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        1. 上海仁捷生物科技有限公司

          口蹄疫病毒O型檢測試劑盒(實時熒光PCR法)說明書

          時間:2023/5/16閱讀:853

          預期用途】

          口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,FMDV) 屬于RNA病毒科,口蹄疫病毒屬,主要侵害蹄獸,O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3Asia-I七個血清型??谔阋甙l(fā)病以發(fā)熱、口腔黏膜及蹄部和乳房皮膚發(fā)生水泡和潰爛為特征,是國際獸疫局規(guī)定的A類傳染病,易通過空氣傳播,傳染性強,流行迅速,偶爾感染人。由于口蹄疫傳播迅速、難于防治、補救措施少,被稱為畜牧業(yè)的“頭號殺手"。

          本試劑盒利用實時熒光PCR原理,定性檢測口蹄疫O型病毒(FMDV-O),對FMDV-O引起的偶蹄獸類病的診斷和監(jiān)控具有重要指導意義。

          【檢驗原理】

          本試劑盒針對口蹄疫病毒O型的高度保守區(qū)域設計特異性引物和探針,在反應體系中含口蹄疫病毒O型基因組模板的情況下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應通道信號進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結(jié)果的定性分析。

          【主要組成成份】

          序號

          組成

          25T/盒

          50T/盒

          1

          FMDV-O RT-PCR反應液

          375 μL×1管

          750 μL×1管

          2

          FMDV-O逆轉(zhuǎn)錄酶

           50 μL×1管

          100 μL×1管

          3

          FMDV-O Taq酶

           75 μL×1管

          150 μL×1管

          4

          FMDV-O陽性對照

           40 μL×1管

           40 μL×1管

          5

          FMDV-O陰性對照

           40 μL×1管

           40 μL×1管

          6

          說明書

          1份

          1份

          注:陰性對照為偶蹄獸類基因組DNA,陽性對照為失去活性的FMDV-O病毒cDNA

          【儲存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。

          【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列 、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實時熒光定量PCR儀。

          【樣本要求】

          新鮮采集的咽拭子、皰疹液和糞便標本,并使用滅菌生理鹽水懸浮。

          2.應避免標本間交叉污染。

          3.標本收集后可立即檢測;若不能立即檢測,可置于28℃冷藏過夜保存;如需長期保存,標本應凍存于-80℃以下,避免反復凍融。

          【檢驗方法】

          1. 試劑準備(試劑準備區(qū))

          1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。

          2)核算當次實驗所需要的反應數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。

          n =陰性對照數(shù)(1T)+陽性對照數(shù)(1T)+誤差預留量(1T)+樣本數(shù)

          單反液配制表(每份)

          RT-PCR反應液

          15.0 μL

          逆轉(zhuǎn)錄酶

           2.0 μL

          Taq

           3.0 μL

           (3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。

          2.樣本準備(樣本處理區(qū))

          QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。

          3.加樣

          在上述制備好的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA各5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。

          4. PCR(PCR擴增區(qū))

          1)取樣本處理區(qū)準備好的PCR反應管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。

          2)按下表設置儀器核酸擴增相關(guān)參數(shù)進行PCR擴增。

           


          反應體積

          25 μL

          通道選擇

          FAM通道采集 FMDV-O病毒熒光信號

          PCR

          反應

          條件

          步驟

          條件

          循環(huán)數(shù)

          反轉(zhuǎn)錄

              42℃:10分鐘(min)

          1

          預變性

          95℃:3分鐘(min)

          1

          預擴增

          95℃:5秒(s)

          5

          55℃:40秒(s)

          PCR擴增

          95℃:5秒(s)

          40

          55℃:40秒(s)

          (此階段結(jié)束時采集熒光信號)

           

          注:ABI系列熒光PCR儀在設置時不選ROX校正,設置淬滅基團選擇None。

          【參考值(參考范圍)】

          1.試劑盒有效性判定:

           1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct值≤35。

           2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。

          2.標本結(jié)果判定:

          1)陽性:標本檢測結(jié)果Ct值≤35或有明顯指數(shù)增長期。

          2)可疑:標本檢測結(jié)果Ct值在3538范圍內(nèi)。此時應對標本進行重復檢測,如重復實驗結(jié)果Ct值仍在3538范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。

          3)陰性:標本檢測結(jié)果Ct值>38或無Ct值。

          【檢驗結(jié)果的解釋】

          通道及檢測結(jié)果

          標本檢測結(jié)果解釋

          FAM

          陽性(+)

          標本中檢出FMDV-O病毒RNA

          陰性(-)

          標本中未檢出FMDV-O病毒RNA

          【檢驗方法的局限性】

          1. 當檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的檢出可能會發(fā)生假陰性的結(jié)果。

          2. 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中操作方式不當容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結(jié)果。

          3. 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽性結(jié)果。

          【產(chǎn)品性能指標】 產(chǎn)品的檢出限為102 Copies/mL,產(chǎn)品CV值≤5%。

          【注意事項】

          1. 整個檢測過程應嚴格按照本說明書要求分別在試劑準備區(qū)、樣本處理區(qū)和PCR擴增區(qū)進行操作,各區(qū)實驗服、儀器、耗材應獨立使用,不能混用;實驗用吸頭采用帶濾芯吸頭;樣本處理區(qū)應配有生物安全柜,樣本處理在生物安全柜中進行操作;三個區(qū)應該配有紫外線殺菌裝置。

          2. 為避免RNA降解,樣本處理過程應在0-4℃條件下操作,且完成實驗后立即上機檢測;樣本處理過程中使用的器具耗材應經(jīng)過無核酶處理。

          3. 每次實驗應該設置陰、陽性對照。

          4. 試劑盒所有試劑在使用前應該在常溫下充分融化混勻,并應瞬時離心。

          5. 試劑盒內(nèi)所配陰性和陽性對照在第一次使用前應全部轉(zhuǎn)移至標本準備區(qū),并單獨存放。

          6. 為防止熒光干擾,應避免裸手直接接觸PCR反應管,并應避免在PCR反應管上進行任何標記。

          7. 儀器擴增相關(guān)參數(shù)應按照本說明書相關(guān)要求進行設置;不同批號試劑不能混用。

          8. ABI系列熒光定量PCR儀參數(shù)設置中不選ROX校正,淬滅基因選擇None。

          9. 實驗過程中產(chǎn)品的廢棄物應該進行無害化處理后方可丟棄。


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