一、畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)簡(jiǎn)介
畢赤酵母(Pichia pastoris)表達(dá)系統(tǒng)作為一種高效的真核表達(dá)系統(tǒng),畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)具有廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域和顯著的優(yōu)勢(shì)。與其他表達(dá)系統(tǒng)相比,畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)明顯。它擁有目前強(qiáng)、調(diào)控機(jī)理嚴(yán)格的啟動(dòng)子之一 —— 醇氧化酶基因 AOX1 啟動(dòng)子,這使得外源基因的表達(dá)調(diào)控更加精準(zhǔn)高效。其表達(dá)水平高,既能實(shí)現(xiàn)胞內(nèi)表達(dá),又可進(jìn)行分泌型表達(dá),極大地滿(mǎn)足了不同研究和生產(chǎn)的需求。發(fā)酵工藝成熟且易于放大,已經(jīng)具備大規(guī)模工業(yè)化高密度生產(chǎn)的能力,為產(chǎn)業(yè)化發(fā)展提供了便利條件。培養(yǎng)成本低,產(chǎn)物易分離,所用發(fā)酵培養(yǎng)基廉價(jià),且不含蛋白,有利于下游產(chǎn)品的分離純化,降低了生產(chǎn)成本。外源蛋白基因遺傳穩(wěn)定,整合到畢赤酵母染色體上后,能隨染色體復(fù)制而穩(wěn)定存在,不易丟失。此外,作為真核表達(dá)系統(tǒng),畢赤酵母還具有真核生物的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),能夠?qū)Ρ磉_(dá)的蛋白進(jìn)行糖基化、脂肪?;?、蛋白磷酸化等翻譯后修飾加工,使表達(dá)出的蛋白在結(jié)構(gòu)和功能上更接近天然蛋白,具有更高的生物活性。
二、畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)構(gòu)成
1、宿主菌
目前用于外源蛋白表達(dá)的畢赤酵母宿主菌有: Mut+甲醇利用型GS115、X-33、SMD1165、SMD1163及 SMD1168等大多宿主菌;MutS甲醇利用緩慢型KM71; Mut-甲醇不利用型MC100-3。詳見(jiàn)下表,詳細(xì)地列舉了畢赤酵母不同的表達(dá)宿主菌及表達(dá)特點(diǎn)
表 1常見(jiàn)的畢赤酵母表達(dá)宿主菌及特點(diǎn)
菌株 | 特點(diǎn) |
GS115 | 具有高表達(dá)水平、高細(xì)胞密度、高可溶性蛋白產(chǎn)量,目前應(yīng)用廣的宿主菌 |
KM71 | 甲醇利用緩慢型,適用于表達(dá)難以溶解的蛋白質(zhì) |
X33 | 可使表達(dá)量和活性提高,適用于表達(dá)重組蛋白質(zhì) |
SMD1168H | 更好的表達(dá)效率和更高的細(xì)胞密度,適用于表達(dá)大分子蛋白質(zhì) |
SMD116(his4 pep4) | 屬于蛋白酶缺失型菌株,能夠減少蛋白降解,解決由于蛋白降解而引起的表達(dá)產(chǎn)物分布不均的問(wèn)題,不過(guò)該菌株生長(zhǎng)相對(duì)緩慢,可能導(dǎo)致表達(dá)的外源蛋白質(zhì)產(chǎn)量較低。 |
Y-11430 | 高效的表達(dá)能力并且具有可調(diào)控的表達(dá) |
2、載體
畢赤酵母表達(dá)載體以整合型載體為主,常見(jiàn)載體可分為胞內(nèi)表達(dá)載體和分泌表達(dá)載體。
表 2 常見(jiàn)的畢赤酵母表達(dá)宿載體及特點(diǎn)
胞內(nèi)表達(dá)載體 | 特點(diǎn) |
