法中*有可能進(jìn)行長期基因沉默研究的方法,siRNA 載體可以在細(xì)胞內(nèi)直接轉(zhuǎn)錄出shrna ,其干擾效果等同于siRNA ,而且能夠解決 siRNA干擾時間短的缺點。您只需提供需干擾基因的詳細(xì)信息,包括基因的 mRNA 序列,Genbank Accession No. 和所屬物種,本公司負(fù)責(zé)設(shè)計3條針對目的mRNA的siRNA 靶序列,在短時間內(nèi)構(gòu)建三個可用于目的mRNA干擾實驗的siRNA 載體并為您進(jìn)行后續(xù)的干擾實驗研究。
實驗流程
◇ 選擇siRNA表達(dá)載體 通過人工合成基因的方法將該序列克隆至Clontech公司的RNAi-Ready pSIREN系列表達(dá)載體中,該系列表達(dá)載體帶有Pol III(U6)啟動子,具有轉(zhuǎn)染效率高、操作簡單、rna沉默效果易于檢測等特點,客戶可根據(jù)需要進(jìn)行選擇。
◇ 設(shè)計siRNA靶序列
◇ 根據(jù)客戶提交的目的mRNA序列,設(shè)計3條RNA干擾靶序列,靶序列一般為19-21nt 長。
◇ 對于每條選定的siRNA 靶序列,設(shè)計 siRNA 正義鏈和反義鏈,以 loop(9nt or 10nt) 相連,形成穩(wěn)定的發(fā)卡RNA,稱為 shRNA(short hairpin RNA)。
◇ 合成模板 合成每條編碼 shRNA的DNA 模板,并連接到 siRNA 載體相應(yīng)的多克隆位點之間。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α大腸桿菌。
◇ 抽提陽性克隆質(zhì)粒 公司試劑盒抽提陽性克隆載體并定量。
◇ 轉(zhuǎn)染細(xì)胞 質(zhì)粒直接轉(zhuǎn)染或通過病毒包裝后轉(zhuǎn)染細(xì)胞,并對轉(zhuǎn)染細(xì)胞進(jìn)行陽性鑒定和轉(zhuǎn)代細(xì)胞株的培養(yǎng)。
◇ 干擾效果檢測
◇ 基因水平上檢測 提取RNA、反轉(zhuǎn)錄、Realtime PCR檢測干擾效果(客戶自備細(xì)胞系)。
◇ 蛋白水平上檢測 Western Blot檢測蛋白水平干擾效果(客戶自備一抗)。
服務(wù)周期及價格
服務(wù)內(nèi)容 | 價格(¥) | 周期 |
siRNA 載體構(gòu)建1~3個 | 1800元/個 | 14個工作日 |
siRNA 載體構(gòu)建3~10個 | 1500元/個 | 20個工作日 |
siRNA 載體構(gòu)建10個以上 | 詢價 | 協(xié)商 |
細(xì)胞培養(yǎng)、轉(zhuǎn)染 | 5000元/基因 | 1~2周 |
基因水平上檢測干擾效果 | 詢價(視檢測數(shù)量商定) | 5~6周 |
蛋白水平上檢測干擾效果 | 詢價(視檢測數(shù)量商定) | 5~6周 |
服務(wù)說明
◇ siRNA服務(wù)需客戶與我們共同討論實驗方案,并提供靶基因名稱、序列或GeneBank ID和希望插入載體的名稱等,免費為您設(shè)計siRNA序列。
◇ 由于構(gòu)建的siRNA表達(dá)載體中插入的片段可以形成hairpin結(jié)構(gòu),因此可能會影響測序。如果我們對質(zhì)粒測序結(jié)果不理想時,將對由質(zhì)粒擴增得到的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序。
◇ 開始實驗時公司和客戶簽訂詳細(xì)的實驗技術(shù)服務(wù)合同、保密合同,客戶需預(yù)付合同金額的50%作為預(yù)付款。
提供結(jié)果
實驗報告包括:siRNA序列、構(gòu)建載體的測序報告、熒光定量PCR檢測報告、Western Blot圖片及全部實驗數(shù)據(jù)和詳細(xì)的實驗步驟。