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          重慶市華雅干細胞技術(shù)有限公司 重慶市華雅干細胞技術(shù)有限公司
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          Clontech現(xiàn)貨 單細胞擴增試劑盒

          Clontech現(xiàn)貨 單細胞擴增試劑盒
          參考價 面議
          具體成交價以合同協(xié)議為準
          • 型號 R300718
          • 品牌 TaKaRa
          • 廠商性質(zhì) 代理商
          • 所在地 重慶市

          更新時間:2020-10-10 09:55:41瀏覽次數(shù):1570

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          產(chǎn)品簡介
          供貨周期 現(xiàn)貨 應(yīng)用領(lǐng)域 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè)
          Clontech現(xiàn)貨 單細胞擴增試劑盒
          TAKARA授權(quán)代理 現(xiàn)貨 單細胞起始量全基因組擴增試劑盒,歡迎咨詢?nèi)A雅干細胞!Clontech現(xiàn)貨

          Clontech現(xiàn)貨 單細胞擴增試劑盒

          產(chǎn)品名稱: PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3    產(chǎn)品貨號:R300718 

           
           
          PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
          · 單細胞(或<15 pg DNA)起始,可獲得可重復(fù)的結(jié)果
          · 等位基因再現(xiàn)性
          · 易于使用和自動化
          · 應(yīng)用廣泛,可以用于微陣列,PCR等
           
          PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以從單細胞擴增DNA,獲得高度可重復(fù)的文庫。細胞裂解和預(yù)擴增后,進行低背景的PCR擴增,并在3小時內(nèi)獲得微克級產(chǎn)物。
          除了延續(xù)之前PicoPLEX WGA Kit可進行高度可重復(fù)的拷貝數(shù)變異(CNV)分析外,該試劑盒通過使用高保真酶,盡可能減少擴增誤差,并能檢測單核苷酸變異(SNV)。
           

           

           
           
           
          圖1. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV檢測
           
          以來自不同細胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的單細胞起始,使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3擴增基因組。之后取1ng的擴增產(chǎn)物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在Illumina MiSeq(PE 75)進行測序。對Fastq文件去除接頭序列信息后,與human genome assembly GRCh37進行比對。只分析常染色體。對于這兩個panels,校準歸一化至100萬reads,使用bedtools 2.25.0計算每1 Mb的 bin的reads數(shù)。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)繪制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3還顯示了可以高品質(zhì)的進行染色體異倍性分析。
           
          圖2. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因組覆蓋范圍的重現(xiàn)性高
           
          以GM12878的單細胞樣本起始(一式兩份),分別使用PicoPLEX WGA v3,A公司試劑盒和B公司試劑盒擴增基因組。之后取1ng的擴增產(chǎn)物,使用Illumina Nextera XT Kit制備文庫,并在MiSeq(PE 75)進行測序。然后與human genome assembly GRCh37進行比對,歸一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后,使用bedtools 2.25.0計算每個1 Mb的bin的reads數(shù)。對這兩個單細胞文庫的每個窗口的total read進行繪制,計算Pearson和Spearman相關(guān)性并在每個圖中標(biāo)明。
          Panel A. 包含異常值的樣本。*由于不同技術(shù)存在不同的偏差,沒有排除相關(guān)點,所以圖表的比例不同。
          Panel B. 排除異常值的樣本。與A公司和B公司試劑盒相比,PicoPLEX WGA v3具有更高的重現(xiàn)性和覆蓋度。

          Clontech現(xiàn)貨 單細胞擴增試劑盒

           

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