基于 AOX1 啟動(dòng)子的胞內(nèi)表達(dá)載體,可以進(jìn)行高水平的胞內(nèi)表達(dá) | |
pPIC3K | 基于 AOX1 啟動(dòng)子的胞內(nèi)表達(dá)載體,可以在畢赤酵母中表達(dá)目的蛋白, 并帶有 kanamycin 抗性標(biāo)記 |
pGAPZ | 基于 GAPDH 啟動(dòng)子的胞內(nèi)表達(dá)載體,適用于表達(dá)中等至高水平的目 的蛋白質(zhì),并可進(jìn)行分泌或胞內(nèi)表達(dá) |
pGAPZα | 與 pGAPZ 類(lèi)似,但帶有 α 因子信號(hào)序列,可提高表達(dá)蛋白質(zhì)的穩(wěn)定 性和產(chǎn)量 |
胞外表達(dá)載體 | 特點(diǎn) |
pPICZαA/B/C | 基于 AOX1 啟動(dòng)子的胞外表達(dá)載體,可以在畢赤酵母中表達(dá)目的蛋白, 并具有 α 因子信號(hào)序列,可進(jìn)行高效的分泌表達(dá) |
pPIC9K | 基于 AOX1 啟動(dòng)子的胞外表達(dá)載體,可用于高水平的胞外表達(dá),并帶 有 G418 抗性標(biāo)記 |
pPIC3.5K-BGH | 基于 AOX1 啟動(dòng)子的胞外表達(dá)載體,帶有 β 半乳糖苷酶信號(hào)序列,可 用于檢測(cè)融合蛋白的表達(dá)和分泌 |
pYAM75P | 含有多個(gè)限制酶切點(diǎn),方便進(jìn)行重組操作 |
三、畢赤酵母發(fā)酵工藝
1、畢赤酵母發(fā)酵階段
畢赤酵母的發(fā)酵一般分兩個(gè)階段:1、細(xì)胞增長(zhǎng)階段:首先在碳源為甘油或葡萄糖的培養(yǎng)基中進(jìn)行的生長(zhǎng)階段,積累足夠的細(xì)胞密度和生物量,在菌體濃度達(dá)到一定階段時(shí),當(dāng)甘油或葡萄糖耗盡時(shí),會(huì)導(dǎo)致溶解氧值突然上升至100%左右,然后開(kāi)始流加甘油或葡萄糖溶液,并保持通風(fēng)量和攪拌速度,以維持溶解氧水平在30%左右,進(jìn)一步增長(zhǎng)生物量(菌濃)。2、誘導(dǎo)階段:當(dāng)生物量達(dá)到要求后,停止補(bǔ)碳源,碳源耗盡,過(guò)渡期結(jié)束后,將碳源切換至甲醇進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)目標(biāo)蛋白的發(fā)酵階段。一般間歇加入0.3%甲醇兩次誘導(dǎo),然后開(kāi)始流甲甲醇誘導(dǎo)表達(dá)蛋白,這種方式可以提高外源蛋白的表達(dá)水平,并且使得畢赤酵母在較短時(shí)間內(nèi)積累高濃度的目標(biāo)蛋白。
誘導(dǎo)表達(dá)階段是畢赤酵母發(fā)酵生產(chǎn)過(guò)程中的關(guān)鍵環(huán)節(jié),在此階段,甲醇被用作特異性誘導(dǎo)劑,替代先前的碳源。畢赤酵母中的醇氧化酶基因(如 AOX1)在甲醇存在下被激活,從而驅(qū)動(dòng)外源基因的高效表達(dá)。該階段的條件控制對(duì)于外源蛋白的產(chǎn)量和質(zhì)量具有重要影響,需要嚴(yán)格控制甲醇的添加量、添加速率以及發(fā)酵環(huán)境的溫度、pH 值和溶氧量等參數(shù),以確保外源基因能夠持續(xù)、高效地表達(dá),同時(shí)避免甲醇對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生毒性以及其他不利影響。
2、發(fā)酵培養(yǎng)基的種類(lèi)和配方
畢赤酵母發(fā)酵培養(yǎng)基的種類(lèi)多樣,不同的培養(yǎng)基配方適用于不同的發(fā)酵階段和目的。
BSM(基礎(chǔ)鹽)培養(yǎng)基是畢赤酵母發(fā)酵常用的基礎(chǔ)培養(yǎng)基之一,其典型配方為:85%磷酸 26.7ml/l,二水硫酸鈣 0.93g/l,硫酸鉀 18.2g/l,七水硫酸鎂 14.9g/l,氫氧化鉀 4.13g/l,甘油 40.0g/l,PTM1 4.35ml/l。這種培養(yǎng)基能夠?yàn)楫叧嘟湍傅纳L(zhǎng)提供基本的營(yíng)養(yǎng)成分,包括氮源、磷源、鉀源、鎂源等無(wú)機(jī)鹽以及甘油作為碳源,PTM1 則補(bǔ)充了酵母生長(zhǎng)所需的微量元素和維生素等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),有助于維持酵母細(xì)胞的正常生長(zhǎng)和代謝。
F22 培養(yǎng)基也是一種常見(jiàn)的畢赤酵母發(fā)酵培養(yǎng)基,其配方在不同的研究和生產(chǎn)應(yīng)用中可能會(huì)有所調(diào)整,但一般包含適量的碳源(如葡萄糖或甘油)、氮源(如酵母提取物、蛋白胨等)、無(wú)機(jī)鹽(如硫酸鎂、氯化鈣、磷酸二氫鉀等)以及其他添加劑(如生物素、微量元素溶液等)。與 BSM 培養(yǎng)基相比,F(xiàn)22 培養(yǎng)基在營(yíng)養(yǎng)成分的組成和比例上可能有所優(yōu)化,以滿(mǎn)足特定的發(fā)酵需求,例如在某些情況下可能更有利于提高外源蛋白的表達(dá)量或改善蛋白的質(zhì)量。
除了上述兩種常見(jiàn)的培養(yǎng)基外,還有許多其他的畢赤酵母發(fā)酵培養(yǎng)基,這些培養(yǎng)基的配方往往是根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)?zāi)康?、菌株特性以及發(fā)酵工藝的要求進(jìn)行優(yōu)化和調(diào)整的。例如,在一些研究中,為了提高畢赤酵母對(duì)特定底物的利用效率或增強(qiáng)其對(duì)環(huán)境壓力的耐受性,會(huì)在培養(yǎng)基中添加一些特殊的成分,如氨基酸、有機(jī)酸、多糖等;或者通過(guò)調(diào)整培養(yǎng)基中碳源、氮源和無(wú)機(jī)鹽的比例,來(lái)優(yōu)化酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)和代謝途徑,從而實(shí)現(xiàn)更高的發(fā)酵效率和產(chǎn)物產(chǎn)量。
3、發(fā)酵工藝參數(shù)
在畢赤酵母發(fā)酵過(guò)程中,工藝參數(shù)的精確控制對(duì)于發(fā)酵的成功與否起著至關(guān)重要的作用,這些參數(shù)包括 pH、溫度、溶氧等,它們相互關(guān)聯(lián)、相互影響,共同決定了畢赤酵母的生長(zhǎng)狀況、代謝活性以及外源蛋白的表達(dá)水平。
pH值:是影響畢赤酵母發(fā)酵的關(guān)鍵因素之一。畢赤酵母在不同的生長(zhǎng)階段和代謝過(guò)程中,對(duì) pH 值的要求有所不同。在細(xì)胞生長(zhǎng)階段,一般適宜的 pH范圍為 5.0 - 6.0,在此 pH 條件下,酵母細(xì)胞能夠保持良好的生長(zhǎng)狀態(tài),酶的活性也能得到較好的發(fā)揮,有利于細(xì)胞的增殖和代謝產(chǎn)物的積累。pH值在畢赤酵母的發(fā)酵過(guò)程中,不僅會(huì)影響菌體的生長(zhǎng)狀態(tài),而且對(duì)外源蛋白的表達(dá)也會(huì)產(chǎn)生重要影響。pH值對(duì)畢赤酵母的影響主要包括以下方面:(1)影響細(xì)胞內(nèi)酶的活性,進(jìn)而影響細(xì)胞的新陳代謝,從而使外源蛋白的表達(dá)也受到影響;(2)影響細(xì)胞膜的通透性,對(duì)細(xì)胞吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和排出代謝產(chǎn)物時(shí)產(chǎn)生一定的影響;(3)pH值會(huì)對(duì)培養(yǎng)基中成分和細(xì)胞的代謝產(chǎn)物的離解產(chǎn)生影響,從而對(duì)細(xì)胞吸收營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)造成影響;(4)pH值也可能對(duì)細(xì)胞的代謝過(guò)程產(chǎn)生影響,使細(xì)胞代謝產(chǎn)物的含量發(fā)生改變另外,在高密度發(fā)酵過(guò)程中,為了減少外源蛋白被蛋白酶降解,應(yīng)避開(kāi)蛋白酶作用的最適pH值,將pH 值設(shè)定在偏離外源蛋白等電點(diǎn)處,也會(huì)提高外源蛋 白的收獲率。
溫度:對(duì)畢赤酵母的生長(zhǎng)和代謝也具有顯著影響。畢赤酵母的生長(zhǎng)溫度一般在 28 - 30℃之間較為適宜。在這個(gè)溫度范圍內(nèi),酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)速度較快,代謝活動(dòng)旺盛,能夠高效地利用培養(yǎng)基中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)行生長(zhǎng)和繁殖。然而,如果溫度過(guò)高,超過(guò) 32℃,可能會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞死亡,因?yàn)楦邷貢?huì)破壞細(xì)胞的膜結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)和核酸等生物大分子的穩(wěn)定性,從而影響細(xì)胞的正常生理功能。相反,在較低的溫度下,雖然細(xì)胞的生長(zhǎng)速度會(huì)減慢,但一些研究表明,適當(dāng)降低培養(yǎng)溫度可以改善靶蛋白的產(chǎn)量和質(zhì)量。這是因?yàn)榈蜏乜梢越档图?xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)折疊的應(yīng)力,減少錯(cuò)誤折疊的發(fā)生,同時(shí)也能減少蛋白酶的活性,降低外源蛋白的水解程度,從而有利于外源蛋白的正確折疊和積累。
溶氧(DO):是畢赤酵母發(fā)酵過(guò)程中另一個(gè)關(guān)鍵的工藝參數(shù)。畢赤酵母在利用甘油和甲醇進(jìn)行生長(zhǎng)和代謝時(shí)都需要氧氣的參與,因此維持合適的溶氧水平對(duì)于確保發(fā)酵的順利進(jìn)行至關(guān)重要。在整個(gè)發(fā)酵過(guò)程中,通常需要將溶氧濃度維持在>20% 的水平。在細(xì)胞生長(zhǎng)初期,由于菌體數(shù)量較少,對(duì)氧氣的需求相對(duì)較低,此時(shí)通過(guò)適當(dāng)?shù)耐夂蛿嚢杓纯蓾M(mǎn)足細(xì)胞的溶氧需求。隨著細(xì)胞的生長(zhǎng)和代謝活動(dòng)的增強(qiáng),對(duì)氧氣的消耗逐漸增加,此時(shí)需要進(jìn)一步調(diào)整通氣量、攪拌速度或采用純氧補(bǔ)充等方式來(lái)提高溶氧水平,以保證細(xì)胞能夠獲得足夠的氧氣進(jìn)行代謝。如果溶氧不足,可能會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞生長(zhǎng)緩慢、代謝產(chǎn)物積累減少,甚至?xí)鸺?xì)胞死亡,從而嚴(yán)重影響發(fā)酵的效率和產(chǎn)物的產(chǎn)量。
培養(yǎng)時(shí)間:是在畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)中獲得最高蛋白表達(dá)水平的最關(guān)鍵因素之一,在畢赤酵母表達(dá)系 統(tǒng)中,生產(chǎn)時(shí)間相對(duì)較長(zhǎng)(約100h)。培養(yǎng)時(shí)間與 酵母細(xì)胞的數(shù)量和目標(biāo)蛋白的降解程度有關(guān),有研 究表明,巴斯德畢赤酵母細(xì)胞的最高生長(zhǎng)密度是培 養(yǎng)96h,而最高蛋白表達(dá)發(fā)生在48h[11],這表明 較長(zhǎng)的培養(yǎng)時(shí)間很可能會(huì)導(dǎo)致所表達(dá)蛋白被水解消 化,也有其他的研究表明最佳蛋白質(zhì)表達(dá)時(shí)間發(fā)生 在培養(yǎng)72~96 h[2
畢赤酵母發(fā)酵工藝是一個(gè)復(fù)雜而精細(xì)的過(guò)程,需要對(duì)發(fā)酵階段、培養(yǎng)基配方和工藝參數(shù)進(jìn)行精確的控制和優(yōu)化,可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(DOE)方法,系統(tǒng)地優(yōu)化發(fā)酵條件,如pH、溫度、溶氧和培養(yǎng)基組成以充分發(fā)揮畢赤酵母的優(yōu)勢(shì),實(shí)現(xiàn)外源蛋白的高效表達(dá)和生產(chǎn)。通過(guò)深入了解畢赤酵母的發(fā)酵特性和需求,結(jié)合先進(jìn)的發(fā)酵技術(shù)和設(shè)備,不斷優(yōu)化發(fā)酵工藝,有望進(jìn)一步提高畢赤酵母發(fā)酵的效率和產(chǎn)物質(zhì)量。
四、畢赤酵母與發(fā)酵罐的 “默契配合”
在畢赤酵母的發(fā)酵過(guò)程中,發(fā)酵罐作為核心設(shè)備,為畢赤酵母的生長(zhǎng)和代謝提供了關(guān)鍵的環(huán)境條件,確保其能夠高效表達(dá)外源蛋白。
發(fā)酵罐通過(guò)精確的溫度控制系統(tǒng),為畢赤酵母提供適宜的生長(zhǎng)溫度。如前所述,畢赤酵母在 28 - 30℃的生長(zhǎng)階段以及在誘導(dǎo)表達(dá)階段對(duì)溫度的特定要求,發(fā)酵罐的溫控系統(tǒng)能夠精準(zhǔn)地維持在這些設(shè)定溫度范圍內(nèi),避免溫度過(guò)高或過(guò)低對(duì)酵母細(xì)胞生長(zhǎng)和蛋白表達(dá)的不利影響。在大規(guī)模發(fā)酵生產(chǎn)中,這種精確的溫度控制尤為重要,它保證了每一批次的畢赤酵母都能在穩(wěn)定且適宜的溫度環(huán)境下生長(zhǎng),從而提高了生產(chǎn)的穩(wěn)定性和重復(fù)性。
對(duì)于 pH 值的調(diào)控,發(fā)酵罐配備了先進(jìn)的 pH 檢測(cè)和調(diào)節(jié)裝置。在畢赤酵母發(fā)酵的不同階段,根據(jù)其對(duì) pH 值的需求變化,發(fā)酵罐能夠自動(dòng)添加酸堿溶液,將 pH 值精確維持在所需范圍內(nèi)。在細(xì)胞生長(zhǎng)階段保持 pH 5.0 - 6.0,誘導(dǎo)表達(dá)階段調(diào)整到 3.0 - 5.0,這種精準(zhǔn)的 pH 控制有助于維持酵母細(xì)胞內(nèi)酶的活性,促進(jìn)細(xì)胞的正常生長(zhǎng)和代謝,同時(shí)減少外源蛋白的降解,提高蛋白的產(chǎn)量和質(zhì)量。
溶氧水平的控制也是發(fā)酵罐的關(guān)鍵功能之一。畢赤酵母在發(fā)酵過(guò)程中對(duì)溶氧需求較高,發(fā)酵罐通過(guò)合理的通氣系統(tǒng)和攪拌裝置,確保溶氧濃度始終維持在>20% 的水平。通氣系統(tǒng)能夠向發(fā)酵液中均勻地通入空氣或氧氣,而攪拌裝置則通過(guò)不斷攪拌,使氧氣在發(fā)酵液中充分分散,提高氧氣的傳遞效率,滿(mǎn)足畢赤酵母在不同生長(zhǎng)階段對(duì)氧氣的需求,保證其代謝活動(dòng)的正常進(jìn)行,進(jìn)而促進(jìn)外源蛋白的高效表達(dá)。
攪拌和通氣系統(tǒng)的協(xié)同作用還能保證發(fā)酵液中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)均勻分布,避免出現(xiàn)局部營(yíng)養(yǎng)缺乏或過(guò)剩的情況,使每一個(gè)畢赤酵母細(xì)胞都能在良好的營(yíng)養(yǎng)環(huán)境下生長(zhǎng)。同時(shí),發(fā)酵罐的密封性能也十分重要,它能夠防止外界雜菌的污染,確保畢赤酵母發(fā)酵過(guò)程的純凈性和穩(wěn)定性,避免因染菌而導(dǎo)致的發(fā)酵失敗或產(chǎn)物質(zhì)量下降等問(wèn)題。
錦維生工的發(fā)酵罐產(chǎn)品正是基于這些關(guān)鍵需求進(jìn)行設(shè)計(jì)和制造的,擁有先進(jìn)的溫度控制、pH 調(diào)節(jié)、溶氧控制以及高效的攪拌和通氣系統(tǒng),能夠?yàn)楫叧嘟湍傅陌l(fā)酵提供優(yōu)化的環(huán)境條件,幫助用戶(hù)實(shí)現(xiàn)高效、穩(wěn)定的畢赤酵母發(fā)酵生產(chǎn),無(wú)論是在實(shí)驗(yàn)室小試階段還是工業(yè)大規(guī)模生產(chǎn)中,都能發(fā)揮出的性能,滿(mǎn)足不同用戶(hù)對(duì)畢赤酵母發(fā)酵的各種需求,助力生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的蓬勃發(fā)展。我們將持續(xù)關(guān)注畢赤酵母的研究動(dòng)態(tài)和應(yīng)用需求,不斷優(yōu)化和創(chuàng)新發(fā)酵罐的設(shè)計(jì)與制造技術(shù),提升發(fā)酵罐的性能和穩(wěn)定性,為畢赤酵母的發(fā)酵生產(chǎn)提供更加先進(jìn)、高效的設(shè)備支持,共同推動(dòng)生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)邁向更加輝煌的未來(lái)。
錦維生工發(fā)酵罐介紹
Jimway-be® Lab系列 ------ 桌面級(jí)反應(yīng)器
Jimway-be® PM系列 ------多聯(lián)生物反應(yīng)器
適用場(chǎng)合:原核/真核細(xì)胞的培養(yǎng)和發(fā)酵和表達(dá)
培養(yǎng)皿容積: 250ml/500ml/1L/3L/5L/10L
單元數(shù)量: 2-16聯(lián)
培養(yǎng)方式: 懸浮&貼壁
槳葉類(lèi)型: 三斜葉、六斜葉、六平葉、半管式、提升槳等多種組合
傳動(dòng)方式:磁力耦合驅(qū)動(dòng)/機(jī)械攪拌
控制策略:PID&階梯式控制策略(補(bǔ)料、攪拌轉(zhuǎn)速、溫度、通氣等)
補(bǔ)料控制:精確補(bǔ)料控制(誤差±1g)
功能特點(diǎn):
界面簡(jiǎn)潔:幾分鐘掌握操作,事半功倍
無(wú)人值守:可遠(yuǎn)程訪問(wèn)、操作,實(shí)現(xiàn)無(wú)人值守
配方功能:配方一鍵下發(fā),減少人員操作失誤,提高品質(zhì)
數(shù)據(jù)分析:實(shí)現(xiàn)多批次數(shù)據(jù)對(duì)比,也可外接Doe&PAT實(shí)現(xiàn)深度多變量分析,優(yōu)化工藝數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)分享:基于VPN的WEB發(fā)布,在保證數(shù)據(jù)安全和設(shè)備安全的情況下,實(shí)現(xiàn)移動(dòng)端(Android、IOS、Windows)的監(jiān)控和歷史曲線查看
相關(guān)產(chǎn)品
